See download stats for:    Bioconductor software packages    Bioconductor annotation packages    Bioconductor experiment packages

Download stats for Bioconductor workflow packages

This page was generated on 2024-01-12 14:15:56 -0500 (Fri, 12 Jan 2024).

The number reported next to each package name is the download score, that is, the average number of distinct IPs that “hit” the package each month for the last 12 months (not counting the current month).

All workflow package stats in one file: workflows_pkg_stats.tab

All workflow package download scores in one file: workflows_pkg_scores.tab

See Download stats for Bioconductor workflow repository (all packages combined)

ABAData (1)
abc (1)
abind (1)
acepack (1)
ada (1)
ade4 (3)
adegraphics (1)
adephylo (1)
aditools (0)
admiral (1)
admiral.test (1)
admiraldev (1)
admisc (22)
affy (1)
affyio (1)
AGHmatrix (1)
AICcmodavg (1)
airr (1)
akima (1)
alakazam (1)
ALDEx2 (1)
alembic (1)
AlgDesign (1)
alkahest.generic (1)
ALL (1)
almanac (1)
alphashape3d (1)
AMARETTO (1)
amgen.okta.client (0)
amgsafetyvis (1)
amlogger (1)
ANCOMBC (1)
animation (2)
anndata (1)
annotate (2)
annotation (65)
AnnotationDbi (14)
AnnotationFilter (1)
AnnotationForge (1)
AnnotationHub (1)
annotatr (1)
anRichment (1)
anticlust (1)
AnVIL (0)
apcluster (1)
ape (6)
apeglm (1)
apex (1)
apexcharter (1)
aplot (14)
appgen (1)
archive (1)
argparse (1)
argus.DS.Credentials (1)
argusDS.apc.utils (1)
argusDS.backtesting.engine (1)
argusDS.data (1)
argusDS.data.engineering (1)
argusDS.data.preparation (1)
argusDS.data.preparation2 (2)
argusDS.DataValidation (1)
argusDS.DB.manager.utilities (1)
argusDS.driver.importance (1)
argusDS.FCUtilities (1)
argusDS.FZ.SourceData (1)
argusDS.FZ.utils (1)
argusDS.gamlss.distributions (1)
argusDS.gamlss.forecast (2)
argusDS.gamlss.modelling (2)
argusDS.gamlss.testing (1)
argusDS.gamlss.utils (1)
argusDS.GlobalSettings (1)
argusDS.model.testing (1)
argusDS.model.tools (1)
argusDS.modeldb (1)
argusDS.possibility.curves.daily (1)
argusDS.PossibilityCurves.db.utils (1)
argusDS.PossibilityCurves.utils (1)
argusDS.shiny.utils (1)
argusDS.spread.trading.utils (2)
argusDS.Studio.APC (1)
argusDS.Studio.FC (1)
argusDS.Studio.MyStudio (2)
argusDS.Studio.permissions (1)
argusDS.Studio.utils (1)
argusDS.tabulator (1)
argusDS.trading.performance (1)
argusDS.TradingSignals (1)
argusDS.utilities (1)
arm (1)
ArrayExpress (1)
arrayop (1)
arrays (35)
arrow (5)
arsenal (1)
arules (21)
ArvadosR (1)
asciicast (0)
ash (1)
ashr (2)
AsioHeaders (3)
askpass (72)
assertive.code (1)
assertive.properties (7)
assertive.types (7)
assertr (1)
assertthat (1)
ATACseqQC (1)
attachment (3)
AUCell (1)
audio (1)
av (1)
aws (1)
aws.s3 (1)
aws.signature (0)
azcore (1)
AzureGraph (1)
AzureRMR (2)
babelgene (1)
babelmixr2 (1)
babelwhale (1)
backbone (1)
backports (13)
badger (1)
bambu (1)
base64 (1)
base64enc (1)
BASiCS (1)
basilisk (1)
batchelor (1)
BatchJobs (1)
batchtools (1)
BayesFactor (1)
bayesm (5)
bayesplot (1)
bayestestR (1)
baySeq (5)
BBmisc (1)
bbmle (1)
bbotk (1)
bbr (1)
bbr.bayes (1)
bdsmatrix (1)
beachmat (2)
beadarray (1)
beanplot (1)
beeswarm (1)
bench (1)
benchmarkme (0)
berryFunctions (1)
bestNormalize (1)
betareg (1)
BgeeCall (1)
BgeeDB (1)
BH (35)
BIApylon (1)
BiasedUrn (2)
BIAutils (1)
bibtex (1)
biclust (1)
bigassertr (1)
bigD (0)
BIGL (1)
bigmemory (1)
bigmemory.sri (1)
bigreadr (0)
bigrquery (3)
billboarder (5)
binr (0)
bio3d (1)
biobank (1)
Biobase (5)
bioc::GenomeInfoDbData (1)
BiocBaseUtils (1)
BiocCheck (1)
BiocFileCache (2)
BiocGenerics (20)
BiocInstaller (0)
BiocIO (1)
BiocManager (109)
BiocMetaWorkflow (21)
biocmetaworkflow (1)
BiocNeighbors (1)
Bioconductor (1)
BiocParallel (8)
BiocSingular (1)
BiocStyle (1)
BiocVersion (29)
biocViews (1)
Biogenerics (1)
BioGenerics (1)
biomaRt (2)
biomartr (1)
biomformat (1)
biostatR (1)
biostatUtil (0)
Biostrings (5)
BioVersion (1)
biovizBase (1)
bit (32)
bit64 (8)
bitops (8)
bizdays (1)
blastula (1)
blob (89)
blockcluster (1)
blockForest (1)
blockmodeling (1)
blogdown (1)
BMisc (1)
bnlearn (1)
bold (1)
bookdown (12)
boot (37)
box (4)
BP4RNAseq (20)
bp4rnaseq (1)
brew (9)
brglm2 (1)
brio (8)
brms (1)
Brobdingnag (1)
broom (90)
broom.helpers (2)
BrowserViz (1)
bs4Dash (6)
BSgenome (1)
BSgenome.Drerio.UCSC.danRer11 (1)
BSgenome.Ggallus.ENSEMBL.galGal6 (1)
BSgenome.Hsapiens.1000genomes.hs37d5 (1)
BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38 (1)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 (1)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38 (1)
BSgenome.Mmul10.SIVmac251 (1)
BSgenome.Mmulatta.NCBI.mmul10.tmp (1)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm39 (1)
BSgenome.Omela.CUSTOM.oenMel1.1 (1)
BSgenomes (1)
bsicons (1)
bslib (144)
bsplus (1)
btergm (1)
butcher (1)
BWStest (1)
C50 (1)
cachem (119)
CAGEWorkflow (19)
cageworkflow (1)
Cairo (15)
callr (27)
CAM (1)
CAMERA (1)
campsis (1)
campsismod (1)
candisc (1)
canvasXpress (1)
caper (1)
capsidr (1)
capushe (1)
car (51)
carData (2)
caret (46)
castor (1)
catboost (1)
caTools (3)
cba (1)
CBPS (1)
ccaPP (1)
ccdrAlgorithm (1)
cdip.datastore (1)
celda (1)
celldex (1)
cellranger (1)
cem (1)
CeTF (1)
cgdsr (1)
ChAMP (1)
changepoint (0)
checkmate (50)
checkr (1)
ChemmineOB (1)
ChemmineR (1)
chemometrics (1)
chimeraviz (1)
ChIPseeker (1)
chipseqDB (22)
chipseqdb (1)
chk (3)
chromote (4)
chron (2)
circlesize (1)
circlize (6)
Ckmeans.1d.dp (1)
class (75)
classInt (19)
cli (138)
CLIFF (1)
clinfun (1)
ClinicalQc (1)
clinPK (0)
ClinViz (1)
clipr (6)
clock (24)
clue (20)
cluster (72)
clusterCrit (1)
clusterGeneration (3)
clustermq (3)
clusterprofielr (0)
clusterProfiler (3)
ClusterR (1)
clusterSim (1)
clustree (1)
clValid (1)
cmdstanr (1)
CMplot (1)
cmprsk (1)
CmsAnalytics (1)
CNEr (1)
cobalt (1)
coda (2)
coda.base (1)
codetools (43)
coin (1)
collapse (1)
collections (1)
colorRamps (1)
colorspace (50)
colortools (1)
colourpicker (5)
colourvalues (1)
common (1)
commonmark (32)
compareDF (1)
compareGroups (1)
ComplexHeatmap (2)
complexheatmap (1)
compositions (2)
condiments (1)
config (8)
confintr (1)
conflicted (2)
connectwidgets (1)
conquer (2)
consort (1)
contentid (1)
copula (1)
coro (0)
corpcor (1)
corpora (1)
corrplot (2)
corrr (1)
COSG (1)
cosmosR (1)
countrycode (8)
coveffectsplot (1)
covr (18)
covRNA (1)
cowplot (6)
coxphf (1)
cplm (1)
cpp11 (110)
crayon (52)
credentials (10)
crew (1)
CRISPR.shinyapp (1)
crossmatch (1)
crosstable (1)
crosstalk (40)
crul (6)
csawUsersGuide (17)
csawusersguide (1)
csv (0)
cubature (1)
cubelyr (0)
Cubist (1)
curatedMetagenomicData (0)
curl (173)
cvAUC (1)
cvms (1)
CVST (0)
cxAnalysis (0)
cyclocomp (7)
cytofWorkflow (76)
cytofworkflow (1)
cytolib (0)
CytoTRACE (1)
D2C (1)
d3r (1)
dada2 (1)
DAISIE (1)
dasnormalize.iomel (1)
dastools (1)
data.table (57)
data.tree (5)
DatabaseConnector (1)
datamods (5)
DataOmnio (1)
datapasta (1)
datawizard (2)
dbaccess (1)
dbarts (1)
DBI (34)
DBItest (0)
dbplyr (96)
dbscan (3)
dbx (3)
dcdatr (1)
ddalpha (0)
DDCompanion (1)
DECIPHER (1)
decor (1)
decoupleR (1)
deepregression (1)
Delaporte (1)
DelayedArray (3)
DelayedMatrixStats (1)
deldir (30)
dendextend (57)
densEstBayes (1)
densvis (1)
DEoptim (0)
DEoptimR (11)
DEP (1)
desc (40)
descr (1)
DescTools (9)
DESeq (1)
DESeq2 (3)
designmatch (1)
DEsingle (1)
deSolve (48)
devtools (6)
DEXSeq (1)
dfidx (0)
dfoptim (1)
DHARMa (0)
DiagrammeR (3)
dials (1)
DiceDesign (1)
diceR (1)
dichromat (5)
did (1)
DiffBind (1)
diffloop (1)
diffobj (8)
digest (120)
dimRed (0)
diptest (1)
directlabels (1)
DirichletMultinomial (1)
disk.frame (1)
distances (1)
distill (1)
distr (1)
distr6 (1)
distributional (1)
DistributionUtils (1)
dittodb (1)
dittoSeq (1)
dlookr (1)
dlstats (1)
dm (1)
DMRcate (0)
DNAcopy (1)
DO.db (1)
doBy (1)
dockerfiler (1)
DoE.base (1)
doFuture (1)
doMC (1)
doParallel (4)
doRNG (2)
dorothea (1)
DOSE (2)
Dose (1)
DoseFinding (1)
doSNOW (1)
dotCall64 (4)
DoubletFinder (1)
downlit (10)
downloadthis (1)
dparser (1)
dplyr (178)
dplyrb (1)
dqrng (10)
drake (6)
drat (1)
DRDID (1)
dreamerr (1)
DropletUtils (1)
DRR (0)
dspNgs (1)
DT (104)
dtplyr (44)
dttr2 (1)
dtw (0)
dtwclust (1)
duckdb (2)
duct.tape (1)
dynfeature (1)
dynplot (1)
dynwrap (1)
e1071 (17)
earth (1)
easyENTIM (0)
ebal (1)
EBImage (1)
echarts4r (8)
ecodist (1)
ECOSolveR (1)
edgeR (2)
effectsize (2)
EGSEA123 (16)
egsea123 (1)
eha (1)
elasticsearchr (1)
ellipse (52)
ellipsis (8)
emayili (1)
embed (1)
EMD (1)
emdbook (1)
emdist (1)
emmeans (70)
engitix.singlecell.db (1)
engitomixmk2 (1)
english (1)
EnhancedVolcano (1)
enrichplot (2)
enrichR (2)
EnsDb.Hsapiens.v75 (1)
ensembldb (1)
entropy (1)
EnvStats (1)
Epi (1)
epiR (2)
EpiStats (1)
eQTL (2)
ergm (0)
escape (1)
esquisse (0)
estimability (1)
eulerr (1)
europepmc (1)
evaluate (156)
EValue (1)
evd (0)
ewfutils (1)
Exact (1)
exactextractr (1)
exactRankTests (1)
ExpHunterSuite (18)
exphuntersuite (1)
ExploreModelMatrix (0)
ExplorOMICS (1)
expm (11)
ExpressionNormalizationWorkflow (29)
expressionnormalizationworkflow (1)
expss (5)
extraChIPs (1)
extraDistr (1)
extrafont (2)
fabletools (1)
factoextra (1)
FactoMineR (49)
fakepackage (1)
fansi (117)
farver (27)
fastcluster (1)
fastDummies (17)
fasterize (1)
fastICA (2)
fastmap (53)
fastmatch (16)
fastmatrix (1)
fastshap (1)
fauxpas (1)
fBasics (1)
FD (1)
fda (1)
fdrtool (2)
fenr (1)
fExtremes (0)
ff (2)
fftwtools (1)
fGarch (1)
fgsea (1)
fields (3)
filehash (1)
filelock (6)
filesstrings (1)
finalfit (1)
findpython (1)
fitdistrplus (18)
fixest (1)
flair (1)
flexclust (0)
flexdashboard (2)
flexmix (1)
flexsurv (1)
flextable (9)
float (1)
flowAI (1)
flowClust (1)
FlowCore (1)
flower (0)
flowWorkspace (1)
flowWorkspaceData (0)
fluentGenomics (20)
fluentgenomics (1)
flux (1)
FME (1)
fmtr (1)
FNN (16)
foghorn (0)
fontawesome (73)
forcats (9)
foreach (6)
forecast (3)
foreign (30)
forestplot (1)
forestploter (1)
fork (1)
formatR (39)
formatters (1)
Formula (7)
forrester.metadata (0)
fpc (1)
fracdiff (1)
FragPipeAnalystR (1)
fresh (1)
FrF2 (1)
fs (132)
fstcore (1)
furrr (8)
futile.logger (1)
futile.options (1)
future (81)
future.apply (38)
future.batchtools (1)
future.callr (3)
g3viz (1)
GA (0)
gam (1)
gamboostLSS (1)
gamlss (2)
gamlss.dist (2)
gamm4 (1)
gap (1)
gap.datasets (1)
gapminder (1)
gargle (67)
gaston (1)
gbm (1)
gbRd (1)
gdata (6)
gdtools (10)
gee (1)
geepack (1)
genefilter (1)
genefu (0)
GeneralizedHyperbolic (1)
generegulation (22)
generics (30)
GenomeInfoDb (7)
GenomeInfoDbData (3)
GenomicAlignments (2)
GenomicFeatures (1)
GenomicRanges (2)
GenomicTools (1)
GenSA (1)
geodata (1)
geodiv (1)
geohashTools (1)
geojson (1)
geojsonio (1)
geojsonsf (1)
geometries (5)
geometry (1)
geomorph (1)
GeomxTools (0)
GeoMxWorkflows (143)
geomxworkflows (1)
GEOquery (1)
geosphere (1)
gert (19)
gestalt (4)
getip (1)
getopt (2)
GetoptLong (2)
getPass (0)
gettz (0)
gfonts (1)
ggalluvial (1)
GGally (4)
gganimate (0)
ggbeeswarm (16)
ggbreak (1)
ggcorrplot (1)
ggdag (1)
ggdendro (1)
ggdist (1)
ggeasy (1)
ggeffects (2)
ggExtra (1)
ggfittext (1)
ggforce (5)
ggformula (12)
ggfortify (1)
ggfun (14)
gggenes (1)
ggh4x (1)
gghalves (1)
gghighlight (0)
ggimage (1)
gginnards (1)
ggiraph (1)
ggmap (43)
ggnetwork (1)
ggnewscale (9)
ggnewscales (1)
ggplot (1)
ggplot2 (164)
ggplotify (15)
ggpmisc (3)
ggPMX (0)
ggpp (4)
ggprism (1)
ggpubr (7)
ggRandomForests (0)
ggraph (4)
ggrastr (5)
ggrepel (67)
ggridges (17)
ggsci (49)
ggseqlogo (1)
ggsignif (6)
ggstance (1)
ggstats (1)
ggstatsplot (1)
ggtext (1)
ggthemes (2)
ggtree (3)
ggvenn (1)
ggVennDiagram (1)
gh (7)
gifski (1)
git2r (3)
gitcreds (5)
gitlabr (1)
gittargets (1)
GLAD (1)
glassoFast (1)
glca (1)
gld (1)
glmGamPoi (1)
glmmADMB (0)
glmmTMB (2)
glmnet (7)
glmnetUtils (1)
GlobalOptions (0)
globals (16)
glue (14)
gmailr (1)
GMD (0)
Gmisc (1)
gmm (1)
gmodels (1)
gmp (3)
gnm (1)
GO.db (2)
goftest (12)
golem (3)
gongs (1)
googleAuthR (1)
googleCloudStorageR (1)
googledrive (60)
googlesheets4 (64)
googleVis (1)
GOSemSim (1)
goshawk (1)
gower (2)
GPArotation (44)
gplots (17)
gprofiler2 (1)
gRain (1)
graph (1)
graphlayouts (19)
graphql (1)
gRbase (1)
greybox (1)
gridExtra (1)
gridGraphics (1)
gridSVG (1)
gridtext (1)
grImport (1)
grImport2 (1)
groupdata2 (1)
gsDesign (1)
GSEABase (1)
gsl (2)
gson (2)
gss (2)
GSVA (1)
GSVAdata (1)
gt (3)
gtable (135)
gtools (27)
gtsummary (3)
gubraqsar (1)
GUniFrac (2)
gupio (1)
Gviz (1)
gwasrapidd (1)
GWENA (1)
gWidgets (1)
gWidgets2tcltk (0)
gWidgetstcltk (1)
h2o (2)
HandTill2001 (1)
hardhat (46)
HardyWeinberg (1)
harmony (4)
hash (2)
haven (49)
HDF5Array (1)
hdf5r (2)
HDInterval (0)
HDO.db (1)
heatmaply (5)
heemod (1)
heplots (1)
here (1)
Herper (1)
hexbin (3)
hgu95a.db (1)
HiClimR (1)
highlight (1)
highr (17)
highthroughputassays (22)
Hmisc (18)
hms (80)
Homo.sapiens (0)
Hoover (1)
HSAUR2 (1)
hsm (1)
htmlTable (13)
htmltools (176)
htmlwidgets (130)
HTqPCR (1)
httpcode (1)
httpgd (1)
httptest (6)
httput (1)
httpuv (120)
httr (145)
httr2 (39)
hunspell (2)
huxtable (1)
hwriter (2)
IAPWS95 (1)
iatlas.app (1)
ica (14)
ICS (1)
ICSNP (1)
idr (0)
ids (1)
igraph (59)
igvShiny (1)
iheatmapr (3)
ijtiff (1)
IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19 (1)
imager (1)
imcRtools (0)
iml (0)
import (1)
ImpulseDE2 (1)
impute (1)
imputeLCMD (1)
imputeTS (1)
IncidencePrevalence (1)
infer (1)
influenceR (3)
infotheo (1)
InkblotAnalytics (21)
INLA (0)
inline (1)
inlinedocs (1)
insight (3)
intamap (1)
intergraph (1)
interp (6)
intervals (1)
inum (2)
ipaddress (1)
ipred (45)
iq (1)
IRanges (6)
IRkernel (0)
irlba (19)
irr (1)
isoband (46)
iterators (6)
JADE (1)
janeaustenr (1)
janitor (3)
jcolors (1)
JM (0)
jnjtemplates (1)
joineRML (1)
jomo (1)
jose (0)
jpeg (8)
jqr (5)
jquerylib (1)
jsonify (1)
jsonlite (149)
jsTreeR (1)
jtools (1)
juicyjuice (0)
JuliaCall (0)
kableExtra (1)
KEGG.db (1)
KEGGREST (5)
keggsvg (1)
keras (5)
kernlab (2)
KernSmooth (40)
keyring (1)
khroma (1)
klaR (1)
km.ci (1)
kmed (1)
knitr (135)
kohonen (1)
ks (3)
kSamples (1)
labeling (70)
labelled (2)
Lahman (1)
lambda.r (1)
lambdr (1)
LambertW (1)
lamW (2)
landscapemetrics (1)
languageserver (1)
lares (1)
lasso2 (1)
lastdose (1)
later (103)
latex2exp (1)
lattice (88)
latticeExtra (7)
lava (12)
lavaan (44)
lazyeval (1)
lbfgs (0)
lbfgsb3c (1)
ldap (1)
LDlinkR (1)
LDplots (1)
leafem (1)
leaflet (3)
leaflet.providers (1)
leaps (1)
learnr (2)
leiden (17)
leidenAlg (1)
leidenbase (7)
lemon (1)
lfe (1)
lgr (1)
lhs (0)
liana (1)
libcoin (2)
libr (1)
lifecycle (80)
liftOver (240)
liftover (1)
limma (80)
limmia (1)
limSolve (1)
linprog (1)
lintr (16)
listenv (16)
listviewer (1)
littler (1)
lm.beta (1)
lme4 (100)
lmom (8)
lmomco (1)
lmtest (14)
lobstr (1)
locfit (47)
log4r (1)
logger (1)
logistf (1)
logitnorm (1)
logr (1)
lokern (1)
loo (1)
LoomExperiment (1)
lotri (1)
lpSolve (8)
lpSolveAPI (1)
lpsymphony (1)
lsa (1)
lsei (1)
lubridate (41)
Luminescence (1)
lvec (1)
lwgeom (1)
m03modeldevelopment (1)
M3Drop (1)
maboost (1)
MACSr (1)
madness (1)
maEndToEnd (30)
MafDb.gnomAD.r2.1.hs37d5 (1)
magic (1)
magick (9)
magrittr (15)
maketools (12)
MALDIquant (1)
mapbayr (1)
mapdata (0)
mapplots (1)
mapproj (1)
maps (6)
maptools (6)
mapview (1)
Markdown (0)
markdown (40)
MASS (137)
MAST (1)
Matching (1)
MatchIt (2)
MatchThem (1)
mathjaxr (1)
Matrix (200)
Matrix.utils (7)
matrixcalc (0)
MatrixGenerics (2)
MatrixModels (54)
matrixStats (107)
matrixTests (1)
maxLik (1)
mboost (1)
mc2d (1)
mclogit (0)
mclust (7)
mcmc (1)
MCPcounter (0)
mcr (3)
mda (1)
memisc (1)
memoise (13)
MESS (1)
metabaser (1)
MetaboAnalystR (1)
metabolomics (1)
MetaboReport (1)
metafor (1)
metaMA (1)
metap (1)
methylationArrayAnalysis (110)
methylationarrayanalysis (1)
mets (1)
mFilter (1)
mgcv (147)
mgm (1)
mia (1)
mice (3)
microbenchmark (1)
microseq (1)
miloR (1)
mime (18)
mimosa (1)
miniUI (1)
minpack.lm (2)
minqa (43)
mirai (1)
mirt (14)
misc3d (1)
miscTools (1)
missMDA (1)
missRanger (1)
mitml (1)
mixOmics (1)
mixsqp (1)
mixtools (1)
mlbench (1)
mlfa (1)
mlflow (1)
mlpack (1)
mlr (0)
mlr3 (1)
mlr3learners (1)
mlr3measures (1)
mlr3misc (1)
mlr3pipelines (1)
mlr3proba (1)
mlr3tuning (1)
mmrm (16)
mnormt (3)
MNP (1)
mockery (1)
mockr (1)
modeldata (1)
modelenv (1)
ModelMetrics (1)
modelr (44)
modeltools (0)
MODIStsp (1)
modules (5)
MOFA2 (0)
moleculaR (1)
moments (1)
Momocs (1)
morpheus (0)
Morpho (1)
mosaicCore (12)
motifmatchr (1)
MPA (1)
mpm (1)
mpn.scorecard (1)
MPV (1)
mrgda (1)
mrggsave (1)
mrgmisc (1)
mrgsolve (1)
mrgvalidate (0)
mrgvalprep (0)
MsCoreUtils (1)
msdata (1)
MsFeatures (1)
msigdb (1)
msigdbr (1)
msm (2)
MSnbase (1)
MSstats (1)
MSstatsTMT (1)
MSstatsTMTs (1)
multcomp (2)
multcompView (44)
MultiAssayExperiment (1)
multicool (2)
multicross (1)
multiGSEA (1)
multipanelfigure (1)
multtest (1)
MuMIn (1)
munsell (1)
muscat (1)
MutationalPatterns (0)
mutoss (1)
mvnfast (1)
mvtnorm (61)
myphd (1)
mzR (1)
n1qn1 (0)
naniar (1)
nanonext (1)
NanoPyx (1)
NanoStringNCTools (1)
nanostringr (1)
nanotime (1)
narray (0)
nat.util (1)
nat.utils (1)
natserv (1)
nbpMatching (1)
ncar (1)
ncdf4 (4)
ncdfFlow (1)
NCmisc (1)
ndjson (0)
NEONiso (1)
neonUtilities (1)
nephro (1)
netmeta (1)
network (1)
networkDynamic (1)
ngsReports (1)
nhanesA (1)
nleqslv (1)
nlme (139)
nlmixr2 (1)
nlmixr2data (1)
nlmixr2est (1)
nlmixr2extra (0)
nlmixr2lib (1)
nlmixr2plot (0)
nloptr (56)
NMcalc (1)
NMdata (1)
NMF (2)
NMproject (0)
nmrec (1)
NMsim (1)
nnet (77)
NNLM (1)
nnls (2)
NonCompart (1)
nonmem2rx (1)
nonmemica (1)
nonnest2 (1)
nor1mix (1)
norm (2)
NormalizerDE (1)
npde (1)
npsurv (1)
numbers (1)
numDeriv (1)
odbc (12)
odyproteomicsValidator (1)
officedown (1)
officer (7)
oligo (1)
omicsbase (1)
OmnipathR (1)
ompr (1)
ompr.roi (1)
ontologyIndex (1)
openssl (174)
openxlsx (12)
optimx (10)
optmatch (1)
optparse (1)
orca (1)
ordinal (1)
org.Dm.eg.db (1)
org.Dr.eg.db (1)
org.Hs.eg.db (3)
org.Mm.eg.db (2)
org.Pf.plasmo.db (1)
org.Rn.eg.db (0)
org.Ss.eg.db (1)
orientlib (1)
orthogene (1)
osmdata (33)
osprey (1)
osqp (1)
packrat (34)
padr (0)
pagedown (1)
pak (2)
paletteer (0)
palmerpenguins (1)
palr (1)
pals (1)
pammtools (1)
pamr (1)
pan (1)
pander (2)
pandoc (1)
panelr (1)
paradox (1)
parallelly (73)
param6 (1)
parameters (3)
ParamHelpers (0)
parsedate (2)
parsnip (2)
partitions (0)
party (1)
partykit (2)
patchwork (32)
pathfindR.data (1)
pathview (1)
paws (7)
paws.analytics (7)
paws.application.integration (7)
paws.common (8)
paws.compute (7)
paws.cost.management (7)
paws.customer.engagement (7)
paws.database (7)
paws.developer.tools (1)
paws.end.user.computing (1)
paws.machine.learning (7)
paws.management (7)
paws.networking (7)
paws.security.identity (7)
paws.storage (7)
pbapply (35)
pbdZMQ (1)
pbkrest (1)
pbkrtest (62)
pbmcref.SeuratData (1)
pcaExplorer (0)
pcalg (1)
pcaMethods (1)
pcaPP (3)
pdftools (5)
pdist (0)
pec (1)
pegas (1)
PEIP (1)
PEMM (1)
Peptides (1)
performance (3)
PerformanceAnalytics (0)
periscope (1)
permute (2)
PFIM (1)
phangorn (2)
pharmaversesdtm (1)
pheatmap (1)
philentropy (2)
phonTools (1)
phosphoricons (4)
PhosR (0)
phyclust (1)
phyloseq (1)
phylosignal (1)
phytools (3)
picante (1)
pillar (117)
pinfsc50 (1)
pingr (4)
pins (35)
pixmap (1)
PK (1)
pkgbuild (21)
pkgcache (1)
pkgconfig (1)
pkgdepends (1)
pkgdown (2)
pkgKitten (1)
pkgload (80)
pkgmaker (1)
pkgsearch (1)
PKI (1)
PKNCA (1)
PKPDmodels (1)
plantecophys (1)
plm (1)
plogr (1)
plot3D (1)
plotgardener (1)
plotly (87)
plotmm (1)
plotrix (6)
plotROC (1)
pls (2)
plumber (0)
plyr (72)
pmartR (1)
PMCMRplus (1)
pmforest (1)
pmparams (1)
pmplots (1)
pmtables (1)
pmxTools (1)
png (30)
pointblank (1)
PoissonBinomial (1)
poLCA (1)
polspline (2)
polyclip (40)
polycor (1)
polynom (3)
pool (1)
poolfstat (1)
poorman (1)
PossibilityCurves (1)
posterior (1)
prabclus (1)
pracma (8)
praise (1)
preAnomalyDetectionCredLife (1)
PreciseSums (1)
precommit (0)
preprocessCore (1)
presto (1)
prettydoc (1)
prettyunits (60)
prioritylasso (1)
prismatic (0)
pROC (36)
processCore (1)
processx (129)
prodlim (51)
proffer (1)
profile (0)
profvis (5)
progress (12)
progressr (32)
PROJ (2)
proj4 (11)
projpred (1)
promise (1)
promises (53)
prompt (1)
propr (1)
proteomics (4)
ProtGenerics (1)
protolite (1)
proxy (2)
proxyC (1)
pryr (1)
ps (115)
pscl (1)
psych (50)
psychometric (2)
psychTools (1)
Publish (1)
PullReadAnalysisData (1)
purrr (86)
pvca (1)
qap (2)
qdapRegex (1)
qdapTools (1)
qgraph (2)
qlcMatrix (1)
qpdf (1)
qqconf (1)
qqman (1)
qqplotr (1)
qrcode (1)
qrnn (1)
qs (3)
qtl2 (1)
quadprog (1)
qualpalr (1)
quantable (1)
quantmod (7)
quantreg (66)
quarto (3)
questionr (1)
QuickJSR (1)
qvalue (1)
qvcalc (1)
qwraps2 (1)
r (1)
R.cache (1)
R.devices (1)
R.methodsS3 (11)
R.oo (11)
R.rsp (1)
R.utils (48)
r2rtf (1)
R6 (11)
rAccess (1)
ragg (42)
rainbow (1)
rAmCharts (1)
randomForest (2)
randomForestSRC (1)
randomizr (1)
randtoolbox (1)
ranger (7)
RankAggreg (1)
RApiDatetime (1)
RApiSerialize (2)
rappdirs (5)
rapportools (1)
raster (58)
RBesT (1)
rbibutils (22)
rbioapi (2)
rBLAST (1)
rcartocolor (1)
Rcgmin (1)
Rchoice (1)
RCircos (0)
RClickhouse (1)
rclipboard (2)
rcmdcheck (2)
RcmdrMisc (1)
RColorBrewer (11)
rcompanion (1)
Rcpp (117)
RcppAnnoy (21)
RcppArmadillo (145)
RcppCCTZ (1)
RcppDate (1)
RcppDE (0)
RcppEigen (61)
RcppGSL (2)
RcppHNSW (20)
RcppNumerical (1)
RcppParallel (4)
RcppProgress (1)
RcppSimdJson (1)
RcppSpdlog (1)
RcppThread (1)
RcppTOML (15)
Rcsdp (1)
RCurl (80)
RCy3 (1)
Rd2roxygen (0)
RDCOMClient (0)
rdflib (1)
Rdpack (23)
reactable (2)
reactlog (0)
reactome.db (1)
ReactomeGSA (1)
ReactomePA (1)
reactR (6)
readODS (1)
readr (13)
readstata13 (1)
readxl (53)
REBayes (1)
recipes (43)
reclin (1)
recommenderlab (7)
recosystem (12)
recountWorkflow (21)
recountworkflow (1)
reda (0)
REddyProc (1)
refinr (0)
RefManageR (1)
registry (1)
relations (1)
reldist (1)
remaCor (1)
rematch (36)
rematch2 (0)
remotes (24)
rentrez (1)
renv (129)
reporter (1)
reporting (0)
repr (1)
reprex (4)
repurrrsive (0)
reshape (2)
reshape2 (2)
ResidualMatrix (1)
restfulr (9)
RestRserve (7)
reticulate (27)
revealgenomics (1)
RevGadgets (1)
review (1)
rex (8)
Rfast (3)
Rfit (1)
rgbif (1)
RGCCA (1)
rgdal (7)
rgeos (13)
rgexf (1)
rgl (2)
Rglpk (1)
rgnparser (1)
RgoogleMaps (2)
Rgraphviz (0)
rhandsontable (1)
rhdf5 (2)
rhdf5filters (1)
Rhdf5lib (3)
rhino (4)
RhpcBLASctl (7)
Rhtslib (1)
rhub (1)
rice (1)
ridigbio (1)
rintrojs (3)
rio (6)
RIPSeeker (1)
riskmetric (1)
riskRegression (1)
ritis (1)
RItools (1)
riverplot (1)
rjags (1)
rJava (2)
RJDBC (1)
rjson (5)
rjsoncons (1)
RJSONIO (14)
rlang (180)
rlecuyer (1)
rlemon (1)
rliger (1)
Rmagic (1)
RMariaDB (2)
rmarkdown (158)
rmdformats (1)
rMisbeta (1)
Rmisc (1)
Rmpfr (1)
Rmpi (1)
rms (2)
rmsb (1)
RMTstat (1)
rmutil (0)
rMVP (1)
RMySQL (2)
RNAi (1)
RNAseq123 (125)
rnaseq123 (1)
rnaseqDTU (37)
rnaseqdtu (1)
rnaseqGene (158)
rnaseqgene (1)
RnaSeqGeneEdgeRQL (112)
rnaseqgeneedgerql (1)
rnaturalearth (1)
rncl (1)
RNeXML (1)
rngtools (1)
rngWELL (1)
RNOmni (1)
robfilter (1)
robust (1)
robustbase (8)
RobustRankAggreg (0)
ROC (1)
ROCR (1)
RODBC (1)
ROI (1)
ROI.plugin.lpsolve (1)
rols (1)
Rook (1)
rootSolve (8)
ropls (1)
rotl (1)
roxygen2 (6)
rpart (75)
rpart.plot (1)
RPMG (1)
RPostgres (6)
RPostgreSQL (1)
rprojroot (59)
RProtoBufLib (1)
rpsftm (1)
rrapply (1)
rrcov (2)
rredlist (1)
RRPP (1)
rsample (10)
Rsamtools (2)
RSclient (1)
rsconnect (68)
RSEIS (1)
RSelenium (1)
Rserve (7)
RSiena (1)
Rsmlx (1)
rsnps (1)
RSpectra (14)
RSQLite (115)
RsSimulx (1)
rstan (1)
rstanarm (1)
rstantools (1)
rstatix (6)
rstpm2 (1)
rstudioapi (70)
rsvd (2)
rsvg (2)
rtables (1)
rticles (1)
rtkore (1)
rtracklayer (1)
Rtsne (10)
Rttf2pt1 (2)
rtweet (4)
rugarch (1)
runjags (1)
Runuran (1)
RUVseq (1)
RVAideMemoire (1)
Rvcg (1)
rvcheck (2)
rversions (5)
rvest (5)
rvg (1)
Rvmmin (1)
Rwave (0)
rworldmap (1)
rxode2 (1)
rxode2et (1)
rxode2ll (1)
rxode2parse (1)
rxode2random (1)
rzmq (2)
s2 (45)
S4Arrays (1)
S4Vectors (9)
saemix (1)
SAIGEgds (1)
sandwich (4)
sas7bdat (1)
sass (133)
SBGNview.data (0)
ScaledMatrix (1)
scales (45)
scam (1)
scater (1)
scatterD3 (1)
scattermore (19)
scatterpie (12)
scatterplot3d (50)
sccore (1)
sccs (1)
scCustomize (1)
scda (1)
scda.2021 (1)
scda.2022 (1)
ScDblFinder (1)
scDblFinder (1)
scGate (1)
scico (1)
scidb (1)
scLinear (1)
scMerge (1)
SCP (1)
scPipe (0)
scran (1)
scRNAseq (1)
scRNASeq.spatial (1)
scrypt (2)
scs (1)
sctransform (18)
scuttle (1)
scviewer (1)
sda (1)
SDMTools (1)
sdtmchecks (0)
secrets (1)
segmented (5)
selectr (1)
sen2r (1)
sendmailR (1)
sensitivity (1)
sensobol (1)
SeqArray (1)
seqinr (2)
seqLogo (1)
seqmagick (1)
seqminer (1)
seqpac (15)
sequencing (29)
sequenza (1)
seriation (11)
servr (1)
sesame (1)
sesameData (1)
sessioninfo (2)
set6 (1)
setRNG (1)
sets (1)
Seurat (25)
seurat (1)
SeuratDisk (1)
SeuratObject (19)
sf (59)
sfheaders (5)
sfsmisc (2)
shadowtext (2)
shape (3)
shapr (1)
shiny (122)
shiny.react (1)
shiny.router (1)
shinyAce (1)
shinyalert (1)
shinyauth (1)
shinyBS (4)
shinybusy (3)
shinycssloaders (0)
shinydashboard (2)
shinydashboardPlus (1)
shinydisconnect (1)
shinyFeedback (1)
shinyFiles (2)
shinyglide (1)
ShinyItemAnalysis (24)
shinyjqui (1)
shinyjs (4)
shinyLP (1)
shinymanager (1)
shinyMethyl (1)
shinyMobile (0)
shinyscreenshot (3)
shinySelect (0)
shinytest (2)
shinytest2 (2)
shinythemes (1)
shinytoastr (1)
shinyTree (2)
shinyvalidate (26)
shinyWidgets (35)
ShortRead (1)
showtext (1)
SIAMCAT (1)
SID (1)
sigclust (1)
Sigfried (1)
Signac (2)
signal (1)
SimDesign (1)
SimInf (0)
simpar (1)
simpleSingleCell (41)
simplesinglecell (1)
SingleCelLExperiment (0)
SingleCellExperiment (1)
singleCellTK (1)
SingleR (1)
SingscoreAMLMutations (19)
singscoreamlmutations (1)
sirnakit (1)
siscreener (1)
sitmo (8)
sjlabelled (1)
sjmisc (1)
sjPlot (1)
sjstats (1)
SkewHyperbolic (1)
skimr (1)
skmeans (1)
slackr (1)
slam (1)
slickR (0)
slider (9)
slingshot (1)
sm (0)
smacof (1)
sme (1)
smldesign (1)
smooth (1)
smoothHR (0)
SMVar (1)
sn (1)
sna (1)
snakecase (13)
snow (13)
SnowballC (2)
snowfall (1)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP151.GRCh38 (1)
sodium (6)
solrium (1)
SomaVarDB (1)
sommer (1)
sortable (2)
sos (1)
SoupX (1)
sourcetools (42)
sp (58)
spacetime (1)
spacrt (1)
spam (3)
spaMM (1)
sparklyr (1)
SPARQL (1)
sparsebn (1)
SparseM (2)
sparseMatrixStats (1)
sparsesvd (1)
spatial (28)
spatialreg (1)
spatstat (2)
spatstat.core (13)
spatstat.data (16)
spatstat.explore (12)
spatstat.geom (24)
spatstat.linnet (1)
spatstat.model (1)
spatstat.random (13)
spatstat.sparse (21)
spatstat.utils (21)
spData (12)
spdep (8)
spectacles (1)
speedglm (1)
spelling (1)
spgs (1)
spicyworkflow (1)
spicyWorkflow (9)
SpidermiR (1)
splancs (1)
splines2 (1)
splitTools (1)
splus2R (0)
spsComps (1)
SQUAREM (1)
ssh (1)
StanHeaders (1)
stargazer (1)
stars (2)
starter (1)
startup (1)
statmod (14)
statnet (1)
statnet.common (2)
statsExpressions (1)
statTarget (1)
stdmchecks (0)
stevedore (1)
stinepack (1)
storr (1)
strex (1)
string (1)
stringdist (5)
stringfish (3)
stringi (88)
stringr (76)
striprtf (1)
strucchange (1)
structToolbox (1)
styler (30)
subselect (1)
SummarizedExperiment (2)
summarytools (1)
sunburstR (1)
SuperLearner (1)
SuppDists (1)
survcomp (1)
survey (1)
survival (110)
survivalROC (1)
survminer (1)
survMisc (1)
sva (1)
svd (1)
svglite (9)
svMisc (0)
svUnit (1)
Swiffer (1)
symphony (1)
synapser (0)
sys (116)
sysfonts (1)
systemfit (1)
systemfonts (54)
syuzhet (1)
table1 (1)
tableHTML (1)
tableone (1)
tables (2)
tarchetypes (4)
targets (4)
taxize (1)
TCC (4)
TCGAbiolinks (1)
TCGAWorkflow (44)
tcgaworkflow (1)
teal (1)
teal.modules.clinical (1)
teal.modules.general (1)
teal.widgets (1)
templater (0)
tensorflow (5)
tergm (1)
tern (1)
terra (60)
tesseract (1)
testproj (0)
testthat (141)
texreg (1)
textshaping (31)
TFBSTools (1)
TFisher (1)
TFMPvalue (1)
tfruns (1)
tgp (1)
TH.data (2)
thematic (1)
themis (1)
this.path (1)
ThresholdROC (1)
tibble (117)
tictoc (9)
tidybayes (1)
tidycensus (18)
tidyclust (0)
tidygraph (7)
tidymodels (2)
tidyposterior (1)
tidyr (27)
tidyselect (29)
tidyseurat (1)
tidySummarizedExperiment (1)
tidyterra (1)
tidytext (1)
tidytlg (1)
tidytree (19)
tidyTree (1)
tidyverse (7)
tidyvpc (1)
tidyxl (1)
tiff (1)
tigris (14)
tikzDevice (1)
timechange (4)
timeDate (3)
TimeProjection (1)
timereg (1)
timeSeries (2)
timetk (1)
tinytest (1)
tinytex (147)
tm (1)
tmap (1)
TMB (14)
tmle (1)
tmvtnorm (1)
TNO (1)
tokenizers (1)
tokupika (1)
torch (1)
Tplyr (1)
tracee (1)
trackViewer (1)
tradeSeq (1)
TrajectoryUtils (1)
transformr (0)
transport (1)
treeio (1)
treemap (1)
treespace (1)
TreeSummarizedExperiment (1)
triebeard (2)
truncnorm (2)
TSCAN (1)
tseries (2)
tsfeatures (2)
tsne (1)
TSP (12)
ttdo (1)
TTR (1)
ttservice (1)
tufte (1)
tune (1)
twang (1)
tweenr (5)
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene (1)
tximeta (1)
tximport (1)
tximportDat (1)
tximportData (1)
txtq (1)
tzdb (61)
uatools (1)
UCell (1)
uchardet (1)
ucminf (1)
umap (1)
units (49)
UpSetR (1)
urca (1)
useful (1)
usethis (17)
usmap (1)
usmapdata (1)
utf8 (111)
utilsRmd (1)
uuid (48)
uwot (21)
V8 (12)
valr (1)
VAM (0)
variancePartition (1)
variants (27)
vars (1)
vaultr (1)
vcd (1)
vcfR (1)
vcr (1)
vctrs (213)
vdbR (1)
vdiffr (2)
vegan (2)
vegawidget (1)
vendormetadatahelpers (1)
VennDiagram (1)
VGAM (2)
VGAMextra (1)
vhydeg (1)
vioplot (1)
vip (1)
vipor (2)
viridis (76)
viridisLite (107)
viridislite (0)
visdat (1)
visNetwork (3)
visR (1)
vistime (13)
vroom (97)
vsn (1)
waffle (1)
waiter (1)
waldo (99)
warp (2)
wdman (1)
webchem (1)
webdriver (0)
webfakes (1)
WebGestaltR (0)
webmockr (1)
webp (1)
webshot (17)
webshot2 (1)
webutils (1)
WeightIt (1)
weights (2)
wesanderson (1)
WGCNA (1)
wheatmap (1)
whereami (1)
whisker (22)
WikidataR (1)
wikitaxa (1)
winboxr (1)
withr (85)
wk (64)
workflowr (1)
workflows (1)
workflowsets (1)
worrms (1)
wrapr (1)
Wrench (1)
writexl (2)
WriteXLS (1)
xaringan (1)
xaringanthemer (0)
xcms (1)
xfun (162)
xgboost (13)
xgxr (1)
XLConnect (1)
xlsx (1)
XML (58)
xml2 (110)
xopen (1)
xpose (1)
xslt (1)
xtable (1)
xts (4)
XVector (1)
yaImpute (1)
yaml (54)
yardstick (1)
ymlthis (0)
yspec (1)
yulab.utils (18)
zCompositions (1)
zen4R (1)
zinbwave (1)
zip (68)
Ziploc (1)
zlibbioc (1)
zoo (27)