############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### chmod a+r igvShiny -R && F:\biocbuild\bbs-3.20-bioc\R\bin\R.exe CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data igvShiny ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file 'igvShiny/DESCRIPTION' ... OK * preparing 'igvShiny': * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building 'igvShiny.Rmd' using rmarkdown Quitting from lines 103-138 [unnamed-chunk-8] (igvShiny.Rmd) Error: processing vignette 'igvShiny.Rmd' failed with diagnostics: exists.function(fasta) is not TRUE --- failed re-building 'igvShiny.Rmd' SUMMARY: processing the following file failed: 'igvShiny.Rmd' Error: Vignette re-building failed. Execution halted