############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/R/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data fishpond ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘fishpond/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘fishpond’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘allelic.Rmd’ using rmarkdown Quitting from lines 136-142 [unnamed-chunk-3] (allelic.Rmd) Error: processing vignette 'allelic.Rmd' failed with diagnostics: there is no package called 'EnsDb.Hsapiens.v86' --- failed re-building ‘allelic.Rmd’ --- re-building ‘swish.Rmd’ using rmarkdown --- finished re-building ‘swish.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘allelic.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted