############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/R/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data podkat ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘podkat/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘podkat’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * cleaning src * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘podkat.Rnw’ using knitr Quitting from lines 1531-1544 [UnmaskedRegionsSexHg38] (podkat.Rnw) Error: processing vignette 'podkat.Rnw' failed with diagnostics: there is no package called 'BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38.masked' --- failed re-building ‘podkat.Rnw’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘podkat.Rnw’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted