############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### chmod a+r GIGSEA -R && C:\Users\biocbuild\bbs-3.14-bioc\R\bin\R.exe CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data GIGSEA ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file 'GIGSEA/DESCRIPTION' ... OK * preparing 'GIGSEA': * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building 'GIGSEA_tutorial.Rmd' using rmarkdown Quitting from lines 262-299 (GIGSEA_tutorial.Rmd) Error: processing vignette 'GIGSEA_tutorial.Rmd' failed with diagnostics: cannot open the connection --- failed re-building 'GIGSEA_tutorial.Rmd' SUMMARY: processing the following file failed: 'GIGSEA_tutorial.Rmd' Error: Vignette re-building failed. Execution halted