############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data cellbaseR ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘cellbaseR/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘cellbaseR’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘cellbaseR.Rmd’ using rmarkdown Loading required package: Gviz Warning in library(package, lib.loc = lib.loc, character.only = TRUE, logical.return = TRUE, : there is no package called 'Gviz' Quitting from lines 153-163 (cellbaseR.Rmd) Error: processing vignette 'cellbaseR.Rmd' failed with diagnostics: there is no package called 'VariantAnnotation' --- failed re-building ‘cellbaseR.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘cellbaseR.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted