############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/R/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data funOmics ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘funOmics/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘funOmics’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘funomics_vignette.Rmd’ using rmarkdown Quitting from lines 296-301 [unnamed-chunk-30] (funomics_vignette.Rmd) Error: processing vignette 'funomics_vignette.Rmd' failed with diagnostics: error in evaluating the argument 'X' in selecting a method for function 'sapply': cannot open the connection to 'https://data.broadinstitute.org/gsea-msigdb/msigdb/release/7.5/c5.go.cc.v7.5.entrez.gmt' --- failed re-building ‘funomics_vignette.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘funomics_vignette.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted