############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### chmod a+r scmeth -R && F:\biocbuild\bbs-3.19-bioc\R\bin\R.exe CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data scmeth ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file 'scmeth/DESCRIPTION' ... OK * preparing 'scmeth': * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building 'my-vignette.Rmd' using rmarkdown Quitting from lines 167-170 [unnamed-chunk-8] (my-vignette.Rmd) Error: processing vignette 'my-vignette.Rmd' failed with diagnostics: Corrupt Cache: index file See AnnotationHub's TroubleshootingTheHubs vignette section on corrupt cache cache: F:\biocbuild\AnnotationHub_cache filename: annotationhub.index.rds --- failed re-building 'my-vignette.Rmd' SUMMARY: processing the following file failed: 'my-vignette.Rmd' Error: Vignette re-building failed. Execution halted