############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/bbs-3.14-bioc/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data ndexr ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘ndexr/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘ndexr’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... OK Warning: ‘inst/doc’ files ‘ndexr-vignette.Rmd’, ‘ndexr-vignette.html’, ‘ndexr-vignette.R’ ignored as vignettes have been rebuilt. Run R CMD build with --no-build-vignettes to prevent rebuilding. * excluding invalid files Subdirectory 'R' contains invalid file names: ‘ndex_api_config.yml’ * checking for LF line-endings in source and make files and shell scripts * checking for empty or unneeded directories WARNING: Removing directory ‘ndexr/Meta’ which should only occur in an installed package * building ‘ndexr_1.16.0.tar.gz’