############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### chmod a+r fluentGenomics -R && F:\biocbuild\bbs-3.19-bioc\R\bin\R.exe CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data fluentGenomics ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file 'fluentGenomics/DESCRIPTION' ... OK * preparing 'fluentGenomics': * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building 'fluentGenomics.Rmd' using rmarkdown Quitting from lines 191-195 [tximeta-run] (fluentGenomics.Rmd) Error: processing vignette 'fluentGenomics.Rmd' failed with diagnostics: Corrupt Cache: index file See AnnotationHub's TroubleshootingTheHubs vignette section on corrupt cache cache: F:\biocbuild\AnnotationHub_cache filename: annotationhub.index.rds --- failed re-building 'fluentGenomics.Rmd' SUMMARY: processing the following file failed: 'fluentGenomics.Rmd' Error: Vignette re-building failed. Execution halted