############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### chmod a+r CopyNumberPlots -R && C:\Users\biocbuild\bbs-3.13-bioc\R\bin\R.exe CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data CopyNumberPlots ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file 'CopyNumberPlots/DESCRIPTION' ... OK * preparing 'CopyNumberPlots': * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building 'CopyNumberPlots.Rmd' using rmarkdown Quitting from lines 93-109 (CopyNumberPlots.Rmd) Error: processing vignette 'CopyNumberPlots.Rmd' failed with diagnostics: attempt to use zero-length variable name --- failed re-building 'CopyNumberPlots.Rmd' SUMMARY: processing the following file failed: 'CopyNumberPlots.Rmd' Error: Vignette re-building failed. Execution halted