############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/R/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data transformGamPoi ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘transformGamPoi/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘transformGamPoi’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * cleaning src * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘transformGamPoi.Rmd’ using rmarkdown Quitting from lines 65-74 [unnamed-chunk-3] (transformGamPoi.Rmd) Error: processing vignette 'transformGamPoi.Rmd' failed with diagnostics: error in evaluating the argument 'i' in selecting a method for function '[': Failed to find a rowMeans2() method for SVT_SparseMatrix objects. --- failed re-building ‘transformGamPoi.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘transformGamPoi.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted