############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data scds ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘scds/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘scds’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘scds.Rmd’ using rmarkdown Quitting from lines 53-63 (scds.Rmd) Error: processing vignette 'scds.Rmd' failed with diagnostics: there is no package called 'scater' --- failed re-building ‘scds.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘scds.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted