See download stats for:    Bioconductor software packages    Bioconductor experiment packages    Bioconductor workflow packages

Download stats for Bioconductor annotation packages

This page was generated on 2024-01-10 17:33:03 -0500 (Wed, 10 Jan 2024).

The number reported next to each package name is the download score, that is, the average number of distinct IPs that “hit” the package each month for the last 12 months (not counting the current month).


Top 30

1GenomeInfoDbData (47789)
2GO.db (19797)
3org.Hs.eg.db (16240)
4HDO.db (11898)
5org.Mm.eg.db (7086)
6TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene (4515)
7BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38 (3264)
8DO.db (2895)
9reactome.db (2791)
10BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 (2738)
11TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene (2396)
12EnsDb.Hsapiens.v86 (2282)
13hgu133plus2.db (1536)
14org.Rn.eg.db (1392)
15TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.knownGene (1333)
16HPO.db (1269)
17FDb.InfiniumMethylation.hg19 (1253)
18IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19 (1239)
19MPO.db (1124)
20BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10 (1121)
21IlluminaHumanMethylation450kmanifest (1073)
22IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b4.hg19 (1002)
23IlluminaHumanMethylationEPICmanifest (995)
24Homo.sapiens (980)
25JASPAR2020 (923)
26org.Dm.eg.db (898)
27PFAM.db (756)
28hgu133plus2cdf (743)
29hgu133a.db (737)
30EnsDb.Hsapiens.v75 (737)

All annotation packages

All annotation package stats in one file: annotation_pkg_stats.tab

All annotation package download scores in one file: annotation_pkg_scores.tab

See Download stats for Bioconductor annotation repository (all packages combined)

A

ABAData (1)
abc (1)
abind (1)
acepack (1)
actuar (1)
ada (1)
adabag (1)
ade4 (3)
adegenet (1)
adegraphics (1)
adephylo (1)
ADGofTest (1)
aditools (0)
adme16cod (1)
adme16cod.db (20)
admiral (1)
admiral.test (1)
admiraldev (1)
admisc (26)
ADMM (1)
AER (1)
afex (1)
affxparser (1)
affy (1)
affycoretools (1)
affyio (1)
affyPLM (1)
ag (1)
ag.db (18)
agahomology (1)
agcdf (16)
AGHmatrix (1)
AgiMicroRna (0)
agprobe (15)
agricolae (5)
AHCytoBands (15)
AHEnsDbs (18)
AHLRBaseDbs (20)
AHMeSHDbs (25)
AHPathbankDbs (17)
AHPubMedDbs (22)
AHWikipathwaysDbs (16)
AICcmodavg (1)
AIPW (1)
airr (1)
airway (1)
akima (1)
alabama (1)
alakazam (1)
ald (1)
ALDEx2 (1)
aldvmm (1)
alembic (1)
AlgDesign (1)
alkahest.generic (1)
ALL (10)
alluvial (1)
almanac (1)
alphahull (1)
AlphaMissense.v2023.hg19 (3)
AlphaMissense.v2023.hg38 (4)
alphashape3d (1)
alr4 (1)
alternativeSplicingEvents.hg19 (16)
alternativeSplicingEvents.hg38 (18)
amap (1)
AMARETTO (1)
ambient (1)
Amelia (1)
AmesHousing (1)
amgen.okta.client (0)
amgsafetyvis (1)
amlogger (1)
ANCOMBC (1)
animation (2)
annaffy (0)
anndata (1)
annotate (2)
AnnotationDbi (15)
AnnotationFilter (1)
AnnotationForge (1)
AnnotationHub (2)
annotatr (1)
anopheles.db0 (16)
anRichment (1)
anticlust (1)
AnVIL (0)
anytime (3)
aod (1)
apcluster (1)
ape (13)
apeglm (1)
apex (1)
apexcharter (1)
aplot (23)
appgen (1)
aqp (1)
arabidopsis.db0 (22)
archive (1)
ArchR (1)
argparse (8)
argus.DS.Credentials (1)
argusDS.apc.utils (1)
argusDS.backtesting.engine (1)
argusDS.data (1)
argusDS.data.engineering (1)
argusDS.data.preparation (1)
argusDS.data.preparation2 (2)
argusDS.DataValidation (1)
argusDS.DB.manager.utilities (1)
argusDS.driver.importance (1)
argusDS.FCUtilities (1)
argusDS.FZ.SourceData (1)
argusDS.FZ.utils (1)
argusDS.gamlss.distributions (1)
argusDS.gamlss.forecast (2)
argusDS.gamlss.modelling (2)
argusDS.gamlss.testing (1)
argusDS.gamlss.utils (1)
argusDS.GlobalSettings (1)
argusDS.model.testing (1)
argusDS.model.tools (1)
argusDS.modeldb (1)
argusDS.possibility.curves.daily (1)
argusDS.PossibilityCurves.db.utils (1)
argusDS.PossibilityCurves.utils (1)
argusDS.shiny.utils (1)
argusDS.spread.trading.utils (2)
argusDS.Studio.APC (1)
argusDS.Studio.FC (1)
argusDS.Studio.MyStudio (2)
argusDS.Studio.permissions (1)
argusDS.Studio.utils (1)
argusDS.tabulator (1)
argusDS.trading.performance (1)
argusDS.TradingSignals (1)
argusDS.utilities (1)
arm (1)
aroma.affymetrix (7)
aroma.apd (7)
aroma.core (8)
ArrayExpress (1)
arrayhelpers (1)
arrayop (1)
arrow (13)
arsenal (1)
arules (21)
ArvadosR (1)
ascii (1)
asciicast (1)
ASExtras4 (0)
ash (5)
ashr (2)
asht (1)
AsioHeaders (3)
askpass (89)
asremlPlus (1)
assert (1)
assertive.code (1)
assertive.properties (7)
assertive.types (7)
assertr (1)
assertthat (2)
ASSET (1)
AssotesteR (1)
ATACseqQC (1)
ATE (0)
atgenomeatrefseq (1)
atgenomeatrefseq7cdf (1)
atgenomeatrefseq7probe (1)
atgenomeatrefseqcdf (1)
atgenomeatrefseqprobe (1)
atgenomeattair (1)
atgenomeattaircdf (1)
atgenomeattairprobe (1)
atgenomeattigr (1)
atgenomeattigr7cdf (1)
atgenomeattigr7probe (1)
atgenomeattigrcdf (1)
atgenomeattigrprobe (1)
ath1121501 (1)
ath1121501.db (47)
ath1121501cdf (50)
ath1121501probe (17)
ath1atrefseq (1)
ath1atrefseq7cdf (1)
ath1atrefseq7probe (1)
ath1atrefseqcdf (1)
ath1atrefseqprobe (1)
ath1attair (1)
ath1attaircdf (1)
ath1attairprobe (1)
ath1attigr (1)
ath1attigr7cdf (1)
ath1attigr7probe (1)
ath1attigrcdf (1)
ath1attigrprobe (1)
athhomology (1)
ATR (1)
attachment (3)
attempt (1)
AUC (1)
AUCell (1)
audio (1)
av (1)
ava2 (1)
aws (1)
aws.ec2metadata (1)
aws.s3 (5)
aws.signature (5)
azcore (1)
Azimuth (1)
AzureAuth (1)
AzureGraph (1)
AzureRMR (2)
AzureStor (1)

B

babelgene (2)
babelmixr2 (1)
babelwhale (1)
babynames (1)
backbone (1)
backports (79)
badger (1)
baguette (1)
bain (1)
BalancedSampling (1)
ballgown (0)
bambu (1)
BANDITS (0)
barley1cdf (14)
barley1probe (14)
BART (1)
bartMachine (1)
bartMachineJARs (1)
base (0)
base64 (1)
base64enc (1)
base64url (1)
basefun (1)
BASiCS (1)
basilisk (1)
basilisk.utils (1)
batchelor (1)
BatchJobs (1)
batchtools (1)
BayesFactor (1)
BayesFM (1)
bayesm (5)
bayesmeta (1)
bayesplot (8)
bayesQR (1)
bayestestR (1)
BayesX (1)
baySeq (5)
BB (1)
BBmisc (1)
bbmle (1)
bbotk (1)
bbr (1)
bbr.bayes (1)
bcellViper (1)
bdsmatrix (1)
beachmat (2)
beadarray (1)
beanplot (1)
beepr (1)
beeswarm (1)
bench (1)
benchmarkme (1)
benchmarkmeData (1)
benchr (1)
berryFunctions (1)
Bessel (1)
bestNormalize (1)
betareg (1)
bezier (1)
BgeeDB (1)
BGLR (1)
BH (92)
BIApylon (1)
BiasedUrn (9)
BIAutils (1)
bibtex (1)
biclust (1)
bife (1)
biganalytics (1)
bigassertr (1)
bigD (1)
bigdist (1)
BIGL (1)
biglasso (1)
biglm (1)
biglmm (1)
bigmemory (1)
bigmemory.sri (1)
bigparallelr (1)
bigreadr (1)
bigrquery (10)
bigsnpr (1)
bigsparser (1)
bigstatsr (1)
bigutils (1)
bigutilsr (1)
billboarder (5)
bindr (1)
bindrcpp (1)
binGroup (1)
binom (1)
binr (0)
bio3d (1)
biobank (1)
Biobase (6)
bioc::GenomeInfoDbData (1)
BiocBaseUtils (1)
BiocCheck (1)
BiocFileCache (2)
BiocGenerics (21)
BiocInstaller (0)
BiocIO (1)
BiocManager (148)
BiocNeighbors (2)
Bioconductor (1)
bioconductor (1)
BiocParallel (16)
BiocSingular (1)
BiocSklearn (0)
BiocStyle (1)
BiocVersion (30)
biocViews (1)
BiocWorkflowTools (0)
Biogenerics (1)
BioGenerics (1)
biomaRt (2)
BioMartGOGeneSets (8)
biomartr (1)
biomformat (1)
biostatR (1)
biostatUtil (0)
Biostrings (13)
BioVersion (1)
biovizBase (1)
bit (43)
bit64 (9)
bitops (9)
bizdays (1)
BlakerCI (1)
blastula (1)
blavaan (1)
blme (6)
blob (97)
blockcluster (1)
blockForest (1)
blockmodeling (1)
blogdown (1)
bluster (1)
BMA (1)
bmcite.SeuratData (1)
BMisc (1)
bmp (1)
bnlearn (1)
BOIN (1)
bold (1)
bookdown (27)
boot (38)
bootstrap (1)
botor (1)
bovine.db (18)
bovine.db0 (24)
bovinecdf (15)
bovineprobe (15)
box (5)
bpcp (1)
BradleyTerry2 (1)
brave (1)
brew (69)
brglm (1)
brglm2 (1)
bricks (1)
brickster (1)
bridgesampling (1)
brio (9)
brms (2)
brmsmargins (1)
Brobdingnag (1)
broman (1)
broom (98)
broom.helpers (3)
broom.mixed (1)
BrowserViz (1)
bs4Dash (6)
BSgenome (1)
BSGenome (1)
BSgenome.Alyrata.JGI.v1 (15)
BSgenome.Amellifera.BeeBase.assembly4 (19)
BSgenome.Amellifera.NCBI.AmelHAv3.1 (17)
BSgenome.Amellifera.UCSC.apiMel2 (26)
BSgenome.Amellifera.UCSC.apiMel2.masked (15)
BSgenome.Aofficinalis.NCBI.V1 (14)
BSgenome.Athaliana.TAIR.01222004 (1)
BSgenome.Athaliana.TAIR.04232008 (20)
BSgenome.Athaliana.TAIR.TAIR9 (64)
BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau3 (28)
BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau3.masked (14)
BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau4 (26)
BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau4.masked (15)
BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau6 (66)
BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau6.masked (57)
BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau8 (23)
BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau9 (34)
BSgenome.Btaurus.UCSC.bosTau9.masked (17)
BSgenome.Carietinum.NCBI.v1 (16)
BSgenome.Celegans.UCSC.ce10 (50)
BSgenome.Celegans.UCSC.ce11 (128)
BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 (297)
BSgenome.Celegans.UCSC.ce6 (17)
BSgenome.Cfamiliaris.UCSC.canFam2 (27)
BSgenome.Cfamiliaris.UCSC.canFam2.masked (15)
BSgenome.Cfamiliaris.UCSC.canFam3 (122)
BSgenome.Cfamiliaris.UCSC.canFam3.masked (16)
BSgenome.Cjacchus.UCSC.calJac3 (16)
BSgenome.Cjacchus.UCSC.calJac4 (20)
BSgenome.CneoformansVarGrubiiKN99.NCBI.ASM221672v1 (15)
BSgenome.Creinhardtii.JGI.v5.6 (14)
BSgenome.Dmelanogaster.BDGP.Release5 (1)
BSgenome.Dmelanogaster.FlyBase.r51 (1)
BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2 (42)
BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm2.masked (16)
BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm3 (197)
BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm3.masked (16)
BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm6 (128)
BSgenome.Drerio.UCSC.danRer10 (106)
BSgenome.Drerio.UCSC.danRer11 (59)
BSgenome.Drerio.UCSC.danRer5 (24)
BSgenome.Drerio.UCSC.danRer5.masked (13)
BSgenome.Drerio.UCSC.danRer6 (23)
BSgenome.Drerio.UCSC.danRer6.masked (14)
BSgenome.Drerio.UCSC.danRer7 (150)
BSgenome.Drerio.UCSC.danRer7.masked (15)
BSgenome.Dvirilis.Ensembl.dvircaf1 (13)
BSgenome.Ecoli.NCBI.20080805 (204)
BSgenome.Gaculeatus.UCSC.gasAcu1 (25)
BSgenome.Gaculeatus.UCSC.gasAcu1.masked (15)
BSgenome.Ggallus.ENSEMBL.galGal6 (1)
BSgenome.Ggallus.UCSC.galGal3 (75)
BSgenome.Ggallus.UCSC.galGal3.masked (16)
BSgenome.Ggallus.UCSC.galGal4 (29)
BSgenome.Ggallus.UCSC.galGal4.masked (14)
BSgenome.Ggallus.UCSC.galGal5 (15)
BSgenome.Ggallus.UCSC.galGal6 (29)
BSgenome.Gmax.NCBI.Gmv40 (16)
BSgenome.Hsapiens.1000genomes.hs37d5 (670)
BSgenome.Hsapiens.1000genomes.hs38d5 (1)
BSgenome.Hsapiens.1000genomes.hs3d5 (1)
BSgenome.Hsapiens.NCBI.b36v3 (1)
BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38 (658)
BSgenome.Hsapiens.NCBI.T2T.CHM13v2.0 (32)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg1 (0)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg16 (1)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17 (26)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg17.masked (15)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 (167)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18.masked (53)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 (2738)
bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19 (1)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19.masked (133)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38 (3264)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38.dbSNP151.major (22)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38.dbSNP151.minor (21)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38.masked (164)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hs1 (19)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.mm10 (0)
BSgenome.Mdomestica.UCSC.monDom5 (15)
BSgenome.Mfascicularis.NCBI.5.0 (20)
BSgenome.Mfascicularis.NCBI.6.0 (18)
BSgenome.Mfuro.UCSC.musFur1 (14)
BSgenome.Mmul10.SIVmac251 (1)
BSgenome.Mmulatta.NCBI.mmul10.tmp (1)
BSgenome.Mmulatta.UCSC.rheMac10 (68)
BSgenome.Mmulatta.UCSC.rheMac2 (26)
BSgenome.Mmulatta.UCSC.rheMac2.masked (14)
BSgenome.Mmulatta.UCSC.rheMac3 (24)
BSgenome.Mmulatta.UCSC.rheMac3.masked (14)
BSgenome.Mmulatta.UCSC.rheMac8 (28)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.hg38 (1)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10 (1121)
Bsgenome.Mmusculus.UCSC.mm10 (1)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10.masked (61)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm39 (90)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm6 (1)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm7 (1)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm8 (65)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm8.masked (58)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9 (287)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9.masked (40)
BSgenome.Omela.CUSTOM.oenMel1.1 (1)
BSgenome.Osativa.MSU.MSU7 (28)
BSgenome.Ppaniscus.UCSC.panPan1 (15)
BSgenome.Ppaniscus.UCSC.panPan2 (17)
BSgenome.Ptroglodytes.UCSC.panTro2 (23)
BSgenome.Ptroglodytes.UCSC.panTro2.masked (13)
BSgenome.Ptroglodytes.UCSC.panTro3 (25)
BSgenome.Ptroglodytes.UCSC.panTro3.masked (25)
BSgenome.Ptroglodytes.UCSC.panTro5 (16)
BSgenome.Ptroglodytes.UCSC.panTro6 (15)
BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn4 (38)
BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn4.masked (14)
BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn5 (125)
BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn5.masked (35)
BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn6 (74)
BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn7 (53)
BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer1 (116)
BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer2 (169)
BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer3 (201)
BSgenome.Sscrofa.UCSC.susScr11 (31)
BSgenome.Sscrofa.UCSC.susScr3 (23)
BSgenome.Sscrofa.UCSC.susScr3.masked (13)
BSgenome.Tgondii.ToxoDB.7.0 (18)
BSgenome.Tguttata.UCSC.taeGut1 (22)
BSgenome.Tguttata.UCSC.taeGut1.masked (12)
BSgenome.Tguttata.UCSC.taeGut2 (14)
BSgenome.Vvinifera.URGI.IGGP12Xv0 (14)
BSgenome.Vvinifera.URGI.IGGP12Xv2 (15)
BSgenome.Vvinifera.URGI.IGGP8X (13)
BSgenomes (1)
bsicons (1)
bslib (166)
bsplus (1)
bsubtiliscdf (13)
bsubtilisprobe (13)
btahomology (1)
btbovinebtense (1)
btbovinebtensecdf (1)
btbovinebtenseprobe (1)
btbovinebtensg (1)
btbovinebtensgcdf (1)
btbovinebtensgprobe (1)
btbovinebtenst (1)
btbovinebtenstcdf (1)
btbovinebtenstprobe (1)
btbovinebtentrezg (1)
btbovinebtentrezgcdf (1)
btbovinebtentrezgprobe (1)
btbovinebtrefseq (1)
btbovinebtrefseqcdf (1)
btbovinebtrefseqprobe (1)
btbovinebtug (1)
btbovinebtugcdf (1)
btbovinebtugprobe (1)
btergm (1)
bumphunter (0)
butcher (1)
bvls (1)
BWStest (1)

C

C50 (1)
ca (3)
cache (1)
cachem (131)
cadd.v1.6.hg19 (2)
cadd.v1.6.hg38 (2)
cAIC4 (1)
Cairo (15)
callr (84)
callthat (1)
CAM (1)
CAMERA (0)
campsis (1)
campsismod (1)
CancerSubtypes (0)
candisc (1)
canine.db (17)
canine.db0 (14)
canine2 (1)
canine2.db (17)
canine2cdf (14)
canine2probe (14)
caninecdf (13)
canineprobe (14)
canvasXpress (1)
caper (1)
capsidr (1)
capushe (1)
car (60)
carData (2)
caret (54)
carrier (1)
casebase (1)
castor (1)
CATALYST (1)
catboost (1)
catdata (1)
Category (1)
caTools (3)
CATT (1)
causaldata (1)
cba (1)
CBPS (1)
ccaPP (1)
ccdata (9)
ccdrAlgorithm (1)
cdip.datastore (1)
celda (1)
celegans (1)
celegans.db (27)
celeganscdf (14)
CelegansGenome.ce2 (1)
celegansprobe (14)
celhomology (1)
celldex (1)
CellMixS (0)
cellranger (1)
cem (1)
CEMiTool (0)
censReg (1)
CeTF (1)
cfahomology (1)
cfcanine2cfense (1)
cfcanine2cfense7cdf (1)
cfcanine2cfense7probe (1)
cfcanine2cfensecdf (1)
cfcanine2cfenseprobe (1)
cfcanine2cfensg (1)
cfcanine2cfensg7cdf (1)
cfcanine2cfensg7probe (1)
cfcanine2cfensgcdf (1)
cfcanine2cfensgprobe (1)
cfcanine2cfenst (1)
cfcanine2cfenst7cdf (1)
cfcanine2cfenst7probe (1)
cfcanine2cfenstcdf (1)
cfcanine2cfenstprobe (1)
cfcanine2cfentrezg (1)
cfcanine2cfentrezg7cdf (1)
cfcanine2cfentrezg7probe (1)
cfcanine2cfentrezgcdf (1)
cfcanine2cfentrezgprobe (1)
cfcanine2cfrefseq (1)
cfcanine2cfrefseq7cdf (1)
cfcanine2cfrefseq7probe (1)
cfcanine2cfrefseqcdf (1)
cfcanine2cfrefseqprobe (1)
cfcanine2cfug (1)
cfcanine2cfug7cdf (1)
cfcanine2cfug7probe (1)
cfcanine2cfugcdf (1)
cfcanine2cfugprobe (1)
cfcanine2cfvegat (1)
cfcanine2cfvegatcdf (1)
cfcanine2cfvegatprobe (1)
cgam (1)
cgdsr (1)
CGHbase (0)
ChAMP (1)
ChAMPdata (0)
changepoint (1)
checkmate (57)
checkr (1)
ChemmineDrugs (44)
ChemmineOB (1)
ChemmineR (1)
chemometrics (1)
chicken (1)
chicken.db (18)
chicken.db0 (14)
chickencdf (13)
chickenprobe (13)
chimeraviz (1)
chimp.db0 (20)
ChIPseeker (1)
chk (3)
chromhmmData (47)
chromote (4)
chromVAR (1)
chron (3)
cicero (1)
cinhomology (1)
circlesize (1)
circlize (7)
CiteFuse (1)
citruscdf (14)
citrusprobe (13)
Ckmeans.1d.dp (1)
clariomdhumanprobeset.db (28)
clariomdhumantranscriptcluster (0)
clariomdhumantranscriptcluster.db (36)
clariomshumancdf (1)
clariomshumanhttranscriptcluster.db (20)
clariomshumantranscriptcluster.db (29)
clariomsmousehttranscriptcluster.db (16)
clariomsmousetranscriptcluster.db (31)
clariomsrathttranscriptcluster.db (16)
clariomsrattranscriptcluster.db (17)
class (80)
ClassDiscovery (1)
classInt (27)
cleanrmd (1)
cli (154)
CLIFF (1)
clinfun (1)
ClinicalQc (1)
clinPK (0)
ClinViz (1)
clipr (42)
cliqueMS (0)
clisymbols (1)
clock (24)
clubSandwich (1)
clue (28)
CluMSID (0)
cluster (73)
clusterCrit (1)
clusterGeneration (3)
clustermq (3)
clusterprofielr (0)
clusterProfiler (3)
ClusterR (1)
clusterSim (1)
clusthaplo (0)
clustMixType (1)
clustree (1)
clv (1)
clValid (1)
cMAP (57)
cmdstanr (1)
CMplot (1)
cmprsk (1)
CmsAnalytics (1)
CNEr (1)
cobalt (2)
cobs (1)
coda (2)
coda.base (1)
codetools (48)
cogeqc (1)
coin (1)
collapse (1)
collections (1)
coloc (11)
colorfulVennPlot (1)
colorRamps (7)
colorspace (59)
colortools (1)
colourpicker (5)
colourvalues (1)
combinat (1)
coMET (0)
commentr (1)
common (1)
CommonJavaJars (1)
commonmark (114)
compareDF (1)
compareGroups (1)
compiler (0)
ComplexHeatmap (10)
complexheatmap (1)
compositions (2)
CompQuadForm (1)
compute.es (1)
concaveman (1)
condiments (1)
conditionz (1)
condMVNorm (1)
coneproj (1)
conf.design (1)
config (10)
confintr (1)
conflicted (9)
connectwidgets (1)
conquer (2)
consort (1)
ConsRank (1)
contentid (1)
contfrac (1)
coop (1)
copula (1)
coro (1)
corpcor (1)
corpora (1)
correlation (1)
corrplot (2)
corrr (1)
COSG (1)
cosmosR (1)
cottoncdf (12)
cottonprobe (13)
countrycode (8)
coveffectsplot (1)
covr (67)
covRNA (1)
cowplot (6)
coxme (1)
coxphf (1)
cplm (1)
cpm (1)
cpp11 (127)
cranlogs (1)
crayon (103)
crch (1)
creatr (1)
credentials (22)
crew (2)
crew.cluster (1)
CRISPR.shinyapp (1)
crop (1)
crossdes (1)
crossmatch (1)
crosstable (1)
crosstalk (90)
crrri (0)
crrry (0)
crul (7)
csv (1)
CTCF (22)
cubature (1)
cubelyr (0)
Cubist (1)
cummeRbund (0)
curatedMetagenomicData (0)
curl (225)
cvar (1)
cvAUC (1)
cvms (1)
CVST (1)
CVXR (1)
cxAnalysis (0)
cyclocomp (9)
cyp450cdf (11)
cytolib (0)
CytoML (1)
CytoTRACE (1)

D

D2C (1)
d3r (1)
dada2 (1)
dae (1)
dagitty (1)
DAISIE (1)
dasnormalize.iomel (1)
dastools (1)
data.table (100)
data.tree (5)
DatabaseConnector (1)
DataEditR (1)
datamods (5)
DataOmnio (1)
datapasta (1)
datapipeline (1)
datasets (0)
datawizard (3)
dbaccess (1)
dbarts (1)
DBI (36)
DBItest (1)
dbplyr (104)
dbscan (3)
dbx (3)
DCchoice (1)
dcdatr (1)
ddalpha (1)
DDCompanion (1)
debugme (1)
DECIPHER (1)
DeconRNASeq (0)
decontam (1)
decor (1)
decoupleR (1)
Deducer (1)
deepregression (1)
DEGseq (0)
Delaporte (1)
DelayedArray (4)
DelayedMatrixStats (9)
deldir (35)
dendextend (57)
DendSer (1)
dendsort (0)
densEstBayes (4)
densityClust (0)
densvis (1)
DEoptim (1)
DEoptimR (15)
DEP (1)
derfinder (0)
derfinderHelper (0)
Deriv (1)
desc (96)
descr (1)
descsuppR (1)
DescTools (10)
DESeq (1)
DESeq2 (3)
designmatch (1)
DEsingle (1)
deSolve (48)
devEMF (1)
devtools (60)
DEXICA (0)
DEXSeq (1)
dfidx (1)
dfoptim (1)
DHARMa (1)
diagram (1)
DiagrammeR (3)
DiagrammeRsvg (1)
dials (8)
DiceDesign (1)
DiceKriging (1)
diceR (1)
dichromat (5)
did (1)
DiffBind (1)
diffdf (1)
diffloop (1)
diffobj (9)
diffviewer (1)
digest (197)
dimRed (1)
diptest (2)
directlabels (1)
DirichletMultinomial (1)
disk.frame (1)
distances (1)
distill (1)
distr (1)
distr6 (1)
distributional (9)
DistributionUtils (1)
distro (1)
dittodb (1)
dittoSeq (1)
dlookr (1)
dlstats (1)
dm (1)
dmdrosophila2dmense (1)
dmdrosophila2dmense7cdf (1)
dmdrosophila2dmense7probe (1)
dmdrosophila2dmensecdf (1)
dmdrosophila2dmenseprobe (1)
dmdrosophila2dmensg (1)
dmdrosophila2dmensg7cdf (1)
dmdrosophila2dmensg7probe (1)
dmdrosophila2dmensgcdf (1)
dmdrosophila2dmensgprobe (1)
dmdrosophila2dmenst (1)
dmdrosophila2dmenst7cdf (1)
dmdrosophila2dmenst7probe (1)
dmdrosophila2dmenstcdf (1)
dmdrosophila2dmenstprobe (1)
dmdrosophila2dmrefseq (1)
dmdrosophila2dmrefseq7cdf (1)
dmdrosophila2dmrefseq7probe (1)
dmdrosophila2dmrefseqcdf (1)
dmdrosophila2dmrefseqprobe (1)
dmdrosophila2dmug (1)
dmdrosophila2dmug7cdf (1)
dmdrosophila2dmug7probe (1)
dmdrosophila2dmugcdf (1)
dmdrosophila2dmugprobe (1)
dmehomology (1)
DmelanogasterGenome.dm2 (1)
dmgenome1dmense (1)
dmgenome1dmense7cdf (1)
dmgenome1dmense7probe (1)
dmgenome1dmensecdf (1)
dmgenome1dmenseprobe (1)
dmgenome1dmensg (1)
dmgenome1dmensg7cdf (1)
dmgenome1dmensg7probe (1)
dmgenome1dmensgcdf (1)
dmgenome1dmensgprobe (1)
dmgenome1dmenst (1)
dmgenome1dmenst7cdf (1)
dmgenome1dmenst7probe (1)
dmgenome1dmenstcdf (1)
dmgenome1dmenstprobe (1)
dmgenome1dmrefseq (1)
dmgenome1dmrefseq7cdf (1)
dmgenome1dmrefseq7probe (1)
dmgenome1dmrefseqcdf (1)
dmgenome1dmrefseqprobe (1)
dmgenome1dmug (1)
dmgenome1dmug7cdf (1)
dmgenome1dmug7probe (1)
dmgenome1dmugcdf (1)
dmgenome1dmugprobe (1)
DMRcate (0)
DMRcatedata (0)
DNAcopy (1)
dName.db (1)
DO.db (2895)
do.db (1)
doBy (1)
dockerfiler (1)
docopt (5)
DoE.base (1)
DoEstRare (1)
doFuture (1)
domainsignatures (0)
doMC (1)
doMPI (1)
doParallel (31)
doRedis (1)
doRNG (2)
dorothea (1)
DOSE (2)
Dose (1)
DoseFinding (1)
doSNOW (1)
dotCall64 (5)
dotwhisker (1)
DoubletFinder (1)
downlit (24)
downloader (1)
downloadthis (1)
dparser (1)
dplyr (241)
dplyrb (1)
dqrng (19)
drake (6)
drat (1)
drc (1)
DRDID (1)
dream (1)
dreamerr (1)
drehomology (1)
drgee (1)
DropletUtils (2)
drosgenome1 (1)
drosgenome1.db (33)
drosgenome1cdf (15)
drosgenome1probe (14)
drosophila2 (1)
drosophila2.db (20)
drosophila2cdf (17)
drosophila2probe (105)
DRR (1)
drzebrafishdrense (1)
drzebrafishdrense7cdf (1)
drzebrafishdrense7probe (1)
drzebrafishdrensecdf (1)
drzebrafishdrenseprobe (1)
drzebrafishdrensg (1)
drzebrafishdrensg7cdf (1)
drzebrafishdrensg7probe (1)
drzebrafishdrensgcdf (1)
drzebrafishdrensgprobe (1)
drzebrafishdrenst (1)
drzebrafishdrenst7cdf (1)
drzebrafishdrenst7probe (1)
drzebrafishdrenstcdf (1)
drzebrafishdrenstprobe (1)
drzebrafishdrentrezg (1)
drzebrafishdrentrezg7cdf (1)
drzebrafishdrentrezg7probe (1)
drzebrafishdrentrezgcdf (1)
drzebrafishdrentrezgprobe (1)
drzebrafishdrrefseq (1)
drzebrafishdrrefseq7cdf (1)
drzebrafishdrrefseq7probe (1)
drzebrafishdrrefseqcdf (1)
drzebrafishdrrefseqprobe (1)
drzebrafishdrug (1)
drzebrafishdrug7cdf (1)
drzebrafishdrug7probe (1)
drzebrafishdrugcdf (1)
drzebrafishdrugprobe (1)
drzebrafishdrvegat (1)
drzebrafishdrvegatcdf (1)
drzebrafishdrvegatprobe (1)
dspNgs (1)
DT (164)
dtplyr (52)
dttr2 (1)
dtw (1)
dtwclust (1)
duckdb (2)
duct.tape (1)
dupRadar (0)
dygraphs (1)
dynamicTreeCut (1)
DynDoc (1)
dynfeature (1)
dynlm (1)
dynplot (1)
dynpred (1)
dynwrap (1)

E

e1071 (25)
earth (1)
easyENTIM (1)
easystats (1)
ebal (1)
EBImage (1)
Ecdat (1)
Ecfun (1)
echarts4r (8)
ecodist (1)
ecoli2.db (16)
ecoli2cdf (14)
ecoli2probe (13)
ecoliasv2cdf (11)
ecoliasv2probe (13)
ecolicdf (48)
ecoliK12.db0 (14)
ecoliprobe (14)
ecoliSakai.db0 (12)
ECOSolveR (1)
edgeR (10)
effects (1)
effectsize (2)
egg (5)
egohomology (1)
eha (1)
elasticsearchr (1)
ellipse (52)
ellipsis (11)
elliptic (1)
emayili (1)
embed (1)
EMD (1)
emdbook (4)
emdist (1)
emmeans (78)
EMMREML (1)
emulator (1)
enc (0)
encode (1)
ENCODExplorerData (23)
encryptr (1)
energy (1)
engitix.singlecell.db (1)
engitomixmk2 (1)
english (1)
enhancedvolcano (1)
EnhancedVolcano (1)
EnrichedHeatmap (1)
enrichplot (2)
enrichR (2)
enrichwith (1)
EnsDb.Hsapiens.v75 (737)
EnsDb.Hsapiens.v79 (304)
EnsDb.Hsapiens.v86 (2282)
EnsDb.Mmusculus.v75 (33)
EnsDb.Mmusculus.v79 (687)
EnsDb.Rnorvegicus.v75 (14)
EnsDb.Rnorvegicus.v79 (109)
ensembldb (1)
entropy (1)
EnvStats (1)
Epi (1)
EpiNow2 (1)
epiR (2)
EpiStats (1)
epitools (1)
EpiTxDb.Hs.hg38 (35)
EpiTxDb.Mm.mm10 (14)
EpiTxDb.Sc.sacCer3 (14)
equatags (1)
equate (1)
equivalence (1)
ergm (0)
erify (1)
escape (1)
esquisse (1)
estimability (8)
estimatr (1)
estmeansd (1)
etm (1)
eulerr (1)
EuPathDB (21)
europepmc (1)
evaluate (228)
EValue (1)
evd (1)
eventTrack (1)
ewfutils (1)
Exact (1)
exact2x2 (1)
exactci (1)
exactextractr (1)
exactRankTests (2)
excluderanges (79)
ExomeDepth (1)
exomePeak2 (1)
ExperimentHub (1)
expint (1)
explore (1)
ExploreModelMatrix (0)
ExplorOMICS (1)
expm (11)
expss (5)
extraChIPs (1)
extraDistr (5)
extrafont (2)
extrafontdb (1)
extraInserts (1)
extraoperators (1)
extraTrees (0)

F

fabletools (1)
facets (0)
factoextra (2)
FactoInvestigate (1)
FactoMineR (50)
Factoshiny (1)
fakepackage (1)
fansi (170)
faraway (1)
farver (28)
fastcluster (1)
fastDummies (17)
fasterize (1)
fastGHQuad (1)
fastICA (2)
fastmap (62)
fastmatch (16)
fastmatrix (1)
fastreeR (1)
fastshap (1)
fasttime (1)
fastverse (1)
fauxpas (1)
fBasics (2)
FD (1)
fda (8)
FDb.FANTOM4.promoters.hg19 (16)
FDb.InfiniumMethylation.hg18 (39)
FDb.InfiniumMethylation.hg19 (1253)
FDb.UCSC.snp135common.hg19 (17)
FDb.UCSC.snp137common.hg19 (15)
FDb.UCSC.tRNAs (112)
fdrtool (2)
fds (5)
feather (1)
feature (4)
FedData (1)
feisr (1)
fenr (1)
fExtremes (0)
ff (54)
fftwtools (1)
fGarch (1)
fgsea (2)
fields (3)
filehash (1)
filelock (11)
filesstrings (1)
finalfit (1)
findpython (6)
finetune (1)
fingerprint (1)
fit.models (1)
fitCons.UCSC.hg19 (17)
fitdistrplus (23)
fixest (1)
flair (1)
flashClust (1)
flexclust (1)
flexdashboard (2)
flexmix (1)
flexsurv (1)
flexsurvcure (1)
flextable (16)
float (1)
flock (1)
flowAI (1)
flowClust (1)
FlowCore (1)
flower (1)
FlowSOM (1)
FlowSorted.Blood.EPIC (9)
FlowSorted.CordBloodCombined.450k (9)
FlowSorted.CordBloodNorway.450k (1)
flowStats (1)
flowVS (0)
flowWorkspace (1)
flowWorkspaceData (0)
flux (1)
fly.db0 (19)
FME (1)
fmsb (1)
FMStable (1)
fmtr (1)
FNN (22)
foghorn (0)
fontawesome (106)
fontBitstreamVera (1)
fontcm (1)
fontLiberation (1)
fontquiver (1)
forcats (18)
foreach (8)
forecast (3)
foreign (32)
forestplot (1)
forestploter (1)
fork (1)
formatR (47)
formattable (1)
formatters (1)
Formula (8)
formula.tools (1)
forrester.metadata (0)
fortunes (1)
fpc (1)
fracdiff (1)
FragPipeAnalystR (1)
FRASER (0)
fresh (5)
FrF2 (1)
fs (206)
fst (1)
fstcore (1)
fTrading (1)
fungible (1)
furrr (16)
futile.logger (1)
futile.options (1)
future (90)
future.apply (46)
future.batchtools (1)
future.callr (3)
fuzzyjoin (1)
fwb (1)

G

g3viz (1)
GA (1)
gage (0)
gahgu133a (1)
gahgu133a.db (2)
gahgu133acdf (1)
gahgu133aprobe (2)
gahgu133b (1)
gahgu133b.db (1)
gahgu133bcdf (1)
gahgu133bprobe (1)
gahgu133plus2 (1)
gahgu133plus2.db (2)
gahgu133plus2cdf (2)
gahgu133plus2probe (2)
gahgu95av2 (1)
gahgu95av2.db (1)
gahgu95av2cdf (1)
gahgu95av2probe (1)
gahgu95b (1)
gahgu95b.db (1)
gahgu95bcdf (2)
gahgu95bprobe (1)
gahgu95c (1)
gahgu95c.db (1)
gahgu95ccdf (1)
gahgu95cprobe (1)
gahgu95d (1)
gahgu95d.db (1)
gahgu95dcdf (2)
gahgu95dprobe (1)
gahgu95e (1)
gahgu95e.db (1)
gahgu95ecdf (1)
gahgu95eprobe (1)
gam (2)
gamboostLSS (1)
gamlss (2)
gamlss.data (1)
gamlss.dist (2)
gamm4 (1)
gap (1)
gap.datasets (1)
gapminder (1)
gargle (76)
gaston (1)
gbm (1)
gbRd (1)
gbutils (1)
gclus (1)
gcrma (0)
gdata (10)
gdsfmt (1)
gdtools (17)
gee (1)
geepack (1)
geigen (1)
gemtc (1)
GenABEL (2)
GenABEL.data (2)
genefilter (1)
genefu (0)
geneLenDataBase (9)
geneplast.data (32)
geneplast.data.string.v91 (30)
geneplotter (1)
GeneralizedHyperbolic (1)
generics (32)
GENESIS (0)
GeneSummary (38)
GeneticsPed (0)
GENIE3 (0)
GenomeGraphs (0)
GenomeInfoDb (16)
GenomeInfoDbData (47789)
genomeinfodbdata (2)
genomewidesnp5Crlmm (77)
genomewidesnp6Crlmm (80)
GenomicAlignments (2)
GenomicFeatures (9)
GenomicFiles (1)
GenomicRanges (3)
GenomicState (84)
GenomicTools (1)
genoset (0)
GenSA (1)
geodata (1)
geodiv (1)
geohashTools (1)
geojson (1)
geojsonio (1)
geojsonsf (1)
GEOmap (4)
geometries (5)
geometry (1)
geomorph (1)
geomtextpath (1)
GeomxTools (0)
GEOquery (1)
geoR (1)
geos (1)
geosphere (9)
gert (37)
gestalt (4)
gestate (1)
getip (1)
getopt (16)
GetoptLong (2)
getPass (1)
gettz (1)
gfonts (1)
ggahomology (1)
ggalluvial (1)
GGally (4)
gganimate (1)
ggbeeswarm (16)
ggbio (0)
ggbreak (1)
ggchickenggense (1)
ggchickenggense7cdf (1)
ggchickenggense7probe (1)
ggchickenggensecdf (1)
ggchickenggenseprobe (1)
ggchickenggensg (1)
ggchickenggensg7cdf (1)
ggchickenggensg7probe (1)
ggchickenggensgcdf (1)
ggchickenggensgprobe (1)
ggchickenggenst (1)
ggchickenggenst7cdf (1)
ggchickenggenst7probe (1)
ggchickenggenstcdf (1)
ggchickenggenstprobe (1)
ggchickenggentrezg (1)
ggchickenggentrezgcdf (1)
ggchickenggentrezgprobe (1)
ggchickenggrefseq (1)
ggchickenggrefseq7cdf (1)
ggchickenggrefseq7probe (1)
ggchickenggrefseqcdf (1)
ggchickenggrefseqprobe (1)
ggchickenggug (1)
ggchickenggug7cdf (1)
ggchickenggug7probe (1)
ggchickenggugcdf (1)
ggchickenggugprobe (1)
ggcorrplot (1)
ggdag (1)
ggdendro (7)
ggdist (2)
gge (1)
ggeasy (1)
ggeffects (2)
ggExtra (2)
ggfittext (1)
ggforce (5)
ggformula (12)
ggfortify (2)
ggfun (23)
gggenes (1)
ggh4x (1)
gghalves (1)
gghighlight (1)
GGHumanMethCancerPanelv1.db (18)
ggimage (1)
gginnards (1)
ggiraph (1)
ggm (1)
ggmap (43)
ggmosaic (1)
ggnetwork (1)
ggnewscale (17)
ggnewscales (1)
ggokabeito (1)
ggpattern (1)
ggplot (1)
ggplot2 (175)
ggplot2movies (1)
ggplotify (19)
ggpmisc (3)
ggPMX (1)
ggpointdensity (5)
ggpp (4)
ggprism (1)
ggpubr (15)
ggRandomForests (0)
ggraph (4)
ggrastr (8)
ggrepel (75)
ggridges (25)
ggsci (55)
ggseqlogo (5)
ggside (1)
ggsignif (6)
ggstance (1)
ggstats (1)
ggstatsplot (1)
ggsurvfir (1)
ggsurvfit (1)
ggtext (2)
ggthemes (6)
ggtree (11)
ggtreeDendro (1)
ggtreeExtra (1)
ggvenn (1)
ggVennDiagram (1)
gh (61)
ghql (1)
gifski (1)
Giotto (1)
git2r (49)
gitcreds (13)
gitlabr (1)
gittargets (1)
GLAD (1)
glassoFast (1)
glca (1)
gld (1)
glmGamPoi (1)
GLMMadaptive (1)
glmmADMB (0)
glmmML (1)
glmmTMB (2)
glmnet (15)
glmnetUtils (3)
glmx (1)
GlobalAncova (0)
GlobalOptions (1)
globals (24)
globals, (1)
globaltest (0)
glpkAPI (1)
glue (18)
gmahomology (1)
gmailr (1)
gMCP (1)
GMD (0)
Gmisc (1)
gmm (1)
gmnl (1)
gmodels (1)
gmp (10)
gnm (1)
GO (1)
GO.db (19797)
go.db (1)
goftest (13)
golem (3)
golubEsets (1)
gongs (1)
googleAuthR (1)
googleCloudStorageR (1)
googledrive (67)
googlesheets4 (74)
googleVis (1)
GOSemSim (2)
goseq (0)
goshawk (1)
GOstats (1)
gower (10)
gp53cdf (12)
GPArotation (44)
GPfit (1)
gplots (17)
gprofiler2 (1)
gRain (1)
granny (1)
graph (1)
graphics (0)
graphlayouts (20)
graphql (1)
grasp2db (39)
gRbase (1)
grDevices (0)
greengenes13.5MgDb (2)
Greg (1)
greybox (1)
grf (1)
grid (0)
gridBase (1)
gridExtra (1)
gridGraphics (1)
gridpattern (1)
gridSVG (1)
gridtext (2)
grImport (1)
grImport2 (1)
groupdata2 (1)
grpreg (1)
grr (1)
gsbDesign (1)
gscounts (1)
gsDesign (1)
GSEABase (1)
gsignal (1)
gsl (2)
gsmoothr (5)
gson (4)
gsrc (0)
gss (2)
gstat (1)
gsubfn (1)
GSVA (1)
GSVAdata (1)
gt (4)
gtable (145)
gto (1)
gtools (35)
gtsummary (3)
gtx (0)
gubraqsar (1)
GUniFrac (2)
gupio (1)
Gviz (1)
gwascatData (13)
GWASExactHW (5)
gwasrapidd (1)
GWASTools (0)
GWENA (1)
gWidgets (1)
gWidgets2tcltk (0)
gWidgetstcltk (1)

H

h10kcod (1)
h10kcod.db (15)
h20kcod (1)
h20kcod.db (19)
h2o (2)
HAC (1)
hal9001 (1)
HandTill2001 (1)
HaploSim (1)
hapmap370k (15)
hardhat (52)
HardyWeinberg (1)
harmony (5)
hash (2)
haven (59)
hcg110 (1)
hcg110.db (17)
hcg110cdf (13)
hcg110probe (12)
hcgi12k (1)
hcgi8k (1)
HDCytoData (1)
HDF5Array (9)
hdf5r (2)
hdi (1)
HDInterval (8)
HDO.db (11898)
hdrcde (5)
heatmaply (12)
heemod (1)
heplots (1)
here (1)
Herper (1)
hexbin (9)
hexSticker (1)
hexView (1)
hgfocus (1)
hgfocus.db (29)
hgfocuscdf (38)
hgfocusprobe (29)
hgu133a (1)
hgu133a.db (737)
hgu133a2 (1)
hgu133a2.db (185)
hgu133a2cdf (121)
hgu133a2frmavecs (15)
hgu133a2probe (22)
hgu133acdf (245)
hgu133afrmavecs (39)
hgu133aprobe (104)
hgu133atagcdf (34)
hgu133atagprobe (24)
hgu133b (1)
hgu133b.db (40)
hgu133bcdf (45)
hgu133bprobe (15)
hgu133plus2 (1)
hgu133plus2.db (1536)
hgu133plus2cdf (743)
hgu133plus2frmavecs (35)
hgu133plus2probe (139)
hgu219.db (72)
hgu219cdf (45)
hgu219probe (15)
hgu95a (1)
hgu95a.db (516)
hgu95acdf (86)
hgu95aprobe (15)
hgu95av2 (80)
hgu95av2.db (693)
hgu95av2cdf (287)
hgu95av2probe (191)
hgu95b (1)
hgu95b.db (19)
hgu95bcdf (13)
hgu95bprobe (14)
hgu95c (1)
hgu95c.db (18)
hgu95ccdf (13)
hgu95cprobe (16)
hgu95d (1)
hgu95d.db (17)
hgu95dcdf (15)
hgu95dprobe (14)
hgu95e (1)
hgu95e.db (18)
hgu95ecdf (13)
hgu95eprobe (15)
hguatlas13k (1)
hguatlas13k.db (13)
hgubeta7 (1)
hgubeta7.db (15)
hguDKFZ31 (1)
hguDKFZ31.db (13)
hgug4100a (1)
hgug4100a.db (19)
hgug4101a (1)
hgug4101a.db (16)
hgug4110b (1)
hgug4110b.db (20)
hgug4111a (1)
hgug4111a.db (16)
hgug4112a (1)
hgug4112a.db (72)
hgug4845a.db (16)
hguqiagenv3 (1)
hguqiagenv3.db (16)
hi16cod (1)
hi16cod.db (16)
HiCBricks (0)
HiClimR (1)
hierfstat (0)
highcharter (1)
highlight (1)
highr (76)
highs (1)
hivprtplus2cdf (12)
Hmisc (19)
hms (124)
hom.At.inp.db (2)
hom.Ce.inp.db (1)
hom.Dm.inp.db (2)
hom.Dr.inp.db (1)
hom.Hs.inp.db (10)
hom.Mm.inp.db (2)
hom.Rn.inp.db (2)
hom.Sc.inp.db (2)
Homo.sapiens (980)
homolog.db (1)
Hoover (1)
hopach (1)
hpAnnot (13)
HPO.db (1269)
hrbrthemes (1)
hs133ahsense (1)
hs133ahsense7cdf (1)
hs133ahsense7probe (1)
hs133ahsensecdf (1)
hs133ahsenseprobe (1)
hs133ahsensg (1)
hs133ahsensg7cdf (1)
hs133ahsensg7probe (1)
hs133ahsensgcdf (1)
hs133ahsensgprobe (1)
hs133ahsenst (1)
hs133ahsenst7cdf (1)
hs133ahsenst7probe (1)
hs133ahsenstcdf (1)
hs133ahsenstprobe (1)
hs133ahsentrezg (1)
hs133ahsentrezg7cdf (1)
hs133ahsentrezg7probe (1)
hs133ahsentrezgcdf (1)
hs133ahsentrezgprobe (1)
hs133ahsrefseq (1)
hs133ahsrefseq7cdf (1)
hs133ahsrefseq7probe (1)
hs133ahsrefseqcdf (1)
hs133ahsrefseqprobe (1)
hs133ahsug (1)
hs133ahsug7cdf (1)
hs133ahsug7probe (1)
hs133ahsugcdf (1)
hs133ahsugprobe (1)
hs133ahsvegae (1)
hs133ahsvegaecdf (1)
hs133ahsvegaeprobe (1)
hs133ahsvegag (1)
hs133ahsvegagcdf (1)
hs133ahsvegagprobe (1)
hs133ahsvegat (1)
hs133ahsvegatcdf (1)
hs133ahsvegatprobe (1)
hs133aptense (1)
hs133aptense7cdf (1)
hs133aptense7probe (1)
hs133aptensecdf (1)
hs133aptenseprobe (1)
hs133aptensg (1)
hs133aptensg7cdf (1)
hs133aptensg7probe (1)
hs133aptensgcdf (1)
hs133aptensgprobe (1)
hs133aptenst (1)
hs133aptenstcdf (1)
hs133aptenstprobe (1)
hs133aptentrezg (1)
hs133aptentrezgcdf (1)
hs133aptentrezgprobe (1)
hs133aptrefseq (1)
hs133aptrefseqcdf (1)
hs133aptrefseqprobe (1)
hs133av2hsense (1)
hs133av2hsense7cdf (1)
hs133av2hsense7probe (1)
hs133av2hsensecdf (1)
hs133av2hsenseprobe (1)
hs133av2hsensg (1)
hs133av2hsensg7cdf (1)
hs133av2hsensg7probe (1)
hs133av2hsensgcdf (1)
hs133av2hsensgprobe (1)
hs133av2hsenst (1)
hs133av2hsenst7cdf (1)
hs133av2hsenst7probe (1)
hs133av2hsenstcdf (1)
hs133av2hsenstprobe (1)
hs133av2hsentrezg (1)
hs133av2hsentrezg7cdf (1)
hs133av2hsentrezg7probe (1)
hs133av2hsentrezgcdf (1)
hs133av2hsentrezgprobe (1)
hs133av2hsrefseq (1)
hs133av2hsrefseq7cdf (1)
hs133av2hsrefseq7probe (1)
hs133av2hsrefseqcdf (1)
hs133av2hsrefseqprobe (1)
hs133av2hsug (1)
hs133av2hsug7cdf (1)
hs133av2hsug7probe (1)
hs133av2hsugcdf (1)
hs133av2hsugprobe (1)
hs133av2hsvegae (1)
hs133av2hsvegaecdf (1)
hs133av2hsvegaeprobe (1)
hs133av2hsvegag (1)
hs133av2hsvegagcdf (1)
hs133av2hsvegagprobe (1)
hs133av2hsvegat (1)
hs133av2hsvegatcdf (1)
hs133av2hsvegatprobe (1)
hs133av2ptense (1)
hs133av2ptense7cdf (1)
hs133av2ptense7probe (1)
hs133av2ptensecdf (1)
hs133av2ptenseprobe (1)
hs133av2ptensg (1)
hs133av2ptensg7cdf (1)
hs133av2ptensg7probe (1)
hs133av2ptensgcdf (1)
hs133av2ptensgprobe (1)
hs133av2ptenst (1)
hs133av2ptenstcdf (1)
hs133av2ptenstprobe (1)
hs133av2ptentrezg (1)
hs133av2ptentrezgcdf (1)
hs133av2ptentrezgprobe (1)
hs133av2ptrefseq (1)
hs133av2ptrefseqcdf (1)
hs133av2ptrefseqprobe (1)
hs133bhsense (1)
hs133bhsense7cdf (1)
hs133bhsense7probe (1)
hs133bhsensecdf (1)
hs133bhsenseprobe (1)
hs133bhsensg (1)
hs133bhsensg7cdf (1)
hs133bhsensg7probe (1)
hs133bhsensgcdf (1)
hs133bhsensgprobe (1)
hs133bhsenst (1)
hs133bhsenst7cdf (1)
hs133bhsenst7probe (1)
hs133bhsenstcdf (1)
hs133bhsenstprobe (1)
hs133bhsentrezg (1)
hs133bhsentrezg7cdf (1)
hs133bhsentrezg7probe (1)
hs133bhsentrezgcdf (1)
hs133bhsentrezgprobe (1)
hs133bhsrefseq (1)
hs133bhsrefseq7cdf (1)
hs133bhsrefseq7probe (1)
hs133bhsrefseqcdf (1)
hs133bhsrefseqprobe (1)
hs133bhsug (1)
hs133bhsug7cdf (1)
hs133bhsug7probe (1)
hs133bhsugcdf (1)
hs133bhsugprobe (1)
hs133bhsvegae (1)
hs133bhsvegaecdf (1)
hs133bhsvegaeprobe (1)
hs133bhsvegag (1)
hs133bhsvegagcdf (1)
hs133bhsvegagprobe (1)
hs133bhsvegat (1)
hs133bhsvegatcdf (1)
hs133bhsvegatprobe (1)
hs133bptense (1)
hs133bptense7cdf (1)
hs133bptense7probe (1)
hs133bptensecdf (1)
hs133bptenseprobe (1)
hs133bptensg (1)
hs133bptensg7cdf (1)
hs133bptensg7probe (1)
hs133bptensgcdf (1)
hs133bptensgprobe (1)
hs133bptenst (1)
hs133bptenstcdf (1)
hs133bptenstprobe (1)
hs133bptentrezg (1)
hs133bptentrezgcdf (1)
hs133bptentrezgprobe (1)
hs133bptrefseq (1)
hs133bptrefseqcdf (1)
hs133bptrefseqprobe (1)
hs133phsense (1)
hs133phsense7cdf (1)
hs133phsense7probe (1)
hs133phsensecdf (1)
hs133phsenseprobe (1)
hs133phsensg (1)
hs133phsensg7cdf (1)
hs133phsensg7probe (1)
hs133phsensgcdf (1)
hs133phsensgprobe (1)
hs133phsenst (1)
hs133phsenst7cdf (1)
hs133phsenst7probe (1)
hs133phsenstcdf (1)
hs133phsenstprobe (1)
hs133phsentrezg (1)
hs133phsentrezg7cdf (1)
hs133phsentrezg7probe (1)
hs133phsentrezgcdf (1)
hs133phsentrezgprobe (1)
hs133phsrefseq (1)
hs133phsrefseq7cdf (1)
hs133phsrefseq7probe (1)
hs133phsrefseqcdf (1)
hs133phsrefseqprobe (1)
hs133phsug (1)
hs133phsug7cdf (1)
hs133phsug7probe (1)
hs133phsugcdf (1)
hs133phsugprobe (1)
hs133phsvegae (1)
hs133phsvegaecdf (1)
hs133phsvegaeprobe (1)
hs133phsvegag (1)
hs133phsvegagcdf (1)
hs133phsvegagprobe (1)
hs133phsvegat (1)
hs133phsvegatcdf (1)
hs133phsvegatprobe (1)
hs133pptense (1)
hs133pptense7cdf (1)
hs133pptense7probe (1)
hs133pptensecdf (1)
hs133pptenseprobe (1)
hs133pptensg (1)
hs133pptensg7cdf (1)
hs133pptensg7probe (1)
hs133pptensgcdf (1)
hs133pptensgprobe (1)
hs133pptenst (1)
hs133pptenstcdf (1)
hs133pptenstprobe (1)
hs133pptentrezg (1)
hs133pptentrezgcdf (1)
hs133pptentrezgprobe (1)
hs133pptrefseq (1)
hs133pptrefseqcdf (1)
hs133pptrefseqprobe (1)
hs133xhsense (1)
hs133xhsense7cdf (1)
hs133xhsense7probe (1)
hs133xhsensecdf (1)
hs133xhsenseprobe (1)
hs133xhsensg (1)
hs133xhsensg7cdf (1)
hs133xhsensg7probe (1)
hs133xhsensgcdf (1)
hs133xhsensgprobe (1)
hs133xhsenst (1)
hs133xhsenst7cdf (1)
hs133xhsenst7probe (1)
hs133xhsenstcdf (1)
hs133xhsenstprobe (1)
hs133xhsentrezg (1)
hs133xhsentrezg7cdf (1)
hs133xhsentrezg7probe (1)
hs133xhsentrezgcdf (1)
hs133xhsentrezgprobe (1)
hs133xhsrefseq (1)
hs133xhsrefseq7cdf (1)
hs133xhsrefseq7probe (1)
hs133xhsrefseqcdf (1)
hs133xhsrefseqprobe (1)
hs133xhsug (1)
hs133xhsug7cdf (1)
hs133xhsug7probe (1)
hs133xhsugcdf (1)
hs133xhsugprobe (1)
hs133xhsvegae (1)
hs133xhsvegaecdf (1)
hs133xhsvegaeprobe (1)
hs133xhsvegag (1)
hs133xhsvegagcdf (1)
hs133xhsvegagprobe (1)
hs133xhsvegat (1)
hs133xhsvegatcdf (1)
hs133xhsvegatprobe (1)
hs133xptense (1)
hs133xptense7cdf (1)
hs133xptense7probe (1)
hs133xptensecdf (1)
hs133xptenseprobe (1)
hs133xptensg (1)
hs133xptensg7cdf (1)
hs133xptensg7probe (1)
hs133xptensgcdf (1)
hs133xptensgprobe (1)
hs133xptenst (1)
hs133xptenstcdf (1)
hs133xptenstprobe (1)
hs133xptentrezg (1)
hs133xptentrezgcdf (1)
hs133xptentrezgprobe (1)
hs133xptrefseq (1)
hs133xptrefseqcdf (1)
hs133xptrefseqprobe (1)
hs25kresogen (1)
hs25kresogen.db (16)
Hs6UG171.db (16)
hs95av2hsense (1)
hs95av2hsense7cdf (1)
hs95av2hsense7probe (1)
hs95av2hsensecdf (1)
hs95av2hsenseprobe (1)
hs95av2hsensg (1)
hs95av2hsensg7cdf (1)
hs95av2hsensg7probe (1)
hs95av2hsensgcdf (1)
hs95av2hsensgprobe (1)
hs95av2hsenst (1)
hs95av2hsenst7cdf (1)
hs95av2hsenst7probe (1)
hs95av2hsenstcdf (1)
hs95av2hsenstprobe (1)
hs95av2hsentrezg (1)
hs95av2hsentrezg7cdf (1)
hs95av2hsentrezg7probe (1)
hs95av2hsentrezgcdf (1)
hs95av2hsentrezgprobe (1)
hs95av2hsrefseq (1)
hs95av2hsrefseq7cdf (1)
hs95av2hsrefseq7probe (1)
hs95av2hsrefseqcdf (1)
hs95av2hsrefseqprobe (1)
hs95av2hsug (1)
hs95av2hsug7cdf (1)
hs95av2hsug7probe (1)
hs95av2hsugcdf (1)
hs95av2hsugprobe (1)
hs95av2hsvegae (1)
hs95av2hsvegaecdf (1)
hs95av2hsvegaeprobe (1)
hs95av2hsvegag (1)
hs95av2hsvegagcdf (1)
hs95av2hsvegagprobe (1)
hs95av2hsvegat (1)
hs95av2hsvegatcdf (1)
hs95av2hsvegatprobe (1)
hs95av2ptense (1)
hs95av2ptense7cdf (1)
hs95av2ptense7probe (1)
hs95av2ptensecdf (1)
hs95av2ptenseprobe (1)
hs95av2ptensg (1)
hs95av2ptensg7cdf (1)
hs95av2ptensg7probe (1)
hs95av2ptensgcdf (1)
hs95av2ptensgprobe (1)
hs95av2ptenst (1)
hs95av2ptenstcdf (1)
hs95av2ptenstprobe (1)
hs95av2ptentrezg (1)
hs95av2ptentrezgcdf (1)
hs95av2ptentrezgprobe (1)
hs95av2ptrefseq (1)
hs95av2ptrefseqcdf (1)
hs95av2ptrefseqprobe (1)
HsAgilentDesign026652.db (37)
hsahomology (1)
HsapiensGenome.hg16 (1)
HsapiensGenome.hg17 (1)
HsapiensGenome.hg18 (1)
HSAUR2 (1)
HSAUR3 (1)
hsex10stv2hsense (1)
hsex10stv2hsense7cdf (1)
hsex10stv2hsense7probe (1)
hsex10stv2hsensecdf (1)
hsex10stv2hsenseprobe (1)
hsex10stv2hsensg (1)
hsex10stv2hsensg7cdf (1)
hsex10stv2hsensg7probe (1)
hsex10stv2hsensgcdf (1)
hsex10stv2hsensgprobe (1)
hsex10stv2hsenst (1)
hsex10stv2hsenst7cdf (1)
hsex10stv2hsenst7probe (1)
hsex10stv2hsenstcdf (1)
hsex10stv2hsenstprobe (1)
hsex10stv2hsentrezg (1)
hsex10stv2hsentrezg7cdf (1)
hsex10stv2hsentrezg7probe (1)
hsex10stv2hsentrezgcdf (1)
hsex10stv2hsentrezgprobe (1)
hsex10stv2hsrefseq (1)
hsex10stv2hsrefseq7cdf (1)
hsex10stv2hsrefseq7probe (1)
hsex10stv2hsrefseqcdf (1)
hsex10stv2hsrefseqprobe (1)
hsex10stv2hsug (1)
hsex10stv2hsug7cdf (1)
hsex10stv2hsug7probe (1)
hsex10stv2hsugcdf (1)
hsex10stv2hsugprobe (1)
hsex10stv2ptense (1)
hsex10stv2ptense7cdf (1)
hsex10stv2ptense7probe (1)
hsex10stv2ptensecdf (1)
hsex10stv2ptenseprobe (1)
hsex10stv2ptensg (1)
hsex10stv2ptensg7cdf (1)
hsex10stv2ptensg7probe (1)
hsex10stv2ptensgcdf (1)
hsex10stv2ptensgprobe (1)
hsex10stv2ptenst (1)
hsex10stv2ptenstcdf (1)
hsex10stv2ptenstprobe (1)
hsex10stv2ptentrezg (1)
hsex10stv2ptentrezgcdf (1)
hsex10stv2ptentrezgprobe (1)
hsfocushsense (1)
hsfocushsense7cdf (1)
hsfocushsense7probe (1)
hsfocushsensecdf (1)
hsfocushsenseprobe (1)
hsfocushsensg (1)
hsfocushsensg7cdf (1)
hsfocushsensg7probe (1)
hsfocushsensgcdf (1)
hsfocushsensgprobe (1)
hsfocushsenst (1)
hsfocushsenst7cdf (1)
hsfocushsenst7probe (1)
hsfocushsenstcdf (1)
hsfocushsenstprobe (1)
hsfocushsentrezg (1)
hsfocushsentrezg7cdf (1)
hsfocushsentrezg7probe (1)
hsfocushsentrezgcdf (1)
hsfocushsentrezgprobe (1)
hsfocushsrefseq (1)
hsfocushsrefseq7cdf (1)
hsfocushsrefseq7probe (1)
hsfocushsrefseqcdf (1)
hsfocushsrefseqprobe (1)
hsfocushsug (1)
hsfocushsug7cdf (1)
hsfocushsug7probe (1)
hsfocushsugcdf (1)
hsfocushsugprobe (1)
hsfocushsvegae (1)
hsfocushsvegaecdf (1)
hsfocushsvegaeprobe (1)
hsfocushsvegag (1)
hsfocushsvegagcdf (1)
hsfocushsvegagprobe (1)
hsfocushsvegat (1)
hsfocushsvegatcdf (1)
hsfocushsvegatprobe (1)
hsfocusptense (1)
hsfocusptense7cdf (1)
hsfocusptense7probe (1)
hsfocusptensecdf (1)
hsfocusptenseprobe (1)
hsfocusptensg (1)
hsfocusptensg7cdf (1)
hsfocusptensg7probe (1)
hsfocusptensgcdf (1)
hsfocusptensgprobe (1)
hsfocusptenst (1)
hsfocusptenstcdf (1)
hsfocusptenstprobe (1)
hsfocusptentrezg (1)
hsfocusptentrezgcdf (1)
hsfocusptentrezgprobe (1)
hsfocusptrefseq (1)
hsfocusptrefseqcdf (1)
hsfocusptrefseqprobe (1)
hsm (1)
HSMMSingleCell (1)
Hspec (13)
hspeccdf (11)
hta20probeset.db (19)
hta20stprobeset.db (1)
hta20sttranscriptcluster.db (1)
hta20transcriptcluster.db (38)
hthgu133a.db (80)
hthgu133acdf (24)
hthgu133afrmavecs (16)
hthgu133aprobe (16)
hthgu133b.db (16)
hthgu133bcdf (13)
hthgu133bprobe (14)
hthgu133plusa.db (13)
hthgu133plusb.db (12)
hthgu133pluspm.db (19)
hthgu133pluspmcdf (29)
hthgu133pluspmprobe (16)
htmg430a.db (13)
htmg430acdf (15)
htmg430aprobe (13)
htmg430b.db (12)
htmg430bcdf (14)
htmg430bprobe (14)
htmg430pm.db (16)
htmg430pmcdf (20)
htmg430pmprobe (13)
htmlTable (13)
htmltools (258)
htmlwidgets (213)
HTqPCR (1)
htrat230pm.db (13)
htrat230pmcdf (11)
htrat230pmprobe (14)
htratfocus.db (13)
htratfocuscdf (13)
htratfocusprobe (12)
httpcode (1)
httpgd (1)
httptest (7)
httput (1)
httpuv (150)
httr (211)
httr2 (58)
hu35ksuba (1)
hu35ksuba.db (17)
hu35ksubacdf (12)
hu35ksubaprobe (13)
hu35ksubb (1)
hu35ksubb.db (17)
hu35ksubbcdf (15)
hu35ksubbprobe (12)
hu35ksubc (1)
hu35ksubc.db (16)
hu35ksubccdf (13)
hu35ksubcprobe (14)
hu35ksubd (1)
hu35ksubd.db (18)
hu35ksubdcdf (14)
hu35ksubdprobe (12)
hu6800 (1)
hu6800.db (157)
hu6800cdf (17)
hu6800probe (13)
hu6800subacdf (13)
hu6800subbcdf (11)
hu6800subccdf (13)
hu6800subdcdf (13)
huex.1.0.st.v2frmavecs (17)
huex10stprobeset.db (17)
huex10sttranscriptcluster.db (32)
HuExExonProbesetLocation (16)
HuExExonProbesetLocationHg18 (12)
HuExExonProbesetLocationHg19 (12)
huge (1)
hugene.1.0.st.v1frmavecs (17)
hugene10st.db (1)
hugene10stprobeset.db (32)
hugene10sttranscriptcluster.db (562)
hugene10stv1.r3cdf (1)
hugene10stv1cdf (96)
hugene10stv1probe (26)
hugene11stprobeset.db (19)
hugene11sttranscriptcluster.db (60)
hugene20stprobeset.db (18)
hugene20sttranscriptcluster.db (53)
hugene21stprobeset.db (17)
hugene21sttranscriptcluster.db (24)
human.db0 (68)
human1mduov3bCrlmm (14)
human1mv1cCrlmm (13)
human370quadv3cCrlmm (12)
human370v1cCrlmm (72)
human550v3bCrlmm (11)
human610quadv1bCrlmm (27)
human650v3aCrlmm (14)
human660quadv1aCrlmm (11)
humanCHRLOC (51)
humancytosnp12v2p1hCrlmm (15)
humanLLMappings (1)
humanomni1quadv1bCrlmm (13)
humanomni258v1aCrlmm (1)
humanomni258v1p1bCrlmm (1)
humanomni25quadv1bCrlmm (12)
humanomni5quadv1bCrlmm (13)
humanomniexpress12v1bCrlmm (11)
hunspell (3)
HuO22 (1)
HuO22.db (14)
huxtable (1)
hvuhomology (1)
hwgcod (1)
hwgcod.db (15)
hwriter (2)
hypergeo (1)

I

IAPWS95 (1)
iatlas.app (1)
ica (14)
icenReg (1)
Icens (1)
ichorCNA (0)
ICS (1)
ICSNP (1)
ICSOutlier (1)
idmap3 (1)
IDPmisc (1)
idr (0)
ids (1)
iGasso (1)
igraph (68)
igraphdata (1)
igvShiny (1)
iheatmapr (3)
IHW (1)
ijtiff (1)
Illumina450ProbeVariants.db (0)
illuminaHumanDASLBeadID.db (1)
IlluminaHumanMethylation27k.db (29)
IlluminaHumanMethylation27kanno.ilmn12.hg19 (23)
IlluminaHumanMethylation27kmanifest (21)
IlluminaHumanMethylation450k.db (11)
IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19 (1239)
IlluminaHumanMethylation450kannotation.ilmn.v1.2 (1)
IlluminaHumanMethylation450kmanifest (1073)
IlluminaHumanMethylation450kprobe (20)
IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b2.hg19 (292)
IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b3.hg19 (27)
IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b4.hg19 (1002)
IlluminaHumanMethylationEPICmanifest (995)
illuminaHumanv1 (1)
illuminaHumanv1.db (56)
illuminaHumanv1BeadID.db (1)
illuminaHumanv1ProbeID.db (1)
illuminaHumanv2 (1)
illuminaHumanv2.db (71)
illuminaHumanv2BeadID.db (16)
illuminaHumanv2ProbeID.db (1)
illuminaHumanv3.db (175)
illuminaHumanv3BeadID.db (1)
illuminaHumanv3ProbeID.db (1)
illuminaHumanv4.db (268)
illuminaHumanv4BeadID.db (1)
illuminaHumanWGDASLv3.db (16)
illuminaHumanWGDASLv4.db (24)
illuminaio (1)
illuminaMousev1 (1)
illuminaMousev1.db (36)
illuminaMousev1BeadID.db (1)
illuminaMousev1p1 (1)
illuminaMousev1p1.db (35)
illuminaMousev1p1BeadID.db (1)
illuminaMousev1p1ProbeID.db (1)
illuminaMousev1ProbeID.db (1)
illuminaMousev2.db (62)
illuminaMousev2BeadID.db (1)
illuminaMousev2ProbeID.db (1)
illuminaRatv1 (1)
illuminaRatv1.db (36)
illuminaRatv1BeadID.db (1)
illuminaRatv1ProbeID.db (1)
imager (1)
imbalance (1)
imcRtools (0)
iml (0)
import (1)
ImpulseDE2 (1)
impute (1)
imputeLCMD (1)
imputeTS (1)
IncDTW (1)
IncidencePrevalence (1)
indac (1)
indac.db (13)
infer (9)
infercnv (1)
influenceR (3)
infotheo (1)
ini (1)
InkblotAnalytics (21)
INLA (0)
inline (1)
inlinedocs (1)
insight (4)
int.did.db (1)
int.domine.db (1)
int.geneint.db (1)
int.intact.db (1)
int.mppi.db (1)
intamap (1)
interactiveDisplayBase (1)
intergraph (1)
interp (6)
interval (1)
intervals (3)
inum (2)
invgamma (1)
ipaddress (1)
ipcwswitch (1)
IPDfromKM (1)
ipred (51)
iq (1)
IRanges (14)
IRdisplay (1)
IRkernel (1)
irlba (27)
irr (1)
ISLR (1)
Iso (1)
isoband (56)
ISOcodes (1)
isva (5)
ISwR (1)
iterators (8)
itertools (1)
itsadug (1)
ivpack (0)
ivprobit (1)
ivreg (1)

J

JADE (1)
jagsUI (1)
janeaustenr (1)
janitor (3)
JASPAR2016 (1)
JASPAR2018 (313)
JASPAR2020 (923)
jaspar2020 (1)
JASPAR2022 (197)
JASPAR2024 (10)
JavaGD (1)
JazaeriMetaData (1)
JazaeriMetaData.db (14)
jcolors (1)
JGR (1)
JM (1)
JMbayes (1)
jnjtemplates (1)
joineRML (1)
jomo (1)
jose (1)
jpeg (9)
jqr (5)
jquerylib (2)
js (1)
jsonify (1)
jsonlite (216)
jsTreeR (1)
jtools (1)
juicyjuice (1)
JuliaCall (0)

K

kableExtra (1)
kangar00 (1)
karyoploteR (0)
KaryoploteR (0)
katex (1)
KEGG (1)
KEGG.db (287)
kegg.db (0)
KEGGgraph (1)
KEGGprofile (0)
KEGGREST (5)
keggsvg (1)
Kendall (1)
keras (5)
KernelKnn (1)
kernlab (3)
KernSmooth (41)
keyring (1)
KFAS (1)
khroma (1)
kit (1)
kknn (1)
klahomology (1)
klaR (1)
km.ci (2)
kmed (1)
kml (1)
kml3d (1)
KMsurv (1)
knitr (202)
knitrdata (1)
knockoff (1)
kohonen (1)
kpmt (0)
kriging (1)
ks (3)
kSamples (1)
ktplots (1)

L

labdsv (1)
labeling (73)
labelled (3)
laeken (1)
Lahman (1)
lambda.r (1)
lambdr (1)
LambertW (1)
lamW (2)
landscapemetrics (1)
languageserver (2)
LaplacesDemon (1)
LAPOINTE.db (14)
lares (1)
lars (1)
lasso2 (1)
lastdose (1)
later (175)
latex2exp (1)
lattice (91)
latticeExtra (8)
lava (20)
lavaan (52)
lavaSearch2 (1)
lazyeval (35)
lbfgs (1)
lbfgsb3c (1)
lcopula (1)
ldap (1)
LDheatmap (1)
LDlinkR (1)
LDplots (1)
LEA (1)
leafem (1)
leaflet (3)
leaflet.minicharts (1)
leaflet.providers (2)
leafpop (1)
leaps (1)
LearnBayes (1)
learnr (3)
leiden (25)
leidenAlg (1)
leidenbase (15)
lemon (1)
lfa (1)
lfda (1)
lfe (1)
lgr (1)
lhs (8)
liana (1)
libcoin (2)
libgeos (1)
LiblineaR (8)
libr (1)
lifecycle (85)
liftOver (1)
lightgbm (1)
limma (87)
limmaGUI (0)
limmia (1)
limSolve (1)
Linnorm (1)
linprog (1)
lintr (23)
listenv (24)
listviewer (1)
littler (1)
lixoftConnectors (0)
lixoftConnectors.1 (0)
lixoftConnectors.2 (0)
lm.beta (1)
lme4 (109)
lmerTest (1)
lmodel2 (1)
lmom (8)
lmomco (1)
lmtest (15)
lobstr (2)
locfit (61)
log4r (1)
logcondens (1)
logger (1)
logging (1)
LogicReg (1)
logistf (5)
logitnorm (1)
logitr (1)
logr (1)
logspline (1)
lokern (1)
longitudinalData (1)
loo (6)
LoomExperiment (1)
lotri (1)
LowMACAAnnotation (31)
LowRankQP (1)
lpSolve (9)
lpSolveAPI (1)
lpsymphony (1)
lqmm (1)
LRBase.Ath.eg.db (1)
LRBase.Bta.eg.db (1)
LRBase.Cel.eg.db (1)
LRBase.Dme.eg.db (1)
LRBase.Dre.eg.db (1)
LRBase.Gga.eg.db (1)
LRBase.Hsa.eg.db (1)
LRBase.Mmu.eg.db (1)
LRBase.Pab.eg.db (1)
LRBase.Rno.eg.db (1)
LRBase.Ssc.eg.db (1)
LRBase.Xtr.eg.db (1)
lsa (7)
lsei (1)
lsmeans (1)
lubridate (49)
lumi (0)
lumiHumanAll.db (80)
lumiHumanIDMapping (59)
lumiHumanIDMapping.db (0)
lumiHumanV1 (1)
lumiHumanV2 (1)
lumiMouseAll.db (17)
lumiMouseIDMapping (15)
lumiMouseIDMapping.db (0)
lumiMouseV1 (1)
Luminescence (1)
lumiRatAll.db (14)
lumiRatIDMapping (12)
lumiRatV1 (1)
lvec (1)
lwgeom (1)
LymphoSeqDB (77)

M

m03modeldevelopment (1)
m10kcod (1)
m10kcod.db (13)
m20kcod (1)
m20kcod.db (14)
M3Drop (1)
Maaslin2 (1)
maboost (1)
MACSr (1)
madness (1)
MafDb.1Kgenomes.phase1.GRCh38 (17)
MafDb.1Kgenomes.phase1.hs37d5 (82)
MafDb.1Kgenomes.phase3.GRCh38 (47)
MafDb.1Kgenomes.phase3.hs37d5 (114)
MafDb.ALL.wgs.phase1.release.v3.20101123 (1)
MafDb.ALL.wgs.phase3.release.v5a.20130502 (1)
MafDb.ALL.wgs.phase3.release.v5b.20130502 (1)
MafDb.ESP6500SI.V2.SSA137 (1)
MafDb.ESP6500SI.V2.SSA137.dbSNP138 (1)
MafDb.ESP6500SI.V2.SSA137.GRCh38 (1)
MafDb.ESP6500SI.V2.SSA137.hs37d5 (2)
MafDb.ExAC.r0.3.1.nonTCGA.snvs.hs37d5 (1)
MafDb.ExAC.r0.3.1.snvs.hs37d5 (1)
MafDb.ExAC.r0.3.sites (1)
MafDb.ExAC.r1.0.GRCh38 (14)
MafDb.ExAC.r1.0.hs37d5 (90)
MafDb.ExAC.r1.0.nonTCGA.GRCh38 (16)
MafDb.ExAC.r1.0.nonTCGA.hs37d5 (14)
MafDb.gnomAD.r2.0.1.GRCh38 (1)
MafDb.gnomAD.r2.0.1.hs37d5 (1)
MafDb.gnomAD.r2.1.GRCh38 (32)
MafDb.gnomAD.r2.1.hs37d5 (27)
MafDb.gnomAD.r3.0.GRCh38 (2)
MafDb.gnomADex.r2.0.1.GRCh38 (2)
MafDb.gnomADex.r2.0.1.hs37d5 (1)
MafDb.gnomADex.r2.1.GRCh38 (14)
MafDb.gnomADex.r2.1.hs37d5 (92)
MafDb.TOPMed.freeze5.hg19 (17)
MafDb.TOPMed.freeze5.hg38 (14)
MafH5.gnomAD.r3.0.GRCh38 (1)
MafH5.gnomAD.v3.1.1.GRCh38 (13)
MafH5.gnomAD.v3.1.2.GRCh38 (21)
magic (1)
magick (9)
magrittr (34)
maic (1)
maicChecks (1)
mailR (0)
maizecdf (13)
maizeprobe (12)
maketools (13)
malaria.db0 (14)
MALDIquant (2)
mamurhesusmamuense (1)
mamurhesusmamuensecdf (1)
mamurhesusmamuenseprobe (1)
mamurhesusmamuensg (1)
mamurhesusmamuensgcdf (1)
mamurhesusmamuensgprobe (1)
mamurhesusmamuenst (1)
mamurhesusmamuenstcdf (1)
mamurhesusmamuenstprobe (1)
mamurhesusmamuentrezg (1)
mamurhesusmamuentrezgcdf (1)
mamurhesusmamuentrezgprobe (1)
mamurhesusmamurefseq (1)
mamurhesusmamurefseqcdf (1)
mamurhesusmamurefseqprobe (1)
mamurhesusmamuug (1)
mamurhesusmamuugcdf (1)
mamurhesusmamuugprobe (1)
manipulate (1)
manipulateWidget (1)
maotai (1)
mapbayr (1)
mapdata (1)
mapplots (1)
mapproj (1)
maps (6)
maptools (14)
maptree (1)
mapview (1)
marginaleffects (1)
margins (1)
Markdown (0)
markdown (99)
marqLevAlg (1)
marray (0)
maSigPro (0)
Masks.Dmelanogaster.UCSC.dm3 (1)
MASS (153)
MassSpecWavelet (0)
MAST (1)
Matching (1)
MatchIt (2)
MatchThem (1)
mathjaxr (3)
matlib (1)
Matrix (205)
Matrix.utils (8)
matrixcalc (1)
MatrixEQTL (1)
MatrixGenerics (3)
MatrixModels (62)
matrixStats (115)
matrixTests (1)
maxLik (1)
maxstat (1)
MBA (4)
mbend (1)
mboost (1)
mc2d (1)
mclogit (1)
mclust (7)
mclustcomp (1)
mcmc (1)
MCMCglmm (1)
MCMCpack (1)
MCPcounter (0)
mcr (3)
mda (1)
measurements (1)
measures (1)
mediation (1)
medicagocdf (15)
medicagoprobe (13)
memisc (1)
memoise (18)
MEMSS (1)
memuse (1)
merDeriv (1)
merTools (1)
MeSH.Aca.eg.db (4)
MeSH.Aga.PEST.eg.db (1)
MeSH.Ame.eg.db (1)
MeSH.Aml.eg.db (2)
MeSH.Ana.eg.db (1)
MeSH.Ani.FGSC.eg.db (1)
MeSH.AOR.db (4)
MeSH.Ath.eg.db (1)
MeSH.Atu.K84.eg.db (1)
MeSH.Bfl.eg.db (1)
MeSH.Bsu.168.eg.db (4)
MeSH.Bsu.Bsn5.eg.db (0)
MeSH.Bsu.RONN1.eg.db (0)
MeSH.Bsu.TUB10.eg.db (1)
MeSH.Bsu.W23.eg.db (0)
MeSH.Bta.eg.db (1)
MeSH.Cal.SC5314.eg.db (1)
MeSH.Cbr.eg.db (1)
MeSH.Cel.eg.db (2)
MeSH.Cfa.eg.db (1)
MeSH.Cin.eg.db (1)
MeSH.Cja.eg.db (1)
MeSH.Cpo.eg.db (2)
MeSH.Cre.eg.db (1)
MeSH.Dan.eg.db (1)
MeSH.db (8)
MeSH.Dda.3937.eg.db (1)
MeSH.Ddi.AX4.eg.db (1)
MeSH.Der.eg.db (1)
MeSH.Dgr.eg.db (1)
MeSH.Dme.eg.db (1)
MeSH.Dmo.eg.db (1)
MeSH.Dpe.eg.db (1)
MeSH.Dre.eg.db (1)
MeSH.Dse.eg.db (1)
MeSH.Dsi.eg.db (1)
MeSH.Dvi.eg.db (1)
MeSH.Dya.eg.db (1)
MeSH.Eca.eg.db (1)
MeSH.Eco.536.eg.db (0)
MeSH.Eco.55989.eg.db (1)
MeSH.Eco.APEC01.eg.db (0)
MeSH.Eco.B.REL606.eg.db (0)
MeSH.Eco.BW2952.eg.db (0)
MeSH.Eco.CFT073.eg.db (1)
MeSH.Eco.E24377A.eg.db (0)
MeSH.Eco.ED1a.eg.db (1)
MeSH.Eco.HS.eg.db (1)
MeSH.Eco.IAI1.eg.db (1)
MeSH.Eco.IAI39.eg.db (1)
MeSH.Eco.K12.DH10B.eg.db (1)
MeSH.Eco.K12.MG1655.eg.db (2)
MeSH.Eco.KO11FL.eg.db (0)
MeSH.Eco.O103.H2.12009.eg.db (0)
MeSH.Eco.O111.H.11128.eg.db (0)
MeSH.Eco.O127.H6.E2348.69.eg.db (1)
MeSH.Eco.O157.H7.EC4115.eg.db (0)
MeSH.Eco.O157.H7.EDL933.eg.db (1)
MeSH.Eco.O157.H7.Sakai.eg.db (1)
MeSH.Eco.O157.H7.TW14359.eg.db (0)
MeSH.Eco.O26.H11.11368.eg.db (0)
MeSH.Eco.O26.H7.CB9615.eg.db (0)
MeSH.Eco.S88.eg.db (1)
MeSH.Eco.SE11.eg.db (0)
MeSH.Eco.SMS35.eg.db (0)
MeSH.Eco.UMN026.eg.db (1)
MeSH.Eco.UTI89.eg.db (0)
MeSH.Eqc.eg.db (1)
MeSH.Gga.eg.db (1)
MeSH.Gma.eg.db (1)
MeSH.Hsa.eg.db (8)
MeSH.Laf.eg.db (1)
MeSH.Lma.eg.db (2)
MeSH.Mdo.eg.db (1)
MeSH.Mes.eg.db (1)
MeSH.Mga.eg.db (1)
MeSH.Miy.eg.db (1)
MeSH.Mml.eg.db (1)
MeSH.Mmu.eg.db (2)
MeSH.Mtr.eg.db (1)
MeSH.Nle.eg.db (1)
MeSH.Oan.eg.db (1)
MeSH.Ocu.eg.db (2)
MeSH.Oni.eg.db (2)
MeSH.Osa.eg.db (2)
MeSH.Pab.eg.db (1)
MeSH.Pae.LESB58.eg.db (0)
MeSH.Pae.PA14.eg.db (0)
MeSH.Pae.PA7.eg.db (0)
MeSH.Pae.PAO1.eg.db (1)
MeSH.PCR.db (4)
MeSH.Pfa.3D7.eg.db (2)
MeSH.Pto.eg.db (1)
MeSH.Ptr.eg.db (2)
MeSH.Rno.eg.db (1)
MeSH.Sau.COL.eg.db (0)
MeSH.Sau.ED98.eg.db (0)
MeSH.Sau.M013.eg.db (0)
MeSH.Sau.MSHR1132.eg.db (0)
MeSH.Sau.MSSA476.eg.db (0)
MeSH.Sau.Mu3.eg.db (0)
MeSH.Sau.Mu50.eg.db (0)
MeSH.Sau.MW2.eg.db (0)
MeSH.Sau.N315.eg.db (0)
MeSH.Sau.Newman.eg.db (0)
MeSH.Sau.RF122.eg.db (0)
MeSH.Sau.USA300FPR3757.eg.db (0)
MeSH.Sau.USA300TCH1516.eg.db (1)
MeSH.Sau.VC40.eg.db (0)
MeSH.Sce.S288c.eg.db (1)
MeSH.Sco.A32.eg.db (1)
MeSH.Sil.eg.db (2)
MeSH.Spo.972h.eg.db (1)
MeSH.Spu.eg.db (1)
MeSH.Ssc.eg.db (1)
MeSH.Syn.eg.db (4)
MeSH.Tbr.9274.eg.db (1)
MeSH.Tgo.ME49.eg.db (1)
MeSH.Tgu.eg.db (1)
MeSH.Vvi.eg.db (1)
MeSH.Xla.eg.db (2)
MeSH.Xtr.eg.db (2)
MeSH.Zma.eg.db (2)
MeSHDbi (1)
MESS (1)
meta (1)
metabaser (1)
metaBLUE (1)
metaBMA (1)
MetaboAnalystR (1)
metaboliteIDmapping (145)
metabolomics (1)
MetaboReport (1)
metacore (1)
metadat (1)
metafor (1)
metagenomeSeq (0)
metaMA (8)
metap (8)
metaplot (1)
metaplus (1)
metatools (1)
MetaUtility (1)
methods (0)
methylclockData (1)
methylumi (0)
metR (1)
mets (1)
mev (1)
mFilter (1)
Mfuzz (0)
mfx (1)
mgcv (150)
mgm (1)
mgrhomology (1)
mgu74a (1)
mgu74a.db (20)
mgu74acdf (12)
mgu74aprobe (14)
mgu74av2 (1)
mgu74av2.db (27)
mgu74av2cdf (17)
mgu74av2probe (12)
mgu74b (1)
mgu74b.db (16)
mgu74bcdf (11)
mgu74bprobe (13)
mgu74bv2 (1)
mgu74bv2.db (16)
mgu74bv2cdf (14)
mgu74bv2probe (12)
mgu74c (1)
mgu74c.db (17)
mgu74ccdf (12)
mgu74cprobe (12)
mgu74cv2 (1)
mgu74cv2.db (21)
mgu74cv2cdf (13)
mgu74cv2probe (14)
mguatlas5k (1)
mguatlas5k.db (16)
mgug4104a (1)
mgug4104a.db (16)
mgug4120a (1)
mgug4120a.db (14)
mgug4121a (1)
mgug4121a.db (15)
mgug4122a (1)
mgug4122a.db (17)
mhurdle (1)
mi16cod (1)
mi16cod.db (13)
mia (1)
miaViz (1)
mice (10)
miceadds (1)
microbenchmark (1)
micromap (1)
microseq (1)
Microsoft365R (1)
miloR (1)
mime (56)
mimosa (1)
minfi (0)
miniUI (1)
minpack.lm (2)
minqa (52)
mirai (1)
mirbase.db (174)
miRBaseVersions.db (113)
mirna102xgaincdf (13)
mirna10cdf (23)
mirna10probe (11)
mirna20cdf (16)
miRNAtap.db (82)
mirt (14)
misc3d (1)
miscTools (1)
missForest (1)
missMDA (1)
missRanger (1)
mitml (1)
mitools (1)
mixOmics (1)
mixsqp (13)
mixtools (1)
mlbench (6)
MLEcens (1)
mlegp (1)
mlfa (1)
mlflow (1)
MLmetrics (1)
mlmm.gwas (1)
mlmRev (1)
mlogit (1)
mlpack (1)
mlr (0)
mlr3 (1)
mlr3cluster (1)
mlr3data (1)
mlr3filters (1)
mlr3fselect (1)
mlr3hyperband (1)
mlr3learners (1)
mlr3measures (1)
mlr3misc (1)
mlr3pipelines (1)
mlr3proba (1)
mlr3tuning (1)
mlr3tuningspaces (1)
mlr3verse (1)
mlt (1)
mm11ksubammense (1)
mm11ksubammense7cdf (1)
mm11ksubammense7probe (1)
mm11ksubammensecdf (1)
mm11ksubammenseprobe (1)
mm11ksubammensg (1)
mm11ksubammensg7cdf (1)
mm11ksubammensg7probe (1)
mm11ksubammensgcdf (1)
mm11ksubammensgprobe (1)
mm11ksubammenst (1)
mm11ksubammenst7cdf (1)
mm11ksubammenst7probe (1)
mm11ksubammenstcdf (1)
mm11ksubammenstprobe (1)
mm11ksubammentrezg (1)
mm11ksubammentrezg7cdf (1)
mm11ksubammentrezg7probe (1)
mm11ksubammentrezgcdf (1)
mm11ksubammentrezgprobe (1)
mm11ksubammrefseq (1)
mm11ksubammrefseq7cdf (1)
mm11ksubammrefseq7probe (1)
mm11ksubammrefseqcdf (1)
mm11ksubammrefseqprobe (1)
mm11ksubammug (1)
mm11ksubammug7cdf (1)
mm11ksubammug7probe (1)
mm11ksubammugcdf (1)
mm11ksubammugprobe (1)
mm11ksubammvegae (1)
mm11ksubammvegaecdf (1)
mm11ksubammvegaeprobe (1)
mm11ksubammvegag (1)
mm11ksubammvegagcdf (1)
mm11ksubammvegagprobe (1)
mm11ksubammvegat (1)
mm11ksubammvegatcdf (1)
mm11ksubammvegatprobe (1)
mm11ksubbmmense (1)
mm11ksubbmmense7cdf (1)
mm11ksubbmmense7probe (1)
mm11ksubbmmensecdf (1)
mm11ksubbmmenseprobe (1)
mm11ksubbmmensg (1)
mm11ksubbmmensg7cdf (1)
mm11ksubbmmensg7probe (1)
mm11ksubbmmensgcdf (1)
mm11ksubbmmensgprobe (1)
mm11ksubbmmenst (1)
mm11ksubbmmenst7cdf (1)
mm11ksubbmmenst7probe (1)
mm11ksubbmmenstcdf (1)
mm11ksubbmmenstprobe (1)
mm11ksubbmmentrezg (1)
mm11ksubbmmentrezg7cdf (1)
mm11ksubbmmentrezg7probe (1)
mm11ksubbmmentrezgcdf (1)
mm11ksubbmmentrezgprobe (1)
mm11ksubbmmrefseq (1)
mm11ksubbmmrefseq7cdf (1)
mm11ksubbmmrefseq7probe (1)
mm11ksubbmmrefseqcdf (1)
mm11ksubbmmrefseqprobe (1)
mm11ksubbmmug (1)
mm11ksubbmmug7cdf (1)
mm11ksubbmmug7probe (1)
mm11ksubbmmugcdf (1)
mm11ksubbmmugprobe (1)
mm11ksubbmmvegae (1)
mm11ksubbmmvegaecdf (1)
mm11ksubbmmvegaeprobe (1)
mm11ksubbmmvegag (1)
mm11ksubbmmvegagcdf (1)
mm11ksubbmmvegagprobe (1)
mm11ksubbmmvegat (1)
mm11ksubbmmvegatcdf (1)
mm11ksubbmmvegatprobe (1)
mm24kresogen (1)
mm24kresogen.db (14)
mm430a2mmense (1)
mm430a2mmensecdf (1)
mm430a2mmenseprobe (1)
mm430a2mmensg (1)
mm430a2mmensgcdf (1)
mm430a2mmensgprobe (1)
mm430a2mmenst (1)
mm430a2mmenstcdf (1)
mm430a2mmenstprobe (1)
mm430a2mmentrezg (1)
mm430a2mmentrezgcdf (1)
mm430a2mmentrezgprobe (1)
mm430a2mmrefseq (1)
mm430a2mmrefseqcdf (1)
mm430a2mmrefseqprobe (1)
mm430a2mmug (1)
mm430a2mmugcdf (1)
mm430a2mmugprobe (1)
mm430a2mmvegae (1)
mm430a2mmvegaecdf (1)
mm430a2mmvegaeprobe (1)
mm430a2mmvegag (1)
mm430a2mmvegagcdf (1)
mm430a2mmvegagprobe (1)
mm430a2mmvegat (1)
mm430a2mmvegatcdf (1)
mm430a2mmvegatprobe (1)
mm430ammense (1)
mm430ammense7cdf (1)
mm430ammense7probe (1)
mm430ammensecdf (1)
mm430ammenseprobe (1)
mm430ammensg (1)
mm430ammensg7cdf (1)
mm430ammensg7probe (1)
mm430ammensgcdf (1)
mm430ammensgprobe (1)
mm430ammenst (1)
mm430ammenst7cdf (1)
mm430ammenst7probe (1)
mm430ammenstcdf (1)
mm430ammenstprobe (1)
mm430ammentrezg (1)
mm430ammentrezg7cdf (1)
mm430ammentrezg7probe (1)
mm430ammentrezgcdf (1)
mm430ammentrezgprobe (1)
mm430ammrefseq (1)
mm430ammrefseq7cdf (1)
mm430ammrefseq7probe (1)
mm430ammrefseqcdf (1)
mm430ammrefseqprobe (1)
mm430ammug (1)
mm430ammug7cdf (1)
mm430ammug7probe (1)
mm430ammugcdf (1)
mm430ammugprobe (1)
mm430ammvegae (1)
mm430ammvegaecdf (1)
mm430ammvegaeprobe (1)
mm430ammvegag (1)
mm430ammvegagcdf (1)
mm430ammvegagprobe (1)
mm430ammvegat (1)
mm430ammvegatcdf (1)
mm430ammvegatprobe (1)
mm430bmmense (1)
mm430bmmense7cdf (1)
mm430bmmense7probe (1)
mm430bmmensecdf (1)
mm430bmmenseprobe (1)
mm430bmmensg (1)
mm430bmmensg7cdf (1)
mm430bmmensg7probe (1)
mm430bmmensgcdf (1)
mm430bmmensgprobe (1)
mm430bmmenst (1)
mm430bmmenst7cdf (1)
mm430bmmenst7probe (1)
mm430bmmenstcdf (1)
mm430bmmenstprobe (1)
mm430bmmentrezg (1)
mm430bmmentrezg7cdf (1)
mm430bmmentrezg7probe (1)
mm430bmmentrezgcdf (1)
mm430bmmentrezgprobe (1)
mm430bmmrefseq (1)
mm430bmmrefseq7cdf (1)
mm430bmmrefseq7probe (1)
mm430bmmrefseqcdf (1)
mm430bmmrefseqprobe (1)
mm430bmmug (1)
mm430bmmug7cdf (1)
mm430bmmug7probe (1)
mm430bmmugcdf (1)
mm430bmmugprobe (1)
mm430bmmvegae (1)
mm430bmmvegaecdf (1)
mm430bmmvegaeprobe (1)
mm430bmmvegag (1)
mm430bmmvegagcdf (1)
mm430bmmvegagprobe (1)
mm430bmmvegat (1)
mm430bmmvegatcdf (1)
mm430bmmvegatprobe (1)
mm430mmense (1)
mm430mmense7cdf (1)
mm430mmense7probe (1)
mm430mmensecdf (1)
mm430mmenseprobe (1)
mm430mmensg (1)
mm430mmensg7cdf (1)
mm430mmensg7probe (1)
mm430mmensgcdf (1)
mm430mmensgprobe (1)
mm430mmenst (1)
mm430mmenst7cdf (1)
mm430mmenst7probe (1)
mm430mmenstcdf (1)
mm430mmenstprobe (1)
mm430mmentrezg (1)
mm430mmentrezg7cdf (1)
mm430mmentrezg7probe (1)
mm430mmentrezgcdf (1)
mm430mmentrezgprobe (1)
mm430mmrefseq (1)
mm430mmrefseq7cdf (1)
mm430mmrefseq7probe (1)
mm430mmrefseqcdf (1)
mm430mmrefseqprobe (1)
mm430mmug (1)
mm430mmug7cdf (1)
mm430mmug7probe (1)
mm430mmugcdf (1)
mm430mmugprobe (1)
mm430mmvegae (1)
mm430mmvegaecdf (1)
mm430mmvegaeprobe (1)
mm430mmvegag (1)
mm430mmvegagcdf (1)
mm430mmvegagprobe (1)
mm430mmvegat (1)
mm430mmvegatcdf (1)
mm430mmvegatprobe (1)
mm74av1mmense (1)
mm74av1mmense7cdf (1)
mm74av1mmense7probe (1)
mm74av1mmensecdf (1)
mm74av1mmenseprobe (1)
mm74av1mmensg (1)
mm74av1mmensg7cdf (1)
mm74av1mmensg7probe (1)
mm74av1mmensgcdf (1)
mm74av1mmensgprobe (1)
mm74av1mmenst (1)
mm74av1mmenst7cdf (1)
mm74av1mmenst7probe (1)
mm74av1mmenstcdf (1)
mm74av1mmenstprobe (1)
mm74av1mmentrezg (1)
mm74av1mmentrezg7cdf (1)
mm74av1mmentrezg7probe (1)
mm74av1mmentrezgcdf (1)
mm74av1mmentrezgprobe (1)
mm74av1mmrefseq (1)
mm74av1mmrefseq7cdf (1)
mm74av1mmrefseq7probe (1)
mm74av1mmrefseqcdf (1)
mm74av1mmrefseqprobe (1)
mm74av1mmug (1)
mm74av1mmug7cdf (1)
mm74av1mmug7probe (1)
mm74av1mmugcdf (1)
mm74av1mmugprobe (1)
mm74av1mmvegae (1)
mm74av1mmvegaecdf (1)
mm74av1mmvegaeprobe (1)
mm74av1mmvegag (1)
mm74av1mmvegagcdf (1)
mm74av1mmvegagprobe (1)
mm74av1mmvegat (1)
mm74av1mmvegatcdf (1)
mm74av1mmvegatprobe (1)
mm74av2mmense (1)
mm74av2mmense7cdf (1)
mm74av2mmense7probe (1)
mm74av2mmensecdf (1)
mm74av2mmenseprobe (1)
mm74av2mmensg (1)
mm74av2mmensg7cdf (1)
mm74av2mmensg7probe (1)
mm74av2mmensgcdf (1)
mm74av2mmensgprobe (1)
mm74av2mmenst (1)
mm74av2mmenst7cdf (1)
mm74av2mmenst7probe (1)
mm74av2mmenstcdf (1)
mm74av2mmenstprobe (1)
mm74av2mmentrezg (1)
mm74av2mmentrezg7cdf (1)
mm74av2mmentrezg7probe (1)
mm74av2mmentrezgcdf (1)
mm74av2mmentrezgprobe (1)
mm74av2mmrefseq (1)
mm74av2mmrefseq7cdf (1)
mm74av2mmrefseq7probe (1)
mm74av2mmrefseqcdf (1)
mm74av2mmrefseqprobe (1)
mm74av2mmug (1)
mm74av2mmug7cdf (1)
mm74av2mmug7probe (1)
mm74av2mmugcdf (1)
mm74av2mmugprobe (1)
mm74av2mmvegae (1)
mm74av2mmvegaecdf (1)
mm74av2mmvegaeprobe (1)
mm74av2mmvegag (1)
mm74av2mmvegagcdf (1)
mm74av2mmvegagprobe (1)
mm74av2mmvegat (1)
mm74av2mmvegatcdf (1)
mm74av2mmvegatprobe (1)
mm74bv2mmense (1)
mm74bv2mmensecdf (1)
mm74bv2mmenseprobe (1)
mm74bv2mmensg (1)
mm74bv2mmensgcdf (1)
mm74bv2mmensgprobe (1)
mm74bv2mmenst (1)
mm74bv2mmenstcdf (1)
mm74bv2mmenstprobe (1)
mm74bv2mmentrezg (1)
mm74bv2mmentrezgcdf (1)
mm74bv2mmentrezgprobe (1)
mm74bv2mmrefseq (1)
mm74bv2mmrefseqcdf (1)
mm74bv2mmrefseqprobe (1)
mm74bv2mmug (1)
mm74bv2mmugcdf (1)
mm74bv2mmugprobe (1)
mm74bv2mmvegae (1)
mm74bv2mmvegaecdf (1)
mm74bv2mmvegaeprobe (1)
mm74bv2mmvegag (1)
mm74bv2mmvegagcdf (1)
mm74bv2mmvegagprobe (1)
mm74bv2mmvegat (1)
mm74bv2mmvegatcdf (1)
mm74bv2mmvegatprobe (1)
mm74cv2mmense (1)
mm74cv2mmensecdf (1)
mm74cv2mmenseprobe (1)
mm74cv2mmensg (1)
mm74cv2mmensgcdf (1)
mm74cv2mmensgprobe (1)
mm74cv2mmenst (1)
mm74cv2mmenstcdf (1)
mm74cv2mmenstprobe (1)
mm74cv2mmentrezg (1)
mm74cv2mmentrezgcdf (1)
mm74cv2mmentrezgprobe (1)
mm74cv2mmrefseq (1)
mm74cv2mmrefseqcdf (1)
mm74cv2mmrefseqprobe (1)
mm74cv2mmug (1)
mm74cv2mmugcdf (1)
mm74cv2mmugprobe (1)
mm74cv2mmvegae (1)
mm74cv2mmvegaecdf (1)
mm74cv2mmvegaeprobe (1)
mm74cv2mmvegag (1)
mm74cv2mmvegagcdf (1)
mm74cv2mmvegagprobe (1)
mm74cv2mmvegat (1)
mm74cv2mmvegatcdf (1)
mm74cv2mmvegatprobe (1)
MmAgilentDesign026655.db (19)
mmex10stv1mmense (1)
mmex10stv1mmense7cdf (1)
mmex10stv1mmense7probe (1)
mmex10stv1mmensecdf (1)
mmex10stv1mmenseprobe (1)
mmex10stv1mmensg (1)
mmex10stv1mmensg7cdf (1)
mmex10stv1mmensg7probe (1)
mmex10stv1mmensgcdf (1)
mmex10stv1mmensgprobe (1)
mmex10stv1mmenst (1)
mmex10stv1mmenst7cdf (1)
mmex10stv1mmenst7probe (1)
mmex10stv1mmenstcdf (1)
mmex10stv1mmenstprobe (1)
mmex10stv1mmentrezg (1)
mmex10stv1mmentrezg7cdf (1)
mmex10stv1mmentrezg7probe (1)
mmex10stv1mmentrezgcdf (1)
mmex10stv1mmentrezgprobe (1)
mmex10stv1mmrefseq (1)
mmex10stv1mmrefseq7cdf (1)
mmex10stv1mmrefseq7probe (1)
mmex10stv1mmrefseqcdf (1)
mmex10stv1mmrefseqprobe (1)
mmex10stv1mmug (1)
mmex10stv1mmug7cdf (1)
mmex10stv1mmug7probe (1)
mmex10stv1mmugcdf (1)
mmex10stv1mmugprobe (1)
mmrm (17)
mmuhomology (1)
MmusculusGenome.mm7 (1)
mnormt (11)
MNP (1)
mockery (2)
mockr (1)
modelbased (1)
modeldata (9)
modelenv (1)
ModelMetrics (1)
modelr (52)
modelsummary (1)
modeltests (1)
modeltools (1)
MODIStsp (1)
modules (5)
moe430a (1)
moe430a.db (34)
moe430acdf (15)
moe430aprobe (16)
moe430b (1)
moe430b.db (15)
moe430bcdf (12)
moe430bprobe (13)
moex10stprobeset.db (15)
moex10sttranscriptcluster.db (17)
MoExExonProbesetLocation (15)
MOFA2 (0)
mogene.1.0.st.v1frmavecs (11)
mogene10st.db (1)
mogene10stprobeset.db (19)
mogene10sttranscriptcluster.db (81)
mogene10stv1.r3cdf (1)
mogene10stv1cdf (36)
mogene10stv1probe (14)
mogene11stprobeset.db (16)
mogene11sttranscriptcluster.db (19)
mogene20stprobeset.db (16)
mogene20sttranscriptcluster.db (30)
mogene21stprobeset.db (15)
mogene21sttranscriptcluster.db (27)
moleculaR (1)
moments (1)
Momocs (1)
mondate (1)
monocle (1)
morpheus (0)
Morpho (1)
mosaicCore (12)
motifmatchr (1)
mouse.db0 (21)
mouse4302 (1)
mouse4302.db (196)
mouse4302cdf (125)
mouse4302frmavecs (67)
mouse4302probe (17)
mouse430a2 (1)
mouse430a2.db (54)
mouse430a2cdf (22)
mouse430a2frmavecs (14)
mouse430a2probe (15)
mouseCHRLOC (12)
mouseLLMappings (1)
MPA (1)
mpedbarray (1)
mpedbarray.db (14)
MplusAutomation (1)
mpm (1)
mpn.scorecard (1)
MPO.db (1124)
mppR (1)
MPV (1)
mratios (1)
mrgda (1)
mrggsave (1)
mrgmisc (1)
mrgsolve (1)
mrgvalidate (0)
mrgvalprep (0)
msa (1)
MsCoreUtils (1)
msdata (1)
MsFeatures (1)
msigdb (1)
msigdbr (2)
msm (2)
MSnbase (1)
MSstats (1)
MSstatsLiP (1)
MSstatsTMT (1)
MSstatsTMTs (1)
mstate (1)
MSwM (1)
mta10probeset.db (15)
mta10stprobeset.db (1)
mta10sttranscriptcluster.db (1)
mta10transcriptcluster.db (16)
mu11ksuba (1)
mu11ksuba.db (16)
mu11ksubacdf (12)
mu11ksubaprobe (13)
mu11ksubb (1)
mu11ksubb.db (16)
mu11ksubbcdf (12)
mu11ksubbprobe (13)
Mu15v1 (1)
Mu15v1.db (14)
mu19ksuba (1)
mu19ksuba.db (16)
mu19ksubacdf (12)
mu19ksubb (1)
mu19ksubb.db (15)
mu19ksubbcdf (11)
mu19ksubc (1)
mu19ksubc.db (16)
mu19ksubccdf (14)
Mu22v3 (1)
Mu22v3.db (14)
mu6500subacdf (13)
mu6500subbcdf (12)
mu6500subccdf (14)
mu6500subdcdf (13)
muhaz (1)
multcomp (3)
multcompView (44)
multgee (1)
MultiAssayExperiment (1)
multicool (2)
multicross (1)
multidplyr (1)
multiGSEA (1)
multimode (1)
multinichenetr (1)
multinma (1)
multipanelfigure (1)
multiwayvcov (1)
multtest (1)
MuMIn (1)
munsell (1)
Mus.musculus (428)
muscat (1)
muscData (1)
muscle (1)
MutationalPatterns (0)
mutoss (8)
mvabund (1)
mvna (1)
mvnfast (1)
mvnormtest (1)
mvtnorm (65)
mwgcod (1)
mwgcod.db (14)
myphd (1)
mzID (0)
mzR (1)

N

n1qn1 (1)
N2R (0)
nabor (1)
NADA (5)
naniar (1)
nanonext (1)
NanoPyx (1)
NanoStringNCTools (1)
nanostringr (1)
nanotime (1)
narray (1)
nasapower (1)
nat.util (1)
nat.utils (1)
natserv (1)
naturalsort (1)
NbClust (1)
nbpMatching (1)
ncappc (1)
ncar (1)
ncdf4 (5)
ncdf4.1 (0)
ncdfFlow (1)
NCmisc (1)
ncrhomology (1)
ncvreg (1)
ndexr (0)
ndjson (0)
Nebulosa (1)
NEONiso (1)
neonUtilities (1)
nephro (1)
nestedLogit (1)
nestedmodels (1)
netmeta (1)
netrankr (1)
NetSwan (1)
network (1)
networkD3 (1)
networkDynamic (1)
neuralnet (1)
NeuralNetTools (1)
nFactors (1)
ngsReports (1)
NHANES (1)
nhanesA (1)
nimble (1)
nipals (1)
NISTunits (1)
NlcOptim (1)
nleqslv (1)
nlme (153)
nlmixr2 (1)
nlmixr2data (1)
nlmixr2est (1)
nlmixr2extra (1)
nlmixr2lib (1)
nlmixr2plot (1)
nlmixr2rpt (1)
nloptr (57)
NMcalc (1)
NMdata (1)
NMF (8)
NMproject (0)
nmrec (1)
NMsim (1)
nnet (79)
NNLM (1)
nnls (2)
noctua (0)
NOISeq (0)
NonCompart (1)
nonmem2R (1)
nonmem2rx (1)
nonmemica (1)
nonnest2 (1)
nor1mix (1)
norm (2)
NormalizerDE (1)
nortest (1)
Norway981 (1)
Norway981.db (15)
Nozzle.R1 (1)
npde (1)
nphRCT (1)
npsurv (1)
nugohs1a520180.db (15)
nugohs1a520180cdf (13)
nugohs1a520180probe (13)
nugomm1a520177.db (14)
nugomm1a520177cdf (12)
nugomm1a520177probe (12)
numbat (5)
numbers (1)
numDeriv (1)
nycflights13 (1)

O

oaqc (1)
odbc (12)
odyproteomicsValidator (1)
officedown (1)
officer (15)
oligo (1)
oligoClasses (0)
oligoData (55)
omicsbase (1)
OmnipathR (1)
ompr (1)
ompr.roi (1)
omyhomology (1)
onbrand (1)
OncoBayes2 (1)
ontologyIndex (14)
ontoProc (1)
ontoProcData (14)
oompaBase (2)
oompaData (2)
opdisDownsampling (1)
openCyto (1)
OpenMx (1)
openssl (239)
openxlsx (20)
openxlsx2 (1)
operator.tools (1)
OperonHumanV3 (1)
OperonHumanV3.db (14)
optextras (1)
optimParallel (1)
optimr (1)
optimx (11)
optmatch (1)
optparse (54)
optpart (1)
optweight (1)
orca (1)
ordinal (1)
org.Ag.eg.db (158)
org.At.eg.db (0)
org.At.tair.db (624)
org.Bt.eg.db (369)
org.Ce.eg.db (415)
org.Cf.eg.db (311)
org.Dm.eg.db (898)
org.Dr.eg.db (700)
org.EcK12.eg.db (209)
org.EcSakai.eg.db (115)
org.Gg.eg.db (344)
org.Hs.bf.db (1)
org.Hs.cross.db (1)
org.Hs.eg.db (16240)
org.hs.eg.db (1)
org.Hs.goa.db (1)
org.Hs.ipi.db (2)
org.Hs.pep.db (1)
org.Hs.ref.db (1)
org.Hs.sp.db (1)
org.hsa.eg.db (1)
org.Hsa.eg.db (1)
org.HsMm.ortholog.db (1)
org.MeSH.Aca.db (1)
org.MeSH.Aga.PEST.db (1)
org.MeSH.Ame.db (1)
org.MeSH.Aml.db (1)
org.MeSH.Ana.db (1)
org.MeSH.Ani.FGSC.db (1)
org.MeSH.Ath.db (1)
org.MeSH.Atu.K84.db (1)
org.MeSH.Bfl.db (1)
org.MeSH.Bsu.168.db (1)
org.MeSH.Bsu.Bsn5.db (1)
org.MeSH.Bsu.RONN1.db (1)
org.MeSH.Bsu.TUB10.db (1)
org.MeSH.Bsu.W23.db (1)
org.MeSH.Bta.db (1)
org.MeSH.Cal.SC5314.db (1)
org.MeSH.Cbr.db (1)
org.MeSH.Cel.db (1)
org.MeSH.Cfa.db (1)
org.MeSH.Cin.db (1)
org.MeSH.Cja.db (1)
org.MeSH.Cpo.db (1)
org.MeSH.Cre.db (1)
org.MeSH.Dan.db (1)
org.MeSH.Dda.3937.db (1)
org.MeSH.Ddi.AX4.db (1)
org.MeSH.Der.db (1)
org.MeSH.Dgr.db (1)
org.MeSH.Dme.db (1)
org.MeSH.Dmo.db (1)
org.MeSH.Dpe.db (1)
org.MeSH.Dre.db (1)
org.MeSH.Dse.db (1)
org.MeSH.Dsi.db (1)
org.MeSH.Dvi.db (1)
org.MeSH.Dya.db (1)
org.MeSH.Eco.536.db (1)
org.MeSH.Eco.55989.db (1)
org.MeSH.Eco.APEC01.db (1)
org.MeSH.Eco.B.REL606.db (1)
org.MeSH.Eco.BW2952.db (1)
org.MeSH.Eco.CFT073.db (1)
org.MeSH.Eco.E24377A.db (1)
org.MeSH.Eco.ED1a.db (1)
org.MeSH.Eco.HS.db (1)
org.MeSH.Eco.IAI1.db (1)
org.MeSH.Eco.IAI39.db (1)
org.MeSH.Eco.K12.DH10B.db (1)
org.MeSH.Eco.K12.MG1655.db (1)
org.MeSH.Eco.KO11FL.db (1)
org.MeSH.Eco.O103.H2.12009.db (1)
org.MeSH.Eco.O111.H.11128.db (1)
org.MeSH.Eco.O127.H6.E2348.69.db (1)
org.MeSH.Eco.O157.H7.EC4115.db (1)
org.MeSH.Eco.O157.H7.EDL933.db (1)
org.MeSH.Eco.O157.H7.Sakai.db (1)
org.MeSH.Eco.O157.H7.TW14359.db (1)
org.MeSH.Eco.O26.H11.11368.db (1)
org.MeSH.Eco.O26.H7.CB9615.db (1)
org.MeSH.Eco.S88.db (1)
org.MeSH.Eco.SE11.db (1)
org.MeSH.Eco.SMS35.db (1)
org.MeSH.Eco.UMN026.db (1)
org.MeSH.Eco.UTI89.db (1)
org.MeSH.Eqc.db (1)
org.MeSH.Gga.db (1)
org.MeSH.Gma.db (1)
org.MeSH.Hsa.db (1)
org.MeSH.Laf.db (1)
org.MeSH.Lma.db (1)
org.MeSH.Mdo.db (1)
org.MeSH.Mes.db (1)
org.MeSH.Mga.db (1)
org.MeSH.Miy.db (1)
org.MeSH.Mml.db (1)
org.MeSH.Mmu.db (1)
org.MeSH.Mtr.db (1)
org.MeSH.Nle.db (1)
org.MeSH.Oan.db (1)
org.MeSH.Ocu.db (1)
org.MeSH.Oni.db (1)
org.MeSH.Osa.db (1)
org.MeSH.Pab.db (1)
org.MeSH.Pae.LESB58.db (1)
org.MeSH.Pae.PA14.db (1)
org.MeSH.Pae.PA7.db (1)
org.MeSH.Pae.PAO1.db (1)
org.MeSH.Pfa.3D7.db (1)
org.MeSH.Pto.db (1)
org.MeSH.Ptr.db (1)
org.MeSH.Rno.db (1)
org.MeSH.Sau.COL.db (1)
org.MeSH.Sau.ED98.db (1)
org.MeSH.Sau.M013.db (1)
org.MeSH.Sau.MRSA252.db (1)
org.MeSH.Sau.MSHR1132.db (1)
org.MeSH.Sau.MSSA476.db (1)
org.MeSH.Sau.Mu3.db (1)
org.MeSH.Sau.Mu50.db (1)
org.MeSH.Sau.MW2.db (1)
org.MeSH.Sau.N315.db (1)
org.MeSH.Sau.Newman.db (1)
org.MeSH.Sau.RF122.db (1)
org.MeSH.Sau.USA300FPR3757.db (1)
org.MeSH.Sau.USA300TCH1516.db (1)
org.MeSH.Sau.VC40.db (1)
org.MeSH.Sce.S288c.db (1)
org.MeSH.Sco.A32.db (1)
org.MeSH.Sil.db (1)
org.MeSH.Spo.972h.db (1)
org.MeSH.Spu.db (1)
org.MeSH.Ssc.db (1)
org.MeSH.Syn.db (1)
org.MeSH.Tbr.9274.db (1)
org.MeSH.Tgo.ME49.db (1)
org.MeSH.Tgu.db (1)
org.MeSH.Vvi.db (1)
org.MeSH.Xla.db (1)
org.MeSH.Xtr.db (1)
org.MeSH.Zma.db (1)
org.Mm.cross.db (1)
org.Mm.eg.db (7086)
org.mm.eg.db (1)
org.Mm.ipi.db (1)
org.Mm.ref.db (1)
org.Mm.sp.db (1)
org.Mmu.eg.db (315)
org.Mxanthus.db (25)
org.Pf.plasmo.db (37)
org.Pt.eg.db (170)
org.Rn.cross.db (1)
org.Rn.eg.db (1392)
org.Rn.ipi.db (1)
org.Rn.ref.db (1)
org.Rn.sp.db (1)
org.Sc.sgd.db (527)
org.Sco.eg.db (2)
org.Ss.eg.db (341)
org.Tgondii.eg.db (2)
org.Xl.eg.db (221)
OrganismDbi (0)
orientlib (1)
origami (1)
orthogene (1)
Orthology.eg.db (70)
orthopolynom (1)
osahomology (1)
oskeyring (1)
osmdata (33)
osprey (1)
osqp (2)
osriceosrefseq (1)
osriceosrefseq7cdf (1)
osriceosrefseq7probe (1)
osriceosrefseqcdf (1)
osriceosrefseqprobe (1)
osriceostigr (1)
osriceostigr7cdf (1)
osriceostigr7probe (1)
osriceostigrcdf (1)
osriceostigrprobe (1)
overlapping (1)

P

p (0)
packer (1)
packrat (35)
pacman (1)
padr (0)
paeg1acdf (12)
paeg1aprobe (12)
pagedown (1)
pagoda2 (1)
PAIRADISE (1)
PairedData (1)
pak (2)
paletteer (1)
palmerpenguins (1)
palr (1)
pals (1)
pammtools (1)
pamr (1)
pan (1)
pander (2)
pandoc (1)
panelr (1)
PANTHER.db (104)
paradox (1)
parallel (0)
parallelly (82)
parallelMap (1)
param6 (1)
parameters (3)
ParamHelpers (0)
parsedate (2)
parsnip (9)
PartheenMetaData (1)
PartheenMetaData.db (13)
partitions (1)
party (1)
partykit (2)
PASWR (1)
patchwork (40)
pathfindR.data (1)
pathview (1)
patrick (1)
paws (14)
paws.analytics (14)
paws.application.integration (14)
paws.common (16)
paws.compute (14)
paws.cost.management (14)
paws.customer.engagement (14)
paws.database (14)
paws.developer.tools (8)
paws.end.user.computing (8)
paws.machine.learning (14)
paws.management (14)
paws.networking (14)
paws.security.identity (14)
paws.storage (14)
pbapply (43)
pbdZMQ (1)
PBIR (1)
pbivnorm (1)
pbkrest (1)
pbkrtest (71)
pbmcapply (1)
pbmcref.SeuratData (1)
PBSmapping (1)
pcaExplorer (0)
pcalg (1)
pcaMethods (1)
pcaPP (10)
PCAtools (1)
PCDimension (1)
pch (1)
PCICt (1)
pcse (1)
pd.081229.hg18.promoter.medip.hx1 (20)
pd.2006.07.18.hg18.refseq.promoter (22)
pd.2006.07.18.mm8.refseq.promoter (19)
pd.2006.10.31.rn34.refseq.promoter (20)
pd.ag (20)
pd.aragene.1.0.st (22)
pd.aragene.1.1.st (23)
pd.ath1.121501 (22)
pd.barley1 (20)
pd.bovgene.1.0.st (23)
pd.bovgene.1.1.st (30)
pd.bovine (20)
pd.bsubtilis (20)
pd.cangene.1.0.st (22)
pd.cangene.1.1.st (18)
pd.canine (18)
pd.canine.2 (18)
pd.celegans (19)
pd.charm.hg18.example (22)
pd.chicken (21)
pd.chigene.1.0.st (19)
pd.chigene.1.1.st (25)
pd.chogene.2.0.st (19)
pd.chogene.2.1.st (19)
pd.citrus (18)
pd.clariom.d.human (62)
pd.clariom.s.human (68)
pd.clariom.s.human.ht (32)
pd.clariom.s.mouse (44)
pd.clariom.s.mouse.ht (22)
pd.clariom.s.rat (24)
pd.clariom.s.rat.ht (20)
pd.cotton (21)
pd.cyngene.1.0.st (19)
pd.cyngene.1.1.st (22)
pd.cyrgene.1.0.st (22)
pd.cyrgene.1.1.st (18)
pd.cytogenetics.array (21)
pd.drogene.1.0.st (21)
pd.drogene.1.1.st (19)
pd.drosgenome1 (18)
pd.drosophila.2 (19)
pd.e.coli.2 (23)
pd.ecoli (20)
pd.ecoli.asv2 (20)
pd.elegene.1.0.st (20)
pd.elegene.1.1.st (19)
pd.equgene.1.0.st (20)
pd.equgene.1.1.st (22)
pd.feinberg.hg18.me.hx1 (19)
pd.feinberg.mm8.me.hx1 (18)
pd.felgene.1.0.st (19)
pd.felgene.1.1.st (19)
pd.fingene.1.0.st (22)
pd.fingene.1.1.st (19)
pd.genomewidesnp.5 (83)
pd.genomewidesnp.6 (100)
pd.guigene.1.0.st (20)
pd.guigene.1.1.st (22)
pd.ha.2.0 (1)
pd.hc.g110 (19)
pd.hg.focus (23)
pd.hg.u133.plus.2 (217)
pd.hg.u133a (63)
pd.hg.u133a.2 (39)
pd.hg.u133a.tag (20)
pd.hg.u133b (26)
pd.hg.u219 (34)
pd.hg.u95a (46)
pd.hg.u95av2 (45)
pd.hg.u95b (18)
pd.hg.u95c (19)
pd.hg.u95d (18)
pd.hg.u95e (18)
pd.hg18.60mer.expr (35)
pd.ht.2.0 (1)
pd.ht.hg.u133.plus.pm (31)
pd.ht.hg.u133a (27)
pd.ht.mg.430a (24)
pd.hta.2.0 (83)
pd.htax.2.0 (1)
pd.htax.hta.2.0 (1)
pd.htXa.2.0 (1)
pd.hu6800 (30)
pd.huex.1.0.st.v2 (100)
pd.hugene.1.0.st.v1 (220)
pd.hugene.1.1.st.v1 (55)
pd.hugene.2.0.st (94)
pd.hugene.2.1.st (44)
pd.hxta.2.0 (1)
pd.maize (20)
pd.mapping250k.nsp (81)
pd.mapping250k.sty (82)
pd.mapping50k.hind240 (82)
pd.mapping50k.xba240 (108)
pd.margene.1.0.st (21)
pd.margene.1.1.st (18)
pd.medgene.1.0.st (20)
pd.medgene.1.1.st (18)
pd.medicago (19)
pd.mg.u74a (22)
pd.mg.u74av2 (26)
pd.mg.u74b (22)
pd.mg.u74bv2 (21)
pd.mg.u74c (21)
pd.mg.u74cv2 (20)
pd.mirna.1.0 (21)
pd.mirna.2.0 (21)
pd.mirna.3.0 (20)
pd.mirna.3.1 (20)
pd.mirna.4.0 (32)
pd.moe430a (22)
pd.moe430b (18)
pd.moex.1.0.st.v1 (25)
pd.mogene.1.0.st.v1 (86)
pd.mogene.1.1.st.v1 (23)
pd.mogene.2.0.st (55)
pd.mogene.2.1.st (37)
pd.mouse430.2 (42)
pd.mouse430a.2 (24)
pd.mta.1.0 (35)
pd.mu11ksuba (17)
pd.mu11ksubb (19)
pd.nugo.hs1a520180 (19)
pd.nugo.mm1a520177 (18)
pd.ovigene.1.0.st (19)
pd.ovigene.1.1.st (19)
pd.pae.g1a (18)
pd.plasmodium.anopheles (18)
pd.poplar (19)
pd.porcine (21)
pd.porgene.1.0.st (19)
pd.porgene.1.1.st (19)
pd.primeview (1)
pd.rabgene.1.0.st (21)
pd.rabgene.1.1.st (19)
pd.rae230a (26)
pd.rae230b (18)
pd.raex.1.0.st.v1 (20)
pd.ragene.1.0.st.v1 (20)
pd.ragene.1.1.st.v1 (21)
pd.ragene.2.0.st (21)
pd.ragene.2.1.st (19)
pd.rat230.2 (44)
pd.rcngene.1.0.st (20)
pd.rcngene.1.1.st (18)
pd.rg.u34a (18)
pd.rg.u34b (18)
pd.rg.u34c (17)
pd.rhegene.1.0.st (18)
pd.rhegene.1.1.st (21)
pd.rhesus (22)
pd.rice (21)
pd.rjpgene.1.0.st (21)
pd.rjpgene.1.1.st (18)
pd.rn.u34 (18)
pd.rta.1.0 (25)
pd.rusgene.1.0.st (19)
pd.rusgene.1.1.st (20)
pd.s.aureus (20)
pd.soybean (20)
pd.soygene.1.0.st (26)
pd.soygene.1.1.st (22)
pd.sugar.cane (19)
pd.tomato (19)
pd.u133.x3p (23)
pd.vitis.vinifera (19)
pd.wheat (23)
pd.x.laevis.2 (18)
pd.x.tropicalis (20)
pd.xenopus.laevis (19)
pd.yeast.2 (18)
pd.yg.s98 (18)
pd.zebgene.1.0.st (19)
pd.zebgene.1.1.st (21)
pd.zebrafish (18)
pdfCluster (1)
pdftools (5)
pdist (0)
pdp (1)
pec (1)
pedbarrayv10 (1)
pedbarrayv10.db (14)
pedbarrayv9 (1)
pedbarrayv9.db (14)
pedigree (1)
pegas (1)
pegboard (1)
PEIP (1)
PEMM (1)
penalized (1)
Peptides (1)
performance (3)
PerformanceAnalytics (1)
periscope (1)
perm (7)
permimp (1)
permute (2)
pfahomology (1)
PFAM (1)
PFAM.db (756)
PFIM (1)
pgirmess (1)
phangorn (2)
pharmaRTF (1)
pharmaversesdtm (1)
phastCons100way.UCSC.hg19 (142)
phastCons100way.UCSC.hg38 (98)
phastCons30way.UCSC.hg38 (13)
phastCons35way.UCSC.mm39 (13)
phastCons7way.UCSC.hg38 (28)
pheatmap (1)
philentropy (2)
phonTools (1)
phosphoricons (4)
PhosR (0)
phyclust (2)
phylobase (1)
phylocanvas (1)
phylogram (1)
phylolm (1)
phyloP35way.UCSC.mm39 (13)
phyloseq (1)
phylosignal (1)
phylotools (1)
phyr (1)
phytools (3)
picante (1)
pig.db0 (13)
pillar (176)
pimeta (1)
pinfsc50 (1)
pingr (4)
pins (35)
pipeR (1)
pixmap (2)
PK (1)
pkgbuild (86)
pkgcache (1)
pkgconfig (3)
pkgdepends (1)
pkgdown (10)
pkgKitten (1)
pkgload (144)
pkgmaker (2)
pkgsearch (1)
PKI (1)
PKNCA (1)
PKPDmodels (1)
plantecophys (1)
plasmodiumanophelescdf (23)
plasmodiumanophelesprobe (13)
plm (1)
plogr (1)
plot3D (1)
plotfunctions (1)
plotgardener (1)
plotly (96)
plotlyGeoAssets (1)
plotmm (1)
plotmo (1)
plotrix (6)
plotROC (1)
pls (2)
plumber (1)
plyr (98)
plyranges (1)
PMA (1)
pmartR (1)
PMCMRplus (1)
pmforest (1)
pmml (1)
pmparams (1)
pmplots (1)
pmtables (1)
pmxTools (1)
png (40)
POCRCannotation.db (13)
pointblank (1)
PoissonBinomial (1)
poLCA (1)
polspline (2)
Polychrome (1)
polyclip (48)
polycor (1)
polyester (0)
polynom (3)
PolynomF (1)
PolyPhen.Hsapiens.dbSNP131 (117)
polysat (0)
pool (1)
poolfstat (1)
poorman (1)
PopED (1)
poplarcdf (14)
poplarprobe (13)
poppr (0)
porcine.db (16)
porcinecdf (13)
porcineprobe (15)
PossibilityCurves (1)
posterior (8)
poweRlaw (5)
powerTCR (1)
PowerTOST (1)
ppcor (1)
prabclus (1)
pracma (15)
praise (1)
preAnomalyDetectionCredLife (1)
PreciseSums (1)
precommit (0)
prediction (1)
predint (1)
PReMiuM (1)
preprocessCore (1)
presto (1)
prettycode (1)
prettydoc (1)
prettyunits (87)
primeviewcdf (59)
primeviewprobe (19)
princurve (1)
printr (1)
prioritylasso (1)
prismatic (1)
pROC (40)
processCore (1)
processx (206)
prodlim (57)
productplots (1)
proffer (1)
profile (0)
profileModel (1)
profmem (1)
profvis (29)
progress (12)
progressr (40)
proj (1)
PROJ (2)
proj4 (11)
ProjecTILs (1)
projpred (1)
pRolocdata (9)
promise (1)
promises (114)
prompt (1)
propr (1)
PROreg (1)
ProtGenerics (1)
proto (1)
protolite (1)
protr (6)
proxy (2)
proxyC (1)
PRROC (5)
prt440acdf (1)
prt440scdf (1)
pryr (8)
ps (196)
PSCBS (6)
pscl (2)
PsNR (1)
pspline (1)
psych (50)
psychometric (2)
psychotools (1)
psychotree (1)
psychTools (1)
ptrhomology (1)
Publish (1)
PullReadAnalysisData (1)
PureCN (0)
purr (0)
purrr (151)
purrrlyr (1)
pvca (1)
pvclust (1)
pwr (1)
pyinit (1)
pzfx (1)

Q

qap (7)
qcc (1)
qcNvs (0)
qdapRegex (1)
qdapTools (1)
QDNAseq.hg19 (1)
QDNAseq.mm10 (1)
qgam (1)
qgraph (2)
qlcMatrix (5)
qpcR (1)
qpdf (1)
qqconf (6)
qqman (1)
qqplotr (1)
qrcode (1)
qreport (1)
qrng (1)
qrnn (1)
qs (3)
QSARdata (1)
qtl (1)
qtl2 (1)
quadprog (2)
qualpalr (1)
quantable (1)
quantmod (7)
quantreg (71)
quantsmooth (1)
quarto (4)
questionr (1)
QuickJSR (1)
qvalue (1)
qvcalc (1)
qwraps2 (1)

R

r (1)
R.cache (1)
R.devices (7)
R.filesets (7)
R.huge (5)
R.methodsS3 (12)
R.oo (12)
R.rsp (1)
R.utils (58)
r10kcod (1)
r10kcod.db (15)
r2d2 (1)
r2d3 (1)
R2HTML (1)
R2jags (1)
R2OpenBUGS (1)
r2rtf (1)
R2wd (1)
R2WinBUGS (1)
R6 (67)
rAccess (1)
radarchart (1)
radiator (1)
rae230a (1)
rae230a.db (66)
rae230acdf (18)
rae230aprobe (55)
rae230b (1)
rae230b.db (17)
rae230bcdf (13)
rae230bprobe (12)
raex10stprobeset.db (14)
raex10sttranscriptcluster.db (13)
RaExExonProbesetLocation (12)
ragene10stprobeset.db (14)
ragene10sttranscriptcluster.db (17)
ragene10stv1.r3cdf (1)
ragene10stv1cdf (14)
ragene10stv1probe (12)
ragene11stprobeset.db (14)
ragene11sttranscriptcluster.db (12)
ragene20stprobeset.db (13)
ragene20sttranscriptcluster.db (15)
ragene21stprobeset.db (14)
ragene21sttranscriptcluster.db (13)
ragg (56)
rainbow (7)
rAmCharts (1)
randomcoloR (5)
RandomFields (0)
RandomFieldsUtils (0)
randomForest (2)
randomForestSRC (1)
randomizr (1)
randomNames (1)
randtoolbox (1)
ranger (7)
RankAggreg (1)
RANN (1)
RApiDatetime (1)
rapidjsonr (1)
rapidoc (1)
RApiSerialize (3)
rappdirs (7)
rapportools (1)
rARPACK (5)
raster (58)
rat.db0 (19)
rat2302 (1)
rat2302.db (51)
rat2302cdf (35)
rat2302frmavecs (14)
rat2302probe (16)
ratCHRLOC (11)
ratelimitr (1)
RAthena (8)
ratLLMappings (1)
rattoxfxcdf (12)
rattoxfxprobe (11)
Rattus.norvegicus (53)
rbenchmark (1)
RBesT (1)
RBGL (1)
rbibutils (23)
rbioapi (2)
rBLAST (1)
rbmi (1)
rcartocolor (1)
rcdk (8)
rcdklibs (8)
Rcgmin (1)
Rchoice (1)
RCircos (0)
RClickhouse (1)
rclipboard (2)
rcmdcheck (49)
RcmdrMisc (1)
RColorBrewer (13)
rcompanion (1)
rcorpora (1)
Rcpp (153)
RcppAnnoy (37)
RcppArmadillo (155)
RcppCCTZ (1)
RcppClassic (1)
RcppDate (1)
RcppDE (1)
RcppDist (1)
RcppEigen (69)
RcppGSL (2)
RcppHNSW (28)
RcppML (4)
RcppNumerical (1)
RcppParallel (13)
RcppProgress (1)
RcppRoll (1)
RcppSimdJson (1)
RcppSpdlog (1)
RcppThread (1)
RcppTOML (24)
RcppZiggurat (6)
Rcsdp (1)
RCurl (90)
RCy3 (1)
Rd2roxygen (0)
RDCOMClient (0)
rdd (1)
rdflib (1)
Rdimtools (1)
rdocx (1)
Rdpack (23)
Rdsdp (1)
reactable (2)
reactlog (1)
reactome.db (2791)
ReactomeGSA (1)
ReactomePA (1)
reactR (6)
readbitmap (1)
readODS (1)
readr (63)
readstata13 (1)
readxl (62)
REBayes (1)
recipes (51)
reclin (1)
recommenderlab (7)
recosystem (12)
reda (1)
REddyProc (1)
redoc (1)
redux (1)
refinr (0)
RefManageR (1)
registry (1)
RegParallel (1)
relaimpo (1)
relations (1)
reldist (6)
relimp (1)
remaCor (3)
rematch (39)
rematch2 (1)
remotes (83)
rentrez (1)
renv (143)
report (1)
reporter (1)
reporting (1)
ReportingTools (0)
repr (1)
reprex (11)
repurrrsive (1)
reReg (1)
reshape (2)
reshape2 (9)
ResidualMatrix (1)
restfulr (15)
RestRserve (7)
reticulate (36)
revealgenomics (1)
RevGadgets (1)
review (1)
rex (56)
Rfast (11)
Rfit (1)
RFOC (4)
rgbif (1)
RGCCA (1)
rgdal (8)
rGenomeTracksData (46)
rgenoud (1)
rgeos (21)
rgexf (1)
rgl (3)
Rglpk (2)
rgnparser (1)
RgoogleMaps (2)
Rgraphviz (1)
rgu34a (1)
rgu34a.db (21)
rgu34acdf (16)
rgu34aprobe (14)
rgu34b (1)
rgu34b.db (16)
rgu34bcdf (12)
rgu34bprobe (14)
rgu34c (1)
rgu34c.db (16)
rgu34ccdf (13)
rgu34cprobe (13)
rguatlas4k (1)
rguatlas4k.db (13)
rgug4105a (1)
rgug4105a.db (13)
rgug4130a (1)
rgug4130a.db (13)
rgug4131a.db (17)
rhandsontable (2)
rhdf5 (2)
rhdf5filters (2)
Rhdf5lib (3)
rhesus.db0 (13)
rhesuscdf (15)
rhesusprobe (14)
rhino (5)
RhpcBLASctl (8)
Rhtslib (2)
rhub (1)
ri16cod (1)
ri16cod.db (14)
ribosomaldatabaseproject11.5MgDb (1)
rice (1)
ricecdf (17)
riceprobe (15)
RIdeogram (1)
ridigbio (1)
Ringo (0)
rintrojs (3)
rio (6)
RIPSeeker (1)
riskmetric (1)
riskRegression (1)
ritis (1)
RItools (1)
riverplot (1)
rj (0)
rj.gd (0)
rjags (1)
rJava (2)
RJDBC (1)
rjson (18)
rjsoncons (1)
RJSONIO (22)
Rlab (1)
rlang (195)
rlecuyer (1)
rlemon (1)
rliger (1)
rlist (1)
RLRsim (1)
rly (0)
Rmagic (1)
RMariaDB (2)
rmarkdown (194)
rmatio (1)
rmcorr (1)
rmdformats (1)
rmeta (1)
rminer (1)
rmio (1)
RmiR.Hs.miRNA (19)
RmiR.hsa (16)
rMisbeta (1)
Rmisc (1)
Rmpfr (9)
Rmpi (1)
rms (2)
rmsb (1)
RMTstat (1)
rmutil (0)
rMVP (1)
RMySQL (2)
rn230arnense (1)
rn230arnense7cdf (1)
rn230arnense7probe (1)
rn230arnensecdf (1)
rn230arnenseprobe (1)
rn230arnensg (1)
rn230arnensg7cdf (1)
rn230arnensg7probe (1)
rn230arnensgcdf (1)
rn230arnensgprobe (1)
rn230arnenst (1)
rn230arnenst7cdf (1)
rn230arnenst7probe (1)
rn230arnenstcdf (1)
rn230arnenstprobe (1)
rn230arnentrezg (1)
rn230arnentrezg7cdf (1)
rn230arnentrezg7probe (1)
rn230arnentrezgcdf (1)
rn230arnentrezgprobe (1)
rn230arnrefseq (1)
rn230arnrefseq7cdf (1)
rn230arnrefseq7probe (1)
rn230arnrefseqcdf (1)
rn230arnrefseqprobe (1)
rn230arnug (1)
rn230arnug7cdf (1)
rn230arnug7probe (1)
rn230arnugcdf (1)
rn230arnugprobe (1)
rn230brnense (1)
rn230brnense7cdf (1)
rn230brnense7probe (1)
rn230brnensecdf (1)
rn230brnenseprobe (1)
rn230brnensg (1)
rn230brnensg7cdf (1)
rn230brnensg7probe (1)
rn230brnensgcdf (1)
rn230brnensgprobe (1)
rn230brnenst (1)
rn230brnenst7cdf (1)
rn230brnenst7probe (1)
rn230brnenstcdf (1)
rn230brnenstprobe (1)
rn230brnentrezg (1)
rn230brnentrezg7cdf (1)
rn230brnentrezg7probe (1)
rn230brnentrezgcdf (1)
rn230brnentrezgprobe (1)
rn230brnrefseq (1)
rn230brnrefseq7cdf (1)
rn230brnrefseq7probe (1)
rn230brnrefseqcdf (1)
rn230brnrefseqprobe (1)
rn230brnug (1)
rn230brnug7cdf (1)
rn230brnug7probe (1)
rn230brnugcdf (1)
rn230brnugprobe (1)
rn230rnense (1)
rn230rnense7cdf (1)
rn230rnense7probe (1)
rn230rnensecdf (1)
rn230rnenseprobe (1)
rn230rnensg (1)
rn230rnensg7cdf (1)
rn230rnensg7probe (1)
rn230rnensgcdf (1)
rn230rnensgprobe (1)
rn230rnenst (1)
rn230rnenst7cdf (1)
rn230rnenst7probe (1)
rn230rnenstcdf (1)
rn230rnenstprobe (1)
rn230rnentrezg (1)
rn230rnentrezg7cdf (1)
rn230rnentrezg7probe (1)
rn230rnentrezgcdf (1)
rn230rnentrezgprobe (1)
rn230rnrefseq (1)
rn230rnrefseq7cdf (1)
rn230rnrefseq7probe (1)
rn230rnrefseqcdf (1)
rn230rnrefseqprobe (1)
rn230rnug (1)
rn230rnug7cdf (1)
rn230rnug7probe (1)
rn230rnugcdf (1)
rn230rnugprobe (1)
rn34arnense (1)
rn34arnense7cdf (1)
rn34arnense7probe (1)
rn34arnensecdf (1)
rn34arnenseprobe (1)
rn34arnensg (1)
rn34arnensg7cdf (1)
rn34arnensg7probe (1)
rn34arnensgcdf (1)
rn34arnensgprobe (1)
rn34arnenst (1)
rn34arnenst7cdf (1)
rn34arnenst7probe (1)
rn34arnenstcdf (1)
rn34arnenstprobe (1)
rn34arnentrezg (1)
rn34arnentrezg7cdf (1)
rn34arnentrezg7probe (1)
rn34arnentrezgcdf (1)
rn34arnentrezgprobe (1)
rn34arnrefseq (1)
rn34arnrefseq7cdf (1)
rn34arnrefseq7probe (1)
rn34arnrefseqcdf (1)
rn34arnrefseqprobe (1)
rn34arnug (1)
rn34arnug7cdf (1)
rn34arnug7probe (1)
rn34arnugcdf (1)
rn34arnugprobe (1)
RnAgilentDesign028282.db (19)
RNAi (1)
RNASeqPower (0)
rnaturalearth (1)
RnBeads (1)
RnBeads.hg19 (3)
RnBeads.hg38 (3)
RnBeads.mm10 (3)
RnBeads.mm9 (2)
RnBeads.rn5 (2)
rncl (1)
rnex10stv1rnense (1)
rnex10stv1rnense7cdf (1)
rnex10stv1rnense7probe (1)
rnex10stv1rnensecdf (1)
rnex10stv1rnenseprobe (1)
rnex10stv1rnensg (1)
rnex10stv1rnensg7cdf (1)
rnex10stv1rnensg7probe (1)
rnex10stv1rnensgcdf (1)
rnex10stv1rnensgprobe (1)
rnex10stv1rnenst (1)
rnex10stv1rnenst7cdf (1)
rnex10stv1rnenst7probe (1)
rnex10stv1rnenstcdf (1)
rnex10stv1rnenstprobe (1)
rnex10stv1rnentrezg (1)
rnex10stv1rnentrezg7cdf (1)
rnex10stv1rnentrezg7probe (1)
rnex10stv1rnentrezgcdf (1)
rnex10stv1rnentrezgprobe (1)
rnex10stv1rnrefseq (1)
rnex10stv1rnrefseq7cdf (1)
rnex10stv1rnrefseq7probe (1)
rnex10stv1rnrefseqcdf (1)
rnex10stv1rnrefseqprobe (1)
rnex10stv1rnug (1)
rnex10stv1rnug7cdf (1)
rnex10stv1rnug7probe (1)
rnex10stv1rnugcdf (1)
rnex10stv1rnugprobe (1)
RNeXML (1)
rngtools (1)
rngWELL (1)
rnohomology (1)
RNOmni (1)
rnu34 (1)
rnu34.db (15)
rnu34cdf (14)
rnu34probe (13)
Roberts2005Annotation (1)
Roberts2005Annotation.db (14)
robfilter (1)
RobinCar (1)
RobStatTM (1)
robumeta (1)
robust (5)
robustbase (13)
robustlmm (1)
RobustRankAggreg (0)
ROC (1)
ROCR (1)
RODBC (1)
ROI (1)
ROI.plugin.lpsolve (1)
roll (1)
rols (1)
Rook (1)
rootSolve (8)
ropls (1)
roptim (1)
ROracle (1)
rosettR (1)
rotl (1)
round (1)
roxygen2 (60)
rpact (1)
rpart (76)
rpart.plot (1)
RPEGLMEN (1)
RPEIF (1)
RPESE (1)
rpf (1)
RPMG (5)
RPostgres (14)
RPostgreSQL (1)
rprintf (1)
rprojroot (113)
RProtoBufLib (1)
rpsftm (1)
RPtests (1)
RPushbullet (1)
Rqc (1)
rr2 (1)
rrapply (1)
rrBLUP (1)
rrcov (9)
rredlist (1)
RRPP (1)
rsample (18)
Rsamtools (3)
RSclient (1)
rsconnect (69)
RSEIS (5)
RSelenium (1)
Rserve (7)
RSiena (1)
rslurm (1)
rsm (1)
Rsmlx (1)
Rsmlx.1 (0)
Rsmlx.2 (0)
RSNNS (0)
rsnps (1)
Rsolnp (3)
RSpectra (17)
RSQLite (126)
RsSimulx (1)
RsSimulx.1 (0)
rstan (9)
rstanarm (1)
rstantools (7)
rstatix (15)
rstpm2 (1)
rstudio (0)
rstudioapi (134)
Rsubread (0)
rsvd (8)
rsvg (2)
Rsymphony (1)
rta10probeset.db (14)
rta10transcriptcluster.db (14)
rtables (1)
rtdists (1)
rtf (1)
rticles (1)
rtkore (1)
rtracklayer (1)
Rtsne (11)
Rttf2pt1 (2)
rtu34 (1)
rtu34.db (15)
rtu34cdf (12)
rtu34probe (13)
rtweet (4)
Ruchardet (1)
rugarch (1)
RUnit (1)
runjags (1)
runonce (1)
Runuran (1)
ruv (0)
RUVseq (1)
RVAideMemoire (1)
Rvcg (1)
rvcheck (2)
RVenn (1)
rversions (59)
rvest (13)
rvg (1)
Rvmmin (1)
RVtests (1)
Rwave (5)
rwgcod (1)
rwgcod.db (13)
RWiener (1)
rworldmap (1)
RxODE (1)
rxode2 (1)
rxode2et (1)
rxode2ll (1)
rxode2parse (1)
rxode2random (1)
Ryacas (1)
rzmq (2)

S

s2 (52)
S4Arrays (1)
S4Vectors (9)
saemix (1)
safetyData (1)
safetyexploreR (1)
SAIGEgds (1)
sampleSelection (1)
sampling (1)
samr (5)
sandwich (4)
sas7bdat (1)
SASmixed (1)
sass (165)
satellite (1)
saureuscdf (13)
saureusprobe (14)
SBGNview.data (0)
sc.bacello.db (1)
sc.dbsubloc.db (1)
SC3 (0)
scagnostics (1)
ScaledMatrix (1)
scales (54)
scalreg (1)
scam (1)
scAnnotatR.models (12)
scater (1)
scatterD3 (1)
scattermore (30)
scatterpie (13)
scatterplot3d (51)
scClassify (1)
scclusteval (1)
sccore (1)
sccs (1)
scCustomize (1)
scda (1)
scda.2021 (1)
scda.2022 (1)
ScDblFinder (1)
scDblFinder (1)
scDC (1)
scehomology (1)
ScerevisiaeGenome.sacCer1 (1)
scGate (1)
scHOT (1)
scico (1)
scidb (1)
Scillus (1)
scistreer (5)
scLinear (1)
scMerge (1)
scop.db (1)
scoringRules (1)
SCP (1)
scPipe (0)
scran (1)
scRepertoire (1)
scrime (5)
scRNAseq (1)
scRNASeq.spatial (1)
scrypt (2)
scs (1)
sctransform (28)
scuttle (9)
scviewer (1)
sda (1)
SDMTools (1)
sdtmchecks (0)
secrets (1)
see (1)
segmented (5)
selectr (1)
semEff (1)
semTools (1)
sen2r (1)
sendmailR (2)
sensitivity (1)
sensobol (1)
SeqArray (1)
seqCAT (0)
seqinr (2)
seqLogo (1)
seqmagick (1)
seqminer (8)
seqnames.db (2)
sequenza (1)
SeqVarTools (0)
seriation (18)
servr (2)
sesame (1)
sesameData (1)
sessioninfo (49)
set6 (1)
setRNG (1)
sets (1)
settings (1)
seurat (1)
Seurat (41)
SeuratDisk (1)
SeuratObject (34)
SeuratWrappers (1)
sf (59)
sfheaders (5)
sfsmisc (2)
sftime (1)
sgeostat (1)
SGP (1)
shadowtext (2)
shape (3)
shapefiles (1)
shapes (1)
shapr (1)
SHDZ (1)
SHDZ.db (14)
SHELF (1)
shiny (143)
shiny.react (1)
shiny.router (1)
shinyAce (1)
shinyalert (1)
shinyauth (1)
shinyBS (9)
shinybusy (3)
shinycssloaders (1)
shinydashboard (2)
shinydashboardPlus (7)
shinydisconnect (1)
shinyEffects (1)
shinyfeedback (1)
shinyFeedback (1)
shinyFiles (11)
shinyglide (1)
shinyhelper (5)
ShinyItemAnalysis (24)
shinyjqui (1)
shinyjs (4)
shinyloadtest (1)
shinyLP (1)
shinymanager (2)
shinyMatrix (1)
shinyMethyl (1)
shinyMobile (0)
shinypanel (6)
shinyscreenshot (3)
shinySelect (0)
shinystan (1)
shinytest (2)
shinytest2 (2)
shinythemes (1)
shinytoastr (1)
shinyTree (2)
shinyvalidate (26)
shinyWidgets (44)
ShortRead (1)
showimage (1)
showtext (2)
showtextdb (1)
SIAMCAT (1)
SID (1)
SIFT.Hsapiens.dbSNP132 (62)
SIFT.Hsapiens.dbSNP137 (100)
sigaR (0)
sigclust (1)
Sigfried (1)
siggenes (0)
Signac (9)
signal (1)
silva128.1MgDb (2)
SimComp (1)
SimDesign (1)
simex (1)
SimInf (0)
simpar (1)
simplermarkdown (1)
simplifyEnrichment (1)
simputation (1)
simsurv (1)
SingleCellExperiment (9)
SingleCelLExperiment (0)
singleCellTK (1)
SingleR (1)
singscore (1)
sirnakit (1)
SIS (1)
siscreener (1)
sitePath (0)
sitmo (14)
sjlabelled (1)
sjmisc (1)
sjPlot (1)
sjstats (1)
SKAT (8)
SkewHyperbolic (1)
skewt (1)
skimr (1)
skmeans (1)
slackr (1)
slam (3)
slickR (0)
slider (17)
slingshot (1)
sloop (1)
sm (0)
smacof (1)
smcfcs (1)
sme (1)
smfishHmrf (1)
smldesign (1)
smooth (1)
smoothHR (0)
smotefamily (1)
SMVar (8)
sn (8)
sna (1)
snakecase (13)
SnapATAC (1)
snow (13)
SnowballC (2)
snowfall (1)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20071016 (1)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20080617 (1)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506 (2)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20100427 (2)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109 (7)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20110815 (2)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20111119 (1)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20120608 (6)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.GRCh37 (1)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP1.GRCh37 (1)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP14.GRCh37 (1)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38 (3)
snplocs.hsapiens.dbsnp141.grch38 (1)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP142.GRCh37 (7)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37 (699)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38 (464)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP149.GRCh38 (31)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP15.GRCh37 (1)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP150.GRCh38 (61)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP151.GRCh38 (14)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP155.GRCh37 (521)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP155.GRCh38 (392)
SNPRelate (1)
sodium (7)
softImpute (1)
soilDB (1)
solrium (1)
som (1)
SomaScan.db (5)
SomaVarDB (1)
SOMbrero (1)
sommer (1)
sortable (2)
sos (1)
SoupX (1)
sourcetools (51)
soybeancdf (38)
soybeanprobe (13)
sp (67)
spacefillr (1)
spacetime (1)
spacrt (1)
spam (3)
spam64 (1)
spaMM (1)
sparkline (1)
sparklyr (8)
SPARQL (1)
SparseArray (1)
sparsebn (1)
SparseGrid (1)
SparseM (2)
sparseMatrixStats (1)
sparsepca (1)
sparsesvd (14)
spatial (29)
SpatialCPie (1)
SpatialExperiment (1)
spatialreg (1)
spatstat (2)
spatstat.core (21)
spatstat.data (24)
spatstat.explore (12)
spatstat.geom (32)
spatstat.linnet (1)
spatstat.model (1)
spatstat.random (21)
spatstat.sparse (29)
spatstat.utils (29)
spd (1)
spData (12)
spdep (8)
spec (1)
spectacles (1)
speedglm (1)
SPEI (1)
spelling (1)
spgs (1)
SPIA (0)
SpidermiR (1)
splancs (5)
splatter (1)
splines (0)
splines2 (1)
splitTools (1)
spls (1)
splus2R (1)
spohomology (1)
spsComps (1)
sqldf (1)
SQUAREM (1)
ssanv (1)
sschomology (1)
ssh (1)
SSPA (0)
stabledist (1)
stabs (1)
StanHeaders (6)
stargazer (1)
stars (2)
starter (1)
startup (1)
statmod (14)
statnet (1)
statnet.common (2)
stats (0)
stats4 (0)
statsExpressions (1)
statTarget (1)
STdeconvolve (1)
stdmchecks (0)
stdReg (1)
stevedore (1)
sticky (1)
stinepack (1)
stopwords (1)
storr (1)
strex (1)
string (1)
stringdist (13)
stringfish (3)
stringi (109)
stringr (112)
striprtf (1)
strucchange (1)
structToolbox (1)
styler (38)
subplex (1)
subselect (1)
sugarcanecdf (12)
sugarcaneprobe (11)
SummarizedExperiment (2)
summarytools (1)
sunburstR (1)
superheat (1)
SuperLearner (1)
superpc (1)
SuppDists (1)
survcomp (1)
survey (1)
survival (112)
survivalROC (1)
survminer (1)
survMisc (2)
survPen (1)
survPresmooth (1)
susieR (14)
sva (1)
svd (1)
svDialogs (1)
svglite (16)
svGUI (1)
svMisc (0)
svUnit (1)
swagger (1)
Swiffer (1)
swirl (1)
sybil (1)
sybilGUROBI (1)
sybilSBML (1)
sylly (1)
sylly.en (1)
symengine (1)
symphony (1)
synapser (0)
synaptome.data (44)
synaptome.db (35)
synergyfinder (0)
syntenet (1)
sys (172)
sysfonts (1)
sysptm.db (1)
systemfit (1)
systemfonts (63)
syuzhet (1)

T

table1 (1)
tableHTML (1)
tableone (1)
tables (2)
taehomology (1)
TailRank (2)
tanggle (1)
tarchetypes (4)
targets (4)
targetscan.Hs.eg.db (93)
targetscan.Mm.eg.db (16)
taxize (1)
TCC (4)
TCGAbiolinks (1)
TCGAbiolinksGUI.data (1)
tcltk (0)
tcltk2 (1)
tclust (1)
TeachingDemos (1)
teal (1)
teal.modules.clinical (1)
teal.modules.general (1)
teal.widgets (1)
templater (0)
tensor (1)
tensorA (1)
tensorflow (13)
TENxPBMCData (1)
tergm (1)
tern (1)
terra (60)
tesseract (1)
test1cdf (13)
test2cdf (11)
test3cdf (13)
test3probe (12)
testit (1)
testthat (219)
texreg (1)
textshaping (39)
tfautograph (1)
TFBSTools (1)
tfdatasets (1)
TFisher (1)
TFMPvalue (7)
tfrmt (1)
tfruns (8)
tgp (1)
TH.data (3)
thematic (2)
themis (1)
this.path (1)
threejs (1)
ThresholdROC (1)
tibble (175)
tictoc (9)
tidybayes (1)
tidycensus (18)
tidyclust (1)
tidycmprsk (1)
tidygraph (7)
tidyjson (0)
tidylog (1)
tidymodels (6)
tidyposterior (1)
tidyr (49)
tidyrules (1)
tidyselect (38)
tidySEM (1)
tidyseurat (1)
tidySummarizedExperiment (1)
tidyterra (1)
tidytext (1)
tidytlg (1)
tidytree (27)
tidyTree (1)
tidyverse (13)
tidyvpc (1)
tidyxl (1)
tiff (1)
tigris (14)
tikzDevice (1)
timechange (4)
timeDate (11)
TimeProjection (1)
timereg (1)
timeSeries (2)
timetk (1)
tinkr (1)
tinysnapshot (1)
tinytest (1)
tinytex (179)
tippy (1)
tis (1)
titanic (1)
tkrplot (1)
tkWidgets (1)
tm (1)
tmap (1)
TMB (15)
tmle (1)
tmvnsim (1)
tmvtnorm (1)
TNO (1)
toastui (1)
tokenizers (1)
tokupika (1)
tolerance (1)
tomatocdf (12)
tomatoprobe (14)
tools (0)
toOrdinal (1)
topGO (1)
torch (1)
Tplyr (1)
tracee (1)
trackViewer (1)
tradeSeq (1)
TrajectoryUtils (1)
tram (1)
transformr (1)
transport (1)
tree (1)
treeio (9)
treemap (1)
treespace (1)
TreeSummarizedExperiment (1)
triangle (1)
triebeard (3)
trimcluster (0)
tripack (1)
trtf (1)
truncdist (1)
truncnorm (5)
truncreg (1)
TSCAN (1)
tseries (2)
tsfeatures (2)
tsModel (1)
tsne (1)
TSP (20)
ttdo (1)
TTR (1)
ttservice (1)
tufte (1)
tune (9)
twang (1)
twangContinuous (1)
tweedie (1)
tweenr (5)
twosamples (1)
TxDb.Athaliana.BioMart.plantsmart10 (1)
TxDb.Athaliana.BioMart.plantsmart12 (1)
TxDb.Athaliana.BioMart.plantsmart14 (1)
TxDb.Athaliana.BioMart.plantsmart16 (1)
TxDb.Athaliana.BioMart.plantsmart19 (1)
TxDb.Athaliana.BioMart.plantsmart21 (1)
TxDb.Athaliana.BioMart.plantsmart22 (144)
TxDb.Athaliana.BioMart.plantsmart25 (14)
TxDb.Athaliana.BioMart.plantsmart28 (57)
TxDb.Athaliana.BioMart.plantsmart51 (25)
TxDb.Btaurus.UCSC.bosTau8.refGene (14)
TxDb.Btaurus.UCSC.bosTau9.refGene (22)
TxDb.Celegans.UCSC.ce11.ensGene (108)
TxDb.Celegans.UCSC.ce11.refGene (37)
TxDb.Celegans.UCSC.ce6.ensGene (255)
TxDb.Cfamiliaris.UCSC.canFam3.refGene (17)
TxDb.Cfamiliaris.UCSC.canFam4.refGene (12)
TxDb.Cfamiliaris.UCSC.canFam5.refGene (10)
TxDb.Cfamiliaris.UCSC.canFam6.refGene (8)
TxDb.Dmelanogaster.UCSC.dm3.ensGene (482)
TxDb.Dmelanogaster.UCSC.dm6.ensGene (220)
txdb.dmelanogaster.ucsc.dm6.ensgene (1)
TxDb.Drerio.UCSC.danRer10.refGene (84)
TxDb.Drerio.UCSC.danRer11.refGene (27)
TxDb.Ggallus.UCSC.galGal4.refGene (14)
TxDb.Ggallus.UCSC.galGal5.refGene (31)
TxDb.Ggallus.UCSC.galGal6.refGene (17)
TxDb.Hsapiens.BioMart.igis (14)
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg18.knownGene (410)
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene (4515)
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.lincRNAsTranscripts (111)
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene (2396)
Txdb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene (1)
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.refGene (69)
TxDb.Mmulatta.UCSC.rheMac10.refGene (37)
TxDb.Mmulatta.UCSC.rheMac3.refGene (11)
TxDb.Mmulatta.UCSC.rheMac8.refGene (16)
TxDb.Mmusculus.BioMart.igis (0)
TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.ensGene (124)
TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.knownGene (1333)
TxDb.Mmusculus.UCSC.mm39.knownGene (41)
TxDb.Mmusculus.UCSC.mm39.refGene (87)
TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene (523)
TxDb.Ptroglodytes.UCSC.panTro4.refGene (13)
TxDb.Ptroglodytes.UCSC.panTro5.refGene (12)
TxDb.Ptroglodytes.UCSC.panTro6.refGene (12)
TxDb.Rnorvegicus.BioMart.igis (13)
TxDb.Rnorvegicus.UCSC.rn4.ensGene (269)
TxDb.Rnorvegicus.UCSC.rn5.refGene (117)
TxDb.Rnorvegicus.UCSC.rn6.ncbiRefSeq (13)
TxDb.Rnorvegicus.UCSC.rn6.refGene (78)
TxDb.Rnorvegicus.UCSC.rn7.refGene (50)
TxDb.Scerevisiae.UCSC.sacCer2.ensGene (1)
TxDb.Scerevisiae.UCSC.sacCer2.sgdGene (12)
TxDb.Scerevisiae.UCSC.sacCer3.sgdGene (86)
TxDb.Sscrofa.UCSC.susScr11.refGene (21)
TxDb.Sscrofa.UCSC.susScr3.refGene (13)
tximeta (1)
tximport (1)
tximportDat (1)
tximportData (1)
txtq (1)
tzdb (68)

U

u (0)
u133aaofav2cdf (17)
u133x3p (1)
u133x3p.db (23)
u133x3pcdf (18)
u133x3pprobe (14)
uatools (1)
UCell (1)
uchardet (1)
ucminf (1)
UCSCRepeatMasker (15)
udunits2 (1)
umap (8)
UniProtKeywords (18)
unitizer (1)
units (57)
universalmotif (0)
unmarked (1)
UpSetR (1)
urca (1)
urlchecker (1)
urltools (1)
useful (1)
usethis (76)
usmap (1)
usmapdata (1)
utf8 (162)
utils (0)
utilsRmd (1)
uuid (51)
uwot (37)

V

V8 (13)
validate (1)
valr (1)
VAM (0)
vaplot (1)
variables (1)
variancePartition (1)
VariantAnnotation (1)
varImp (1)
vars (1)
vaultr (1)
VBsparsePCA (1)
vcd (1)
vcfR (1)
vcr (1)
vctrs (235)
vdbR (1)
vdiffr (2)
vegan (3)
vegawidget (1)
vembedr (1)
vendormetadatahelpers (1)
venn (7)
VennDiagram (1)
venneuler (1)
VGAM (8)
VGAMextra (1)
vhydeg (1)
VIM (1)
VineCopula (1)
vioplot (1)
vip (1)
vipor (2)
viridis (82)
viridisLite (117)
viridislite (0)
visdat (1)
visNetwork (3)
visR (1)
vistime (13)
vitisviniferacdf (12)
vitisviniferaprobe (13)
vpc (1)
vroom (107)
vscDebugger (1)
vsn (1)
vvgrapevvtigr (1)
vvgrapevvtigr7cdf (1)
vvgrapevvtigr7probe (1)
vvgrapevvtigrcdf (1)
vvgrapevvtigrprobe (1)
vvihomology (1)

W

waddR (0)
waffle (1)
waiter (7)
wakefield (1)
waldo (123)
warp (3)
wdm (1)
wdman (1)
webchem (1)
webdriver (1)
webfakes (1)
WebGestaltR (1)
webmockr (1)
webp (1)
webshot (24)
webshot2 (1)
websocket (1)
webutils (1)
WeightIt (1)
weights (2)
WES.1KG.WUGSC (1)
wesanderson (1)
WGCNA (8)
WGScan (1)
wheatcdf (16)
wheatmap (1)
wheatprobe (13)
whereami (1)
whisker (79)
whitening (1)
whoami (1)
widgetTools (1)
WikidataQueryServiceR (1)
WikidataR (1)
WikipediR (1)
wikitaxa (1)
wildmeta (1)
winboxr (1)
withr (123)
wk (71)
wordcloud (1)
wordcloud2 (1)
workflowr (1)
workflows (8)
workflowsets (5)
worm.db0 (12)
worrms (1)
wrapr (1)
Wrench (1)
writexl (2)
WriteXLS (1)
WRS2 (1)

X

xaringan (1)
xaringanExtra (1)
xaringanthemer (1)
xbioc (1)
xcms (1)
xenopus.db0 (12)
xenopuslaevis (1)
xenopuslaeviscdf (11)
xenopuslaevisprobe (13)
xfun (240)
xgboost (15)
xgxr (1)
xlaevis.db (16)
xlaevis2cdf (12)
xlaevis2probe (13)
xlahomology (1)
XLConnect (1)
xlsx (1)
xlsxjars (1)
XML (67)
xml2 (164)
xmlparsedata (1)
xopen (1)
xpose (1)
xpose.nlmixr2 (1)
xpose4 (1)
xrf (1)
xslt (1)
xtable (2)
XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38 (2)
XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37 (93)
XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38 (120)
xtrhomology (1)
xtropicaliscdf (11)
xtropicalisprobe (12)
xts (4)
XVector (1)
XVectorb (0)

Y

yaImpute (1)
yaml (118)
yardstick (9)
ye6100subacdf (11)
ye6100subbcdf (13)
ye6100subccdf (12)
ye6100subdcdf (12)
YEAST (1)
yeast.db0 (14)
yeast2 (1)
yeast2.db (40)
yeast2cdf (16)
yeast2probe (13)
ygs98 (1)
ygs98.db (30)
ygs98cdf (15)
ygs98frmavecs (11)
ygs98probe (13)
ylab.utils (1)
ymlthis (0)
yspec (1)
yulab.utils (27)

Z

zCompositions (7)
zeallot (1)
zebrafish (1)
zebrafish.db (20)
zebrafish.db0 (21)
zebrafishcdf (18)
zebrafishprobe (14)
zen4R (1)
zinbwave (1)
zip (101)
Ziploc (1)
zlibbioc (2)
zmahomology (1)
zoo (35)